覆蓋噬菌體——交替假單胞菌噬菌體PM2
? ? ? ?今天介紹的病毒是覆蓋噬菌體家族(Corticovirus)的交替假單胞菌噬菌體(Pseudoalteromonas Virus PM2)。這種病毒主要感染海洋細(xì)菌交替假單胞菌,此外還與腺病毒是近親。
簡介


? ? ? ?覆蓋噬菌體(Corticovirus)是覆蓋噬菌體科(Corticovirus)的一個屬。覆蓋噬菌體(Corticovirus)這個名字來源于拉丁語cortex, corticis(意思是“外殼”或“樹皮”)。
? ? ? ? 1968年,從智利海岸的海水樣本中分離出交替假單胞菌噬菌體PM2。與交替假單胞菌噬菌體PM2密切相關(guān)的噬菌體在水生細(xì)菌基因組中大量存在,提示覆蓋噬菌體的生態(tài)重要性可能被低估。
病毒學(xué)特征


? ? ? ? 交替假單胞菌噬菌體PM2由直徑60 nm的圓形無包膜二十面體衣殼和位于內(nèi)外蛋白殼之間的內(nèi)脂膜組成。衣殼由三層組成,其表面呈現(xiàn)出一種具有獨特特征的圖案,包括從12個頂點突出的灌木狀尖刺。
? ? ? ? 二十面體衣殼呈T = 21對稱,由1200個P1(尖刺)和60個P2(衣殼)蛋白組成。五聚體受體結(jié)合尖刺從12個五重軸中突出。衣殼包含一個包含結(jié)構(gòu)蛋白P3到P10的內(nèi)部脂質(zhì)核。
病毒基因組

? ? ? ? 交替假單胞菌噬菌體PM2的基因組不分段,占病毒重量的13%,包含一個環(huán)狀超螺旋雙鏈DNA分子,長度為10079bp,基因組GC含量為43%,編碼24種蛋白質(zhì)。
? ? ? ? ?病毒的轉(zhuǎn)錄分為早期轉(zhuǎn)錄與晚期轉(zhuǎn)錄。早期轉(zhuǎn)錄操縱子(Operon E/OE)可進(jìn)行雙向轉(zhuǎn)錄(OEL與OER),晚期操縱子(Operon L)只能進(jìn)行單向轉(zhuǎn)錄。
? ? ? ? 交替假單胞菌噬菌體PM2基因組的復(fù)制是通過滾環(huán)機制,由編碼核酸內(nèi)切酶P12的病毒啟動的。
病毒生活史

? ? ? ? 病毒的復(fù)制主要在細(xì)胞質(zhì),進(jìn)入宿主細(xì)胞是通過吸附到宿主細(xì)胞表面,然后病毒膜與宿主細(xì)胞的外膜融合,隨后基因組傳遞到細(xì)胞內(nèi)部,DNA模板進(jìn)行轉(zhuǎn)錄。早期轉(zhuǎn)錄為病毒的DNA復(fù)制打下基礎(chǔ),晚期轉(zhuǎn)錄為病毒的組裝創(chuàng)造環(huán)境。
? ? ? ?交替假單胞菌噬菌體PM2是一種裂解性病毒,在感染周期結(jié)束時使用一種獨特的裂解系統(tǒng)破壞宿主細(xì)胞,該系統(tǒng)由噬菌體編碼蛋白P17和P18以及一種未識別的宿主自溶素組成。