想要Get信號(hào)通路的要點(diǎn),有這篇就夠了!
信號(hào)通路是基礎(chǔ)科研的精粹所在,而掌握信號(hào)通路浩瀚數(shù)據(jù)的鑰匙就是KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)。KEGG——京都基因與基因組百科全書(shū),是日本京都Kanehisa Laboratories根據(jù)文獻(xiàn)證據(jù)手工整理的一個(gè)龐大數(shù)據(jù)庫(kù)(包括信號(hào)通路、基因、疾病、藥物等等)。
KEGG有別于其他數(shù)據(jù)庫(kù)的一個(gè)顯著特點(diǎn)就是具有強(qiáng)大的圖形功能,它利用直觀圖形而不是繁縟的文字來(lái)介紹眾多的代謝途徑以及各途徑之間的關(guān)系,簡(jiǎn)單明了。但初見(jiàn)KEGG也不是這么好用的,因?yàn)槿毡救饲迤娴哪X回路,很(sang)貼(xin)心(bin)的(kuang)在網(wǎng)站里放了16個(gè)子數(shù)據(jù)庫(kù)。

大多數(shù)人看到這里就嚇懵了,但其實(shí)根本不用方,一般醫(yī)學(xué)科研人員要用的功能很簡(jiǎn)單。也就是……
1) 根據(jù)疾病或者表型找相關(guān)通路
2) 根據(jù)確定的分子查詢(xún)相關(guān)通路
3) 根據(jù)差異分子列表構(gòu)建通路網(wǎng)絡(luò)
疾病 & 通路


單分子 & 通路


一組分子 & 通路

通路解讀 & 分析
以上內(nèi)容大家按需取用,找到通路后,課里還講了對(duì)于找到通路后怎么看,通路里的數(shù)據(jù)要怎么分析。真正的包教包會(huì),一條龍服務(wù)。


學(xué)完上面這些就結(jié)束了?too na?ve,解螺旋的風(fēng)格一向是加量不加價(jià),除了KEGG外,還講怎么從GEO找數(shù)據(jù),一菜雙吃,喂飽為止。

領(lǐng)取KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)教程方式
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