16S/18S/ITS全長(zhǎng)測(cè)序
16S/18S/ITS全長(zhǎng)測(cè)序是指通過(guò)提取樣品中微生物的DNA,使用通用引物擴(kuò)增微生物的16S rDNA、18S rDNA或ITS區(qū)域全長(zhǎng),然后對(duì)其進(jìn)行測(cè)序的過(guò)程。16S/18S/ITS全長(zhǎng)測(cè)序可用于微生物多樣性的檢測(cè)。
16S rDNA存在于所有細(xì)菌基因組,能體現(xiàn)不同菌屬之間的差異,目前被廣泛用于病原菌的檢測(cè)和鑒定。16S rDNA全長(zhǎng)測(cè)序可用于分析細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)多樣性。18S rDNA為編碼真核生物核糖體小亞基rRNA的DNA序列,在結(jié)構(gòu)上分為保守區(qū)和高變區(qū),保守區(qū)反映生物物種間的親緣關(guān)系,高變區(qū)反映物種間的差異,對(duì)其進(jìn)行全長(zhǎng)測(cè)序可用于分析真核微生物的群落結(jié)構(gòu)。ITS是真核生物中18S rDNA和28S rDNA轉(zhuǎn)錄間隔序列,ITS全長(zhǎng)測(cè)序可用于真菌群落結(jié)構(gòu)分析。
16S /18S/ITS全長(zhǎng)測(cè)序流程

數(shù)據(jù)分析流程

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