GULP中的任務(wù)

GULP模塊允許您對3D周期性固體、氣相團簇、晶體表面和大塊材料中的孤立缺陷進行計算。GULP目前可以執(zhí)行以下任務(wù)：

l?單點能量計算

l?幾何優(yōu)化

l?分子動力學(xué)

l?力場擬合

l?表面計算

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可以設(shè)置單點能量、幾何優(yōu)化和動力學(xué)計算，以便生成特定的化學(xué)和物理性質(zhì)。

運行GULP計算涉及許多步驟，這些步驟可以分組如下：結(jié)構(gòu)定義：必須指定包含感興趣系統(tǒng)的3D Atomistic文檔。

有多種方法可以準備結(jié)構(gòu)：可以使用“材料可視化工具”中的工具構(gòu)建結(jié)構(gòu)，用于構(gòu)建晶體、表面和單壁納米管?？梢允褂谩安馁|(zhì)可視化工具”繪制工具修改現(xiàn)有結(jié)構(gòu)?？梢詮默F(xiàn)有結(jié)構(gòu)文件導(dǎo)入結(jié)構(gòu)。對于trajection.xtd文檔，將對當(dāng)前可見幀執(zhí)行計算。

在力場擬合計算的情況下，可以使用一個以上的輸入結(jié)構(gòu)。

計算設(shè)置：一旦定義了一個或多個合適的三維結(jié)構(gòu)文檔，就需要選擇要執(zhí)行的計算類型并設(shè)置相關(guān)參數(shù)。例如，在幾何優(yōu)化計算的情況下，這些參數(shù)包括系統(tǒng)上的外部壓力。最后，應(yīng)該選擇要在其上運行計算的服務(wù)器并啟動作業(yè)。

結(jié)果分析：計算完成后，與該作業(yè)相關(guān)的文件將返回到客戶端，并在適當(dāng)?shù)那闆r下顯示在項目資源管理器中。GULP分析對話框上的工具可用于可視化計算結(jié)果。

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選擇GULP任務(wù)

1.從菜單欄中選擇Modules|GULP|Calculation以顯示GULP Calculation對話框。

2.選擇“設(shè)置”選項卡。

3.從任務(wù)下拉列表中選擇所需的GULP任務(wù)。

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GULP能量任務(wù)

GULP能量任務(wù)允許您計算指定系統(tǒng)的總能量以及各種物理性質(zhì)。除了總能量外，在計算結(jié)束時還報告了原子上的力。

能量任務(wù)對于準確的結(jié)構(gòu)可以進行總能量以及分析體系性質(zhì)。

注：雖然GULP可以為任何結(jié)構(gòu)計算晶格性質(zhì)，但只有幾何優(yōu)化后的結(jié)構(gòu)分析才能獲得有意義的結(jié)果。

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執(zhí)行能量計算

1.導(dǎo)入預(yù)先準備好的結(jié)構(gòu)，或者使用MS編輯器直接構(gòu)建新的3D結(jié)構(gòu)。

2.從菜單欄中選擇Modules | GULP | Calculation（模塊|GULP |計算）以顯示GULP Calculation對話框。

3.如果您希望生成一個新的或修訂的力場用于計算，則應(yīng)在繼續(xù)下一步之前進行力場擬合。

4.選擇“GULP計算”對話框上的“設(shè)置”選項卡，然后從“任務(wù)”下拉列表中選擇“能量”。

5.從力場下拉列表中選擇要用于計算的合適力場庫。如果要檢查力場庫中參數(shù)化的勢函數(shù)，請單擊“查看…”...

按鈕以顯示列表。如果要從當(dāng)前項目或本地和網(wǎng)絡(luò)位置導(dǎo)入力場庫，請選擇“瀏覽…”...從“力場”下拉列表中，顯示“選擇GULP力場”對話框，然后導(dǎo)航到并選擇所需的GULP力字段庫文件（.lib）。

6.選擇“性質(zhì)”選項卡。如果希望在GULP運行過程中計算系統(tǒng)的任何其他性質(zhì)，請選中列表中的相應(yīng)復(fù)選框。

7.選擇作業(yè)控制選項卡，然后從網(wǎng)關(guān)位置下拉列表中選擇要在其上運行GULP作業(yè)的服務(wù)器。如有必要，請指定作業(yè)將提交到的隊列。GULP將根據(jù)包含正在研究的系統(tǒng)的3D結(jié)構(gòu)文檔的名稱自動為作業(yè)指定一個名稱。如果要指定替代名稱，請取消選中“自動”復(fù)選框，然后在“任務(wù)描述”文本框中輸入新名稱。

8.在“并行運行”字段中指定要在其上運行作業(yè)的內(nèi)核數(shù)。

9.點擊更多...按鈕顯示GULP作業(yè)控制選項對話框。選擇要用于實時更新的文檔，并設(shè)置GULP在作業(yè)完成時的行為。

10.單擊Run（運行）按鈕。

11.如果您愿意，您可以檢查中間結(jié)果，以確保計算參數(shù)是合理的。

12.作業(yè)完成后，查看輸出文件。然后您可以分析結(jié)果。