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Materials Studio 2021新版本發(fā)布|達(dá)索系統(tǒng)

2021-08-24 16:34 作者:達(dá)索系統(tǒng)百世慧  | 我要投稿


Materials Studio 2021增加一系列面向產(chǎn)品研發(fā)的新功能,進(jìn)一步擴(kuò)展了在熱門研究領(lǐng)域的應(yīng)用能力,包括在新功能材料和能源材料方面。


Materials Studio 新功能

  • 新模塊FlexTS,F(xiàn)lexTS為DMol3和DFTB+提供了在勢能面上找到固定點(diǎn)的任務(wù)功能,使計算反應(yīng)路徑和與化學(xué)反應(yīng)相關(guān)的能壘成為可能。

  • Materials Studio Collection基于Pipeline Pilot新增的系列protocols,采用PhaseField計算硬質(zhì)材料的硬化和晶粒生長。用戶可在Materials Studio的Pipeline Pilot Connector中訪問Metal Alloy文件夾,并使用上述protocols。Materials Studio提供兩個相關(guān)案例,介紹上述protocols使用方法。

  • Forcite和Mesocite計算中可使用GPU加速,同時可提交GPU任務(wù)到任何支持的排隊系統(tǒng)中。

Materials Studio 各模塊增強(qiáng)功能

1、Cantera

  • Cantera升級到2.4.0版本,Python升級到3.8.1。

2、CASTEP

  • 在CASTEP的彈性常數(shù)計算結(jié)果中加入了Niu等(2019)的材料斷裂韌度估算經(jīng)驗(yàn)?zāi)P停A(yù)測脆性材料性質(zhì)。

  • CASTEP現(xiàn)可計算孤立分子的溶劑化能。

  • 在CASTEP中實(shí)現(xiàn)了二次諧波產(chǎn)生系數(shù)張量的計算,有助于開發(fā)非線性光學(xué)材料。

  • CASTEP中增加了自發(fā)極化的Berry phase計算方法。

  • CASTEP中的自旋軌道耦合計算現(xiàn)已擴(kuò)展到:

  1. 動態(tài)產(chǎn)生的norm-conserving贗勢。

  2. 光學(xué)性質(zhì)計算。

  3. 支持使用非局域交換關(guān)聯(lián)泛函。

  4. 在Materials Visualizer中設(shè)置非共線自旋構(gòu)型。

3、COMPASS

  • COMPASSIII支持與鋰離子電池相關(guān)的硼化物,例如雙(草酸)硼酸鹽、二氟(草酸)硼酸鹽和吡啶三氟化硼的計算。

  • COMPASS (2.8)與cvff_nocross_nomorse力場遷到FORCEFIELDS-LEGACY文件夾。這個文件夾中的力場可以從Forcite Forcefield管理器對話框中導(dǎo)入。COMPASSII已被刪除。使用COMPASS或COMPASSII的項(xiàng)目會自動定向到當(dāng)前版本的COMPASSIII。

4、DFTB+

  • 新的FlexTS功能通過新的Minimum Energy Path任務(wù)項(xiàng)添加到DFTB+中。FlexTS是用于構(gòu)建最小能量路徑的工具,包括NEB方法。

5、DMol3

  • 通過新的Minimum Energy Path任務(wù)項(xiàng)在DMol3中增加FlexTS功能。FlexTS是用于構(gòu)建最小能量路徑的工具,包括NEB方法。

  • 在DMol3的彈性常數(shù)計算結(jié)果中加入了Niu等(2019)的脆性材料斷裂韌度估計經(jīng)驗(yàn)?zāi)P汀?/p>

  • DMol3分子動力學(xué)現(xiàn)可以使用XSD文件的當(dāng)前速度作為初始速度。

6、Forcite

  • 在Materials Studio forcefields中添加了對Urey-Bradley相互作用和CHARMM反轉(zhuǎn)的支持。

  • 為Materials Studio forcefields添加了新的van der Waals函數(shù)形式LJ_12_6_14,允許為1-4相互作用指定不同的R0和D0值。

  • 可以從Forcite力場管理器導(dǎo)入增強(qiáng)版的cvff力場--cvff_aug。

7、GULP

  • GULP升級到6.0版本。周期體系的剛性分子模型支持幾何優(yōu)化、性質(zhì)和聲子計算。

  • 新增ReaxFF庫--“ReaxFF SEI”。它基于Hossain等的研究報道(J. Chem. Phys., 152, 184301(2020)),旨在描述鋰電池電解液和固體電解質(zhì)界面。

8、ONETEP

  • 在ONETEP中實(shí)現(xiàn)了一系列的雜化泛函。

  • ONETEP隱式溶劑計算擴(kuò)展到Poisson-Boltzmann方法,把電解質(zhì)離子作為點(diǎn)電荷,忽略它們之間的相互作用,但影響溶質(zhì)的篩選。

  • ONETEP模塊已更新為使用該代碼的學(xué)術(shù)版本6.1.1。

Materials Visualizer 的增強(qiáng)

  • 所有的.msi格式的示例結(jié)構(gòu)都已轉(zhuǎn)換為.xsd格式。

  • 通過MSC將研究表格和軌跡文件作為單個壓縮文件從Materials Studio傳輸?shù)絇ipeline Pilot。

  • 所有基于forcefield的模塊添加了一個ReportAutomaticTerms設(shè)置,用于打開或關(guān)閉使用自動詳細(xì)信息報告功能。

Materials Script 的增強(qiáng)

  • MaterialsScript支持在Forcite和Mesocite計算中使用GPU加速。

  • MaterialsScript使用的Perl版本已在MaterialsStudio 2021中更新。Perl的更新版本提供了各種新特性,但也對Perl腳本和模塊的語法提出了額外的要求。這些附加要求適用于所有新的MaterialsScript腳本。

  • 在Materials Studio客戶端運(yùn)行的Materials Script使用Perl 5.26.1版本。

  • 有關(guān)Materials Studio 2021中Perl更改的更多信息,詳見 https://perldoc.perl.org/5.30.0/perldelta.html

  • 對現(xiàn)有MaterialsScript的更改信息,詳見Modified Perl requirements(新版本客戶端中的文件)。

Materials Studio基礎(chǔ)功能的改進(jìn)

  • 在所有支持的平臺上,Materials Studio Gateway中部署的Apache版本已升級到2.4.46

  • Mozilla XPCOM軟件庫已經(jīng)從Materials Studio中移除。

BIOVIA License Pack的增強(qiáng)

License Pack現(xiàn)在使用FlexLM 11.16。許可證服務(wù)器中的License Pack必須是局域網(wǎng)中的最高版本。確保將License Pack更新到此版本,以保證客戶端許可證的核驗(yàn)。BIOVIA License Pack的Linux安裝位置相比2018年及之前版本有所改變,現(xiàn)默認(rèn)位置為BIOVIA_LicensePack文件夾。在Linux上安裝License Pack 7.6.14或更早版本的BIOVIA License Pack將不再執(zhí)行先前版本的原位置升級。如果需要繼續(xù)使用以前的許可證,則需要執(zhí)行一些附加的安裝步驟。有關(guān)詳細(xì)信息,請參閱新版本中License Pack Online Help。

教程

新添加了以下教程:

  • Calculating the Minimum Energy Path of a molecular switch: 介紹了FlexTS結(jié)合DMol3和DFTB+來計算和細(xì)化一個多步的反應(yīng)路徑。

  • PhaseField simulation of grain growth using Pipeline Pilot: 演示如何在Materials Studio運(yùn)行Pipeline Pilot的Materials Studio Collection中的Grain Growth(PhaseField)protocol-晶粒生長protocols。

  • PhaseField simulation of solidification using Pipeline Pilot: 演示如何在Pipeline Pilot的Materials Studio Collection中運(yùn)行Solidification(PhaseField)protocol-硬化協(xié)議。

下列教程已更新為使用COMPASSIII立場:

?Adsorption Locator:

  1. 基于AdsorptionLocator確定SO2在Ni(111)表面的吸附位置

  2. 模擬抑制劑在顏料紅晶體表面上的吸附

?CCDC: 在Materials Studio中使用CSD

?Forcite:限制或非限制對稱約束條件下尿素的幾何優(yōu)化

?Forcite Plus:

  1. 運(yùn)行受限剪切模擬

  2. 計算丙酸在正辛醇中的溶劑化自由能

  3. 搜索表面上分子的低能構(gòu)型

  4. 聚合物與金屬氧化物表面的相互作用

?Morphology:

  1. 顏料紅的形態(tài)預(yù)測

  2. 使用Crystal Graph預(yù)測形態(tài)

?QSAR: 設(shè)計新的緩蝕劑

?Reflex:基于能量的精修

?Reflex Plus:

  1. Structure solution in the presence of preferred orientation and energetic considerations in structure refinement

  2. Structure solution of 3-chloro-trans-cinnamic acid with Reflex Plus

?Scripting:使用腳本計算兩層之間的相互作用能

?Sorption:吸附法預(yù)測沸石MFI中CH4的吸附

同時更新以下教程:

?Calculating barriers of simple chemical reactions using DMol3's LST/QST and NEB tools: The title of the tutorial has been updated, it was previously "Exploring the minimum energy path of chemical reactions using DMol3's LST/QST and NEB tools".

?為幫助運(yùn)行以下Pipeline Pilot Connector教程而提供的示例文件也已更新:

  1. Cross-linking polymers using Pipeline Pilot

  2. Calculating the stress-strain diagram using Pipeline Pilot

  3. Calculating the glass transition temperature using Pipeline Pilot

平臺支持

有關(guān)Materials Studio系統(tǒng)要求的完整詳細(xì)信息,請參見System Requirements and Recommendations(新版本客戶端中文件)。

支持平臺添加

? 服務(wù)器端增加了對以下配置的支持:

  1. Red Hat Enterprise Linux 8.1與8.2

  2. CentOS 8.1與8.2

? 排隊系統(tǒng)新增以下支持:

  1. Slurm Workload Manager 20.02.x

  2. 為64位Linux和Windows端添加了單GPU計算支持:

  3. CUDA版本10.1、Compute Capability 6.0或更高的NVIDIA卡

刪除平臺支持

  • 服務(wù)器端停止支持:Windows Server 2012 R2

  • 排隊系統(tǒng)停止支持:Slurm Workload Manager 18

  • 瀏覽器停止支持:Internet Explorer 11

了解更多關(guān)于 Materials Studio 的信息,請訪問:

www.abestway.cn

咨詢熱線:400-990-9223


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