? ? ?? 在介紹冠狀病毒之前，我們需要對冠狀病毒的非結(jié)構(gòu)蛋白——1A與1AB進行一次全析。因為，冠狀病毒的非結(jié)構(gòu)蛋白，對它們來說非常重要。

? ? ? ? 冠狀病毒非結(jié)構(gòu)蛋白有兩種：1A與1AB。其中，1AB是由移碼閱讀元件，在1A的ORF末端產(chǎn)生-1移碼閱讀，連接1B的ORF進行翻譯。

? ? ? ?冠狀病毒復合蛋白1AB是一種多功能蛋白：它包含反義RNA、先導RNA、亞基因組mRNA和子代病毒粒子RNA轉(zhuǎn)錄所需的活性，以及負責將多蛋白裂解為功能性產(chǎn)物的蛋白酶。

? ? ? ?冠狀病毒復合蛋白1A與1AB形成轉(zhuǎn)錄-復制復合體，參與冠狀病毒的轉(zhuǎn)錄與復制過程。

首先，我們分析1A蛋白

非結(jié)構(gòu)蛋白1(Nsp1):

? ? ? ? Nsp1是宿主翻譯抑制因子，通過與40S核糖體亞基相互作用抑制宿主翻譯。Nsp1-40S核糖體復合物進一步誘導宿主mRNA 5'UTR附近的內(nèi)核裂解，靶向它們進行降解。由于5'端前導序列的存在，病毒mRNA不受Nsp1介導的內(nèi)核溶解RNA裂解的影響，因此免受降解。Nsp1通過抑制宿主基因表達，促進病毒基因在感染細胞中的高效表達，逃避宿主免疫反應。

非結(jié)構(gòu)蛋白2(Nsp2):

? ? ? ? 可能通過與寄主PHB和PHB2相互作用調(diào)控寄主細胞存活信號通路。事實上，這兩種蛋白質(zhì)在維持線粒體功能完整性和保護細胞免受各種壓力方面發(fā)揮著作用。

木瓜蛋白酶樣蛋白酶(Nsp3/PL-PRO):

? ? ? ? 負責位于復合蛋白N端的裂解。此外，PL-PRO具有泛素化或去泛素化活性，可處理來自細胞底物的' lys48 '-和' lys63 '連接的多泛素鏈。與Nsp4一起參與病毒誘導的病毒復制所需的細胞質(zhì)雙膜囊泡的組裝。通過阻斷宿主IRF3的磷酸化、二聚化和隨后的核轉(zhuǎn)位，拮抗I型干擾素的先天免疫誘導。阻止也承載NF-kappa-B信號。

非結(jié)構(gòu)蛋白4(Nsp4):

? ? ? ? 參與病毒誘導的病毒復制所需的細胞質(zhì)雙膜囊泡的組裝。

3C樣蛋白酶(Nsp5/3CL):

? ? ? ? 在11個位點上切割復合蛋白的C端，識別包含核心序列[ILMVF]-Q-[SGACN]的底物。也能夠結(jié)合二磷酸腺苷-核糖-1''-磷酸(ADRP)。

非結(jié)構(gòu)蛋白6(Nsp6):

? ? ? ? 在宿主內(nèi)質(zhì)網(wǎng)誘導自噬小體的初始過程中起作用。隨后，這些吞噬體的擴張受到限制，不再能夠?qū)⒉《境煞謧鬟f給溶酶體。

非結(jié)構(gòu)蛋白7(Nsp7):

? ? ? ? 與Nsp8(每個蛋白8個亞基)形成一個可以作為引物參與病毒復制的16聚體，可以合成比寡核苷酸引物長得多的引物。

非結(jié)構(gòu)蛋白8(Nsp8):

? ? ? ?與Nsp7(每個蛋白8個亞基)形成一個可以作為引物參與病毒復制的16聚體，可以合成比寡核苷酸引物長得多的引物。

非結(jié)構(gòu)蛋白9(Nsp9):

? ? ? ?可能通過作為ssRNA結(jié)合蛋白參與病毒復制。

非結(jié)構(gòu)蛋白10(Nsp10):

? ? ? ?通過刺激Nsp14(3'-5'核糖核酸外切酶)和Nsp16(2'-O-甲基轉(zhuǎn)移酶)活性，在病毒轉(zhuǎn)錄中發(fā)揮關(guān)鍵作用。因此在病毒mRNA帽甲基化中起重要作用。

非結(jié)構(gòu)蛋白11(Nsp11):

? ? ? ?該蛋白參與病毒RNA的合成。

接下來分析的是1AB蛋白

非結(jié)構(gòu)蛋白1(Nsp1):

? ? ? ?Nsp1是宿主翻譯抑制因子，通過與40S核糖體亞基相互作用抑制宿主翻譯。Nsp1-40S核糖體復合物進一步誘導宿主mRNA 5'UTR附近的內(nèi)核裂解，靶向它們進行降解。由于5'端前導序列的存在，病毒mRNA不受Nsp1介導的內(nèi)核溶解RNA裂解的影響，因此免受降解。Nsp1通過抑制宿主基因表達，促進病毒基因在感染細胞中的高效表達，逃避宿主免疫反應。

非結(jié)構(gòu)蛋白2(Nsp2):

? ? ? ? 可能通過與寄主PHB和PHB2相互作用調(diào)控寄主細胞存活信號通路。事實上，這兩種蛋白質(zhì)在維持線粒體功能完整性和保護細胞免受各種壓力方面發(fā)揮著作用。

木瓜蛋白酶樣蛋白酶(Nsp3/PL-PRO):

? ? ? ?負責位于復合蛋白N端的裂解。此外，PL-PRO具有泛素化或去泛素化活性，可處理來自細胞底物的' lys48 '-和' lys63 '連接的多泛素鏈。與Nsp4一起參與病毒誘導的病毒復制所需的細胞質(zhì)雙膜囊泡的組裝。通過阻斷宿主IRF3的磷酸化、二聚化和隨后的核轉(zhuǎn)位，拮抗I型干擾素的先天免疫誘導。阻止也承載NF-kappa-B信號。

非結(jié)構(gòu)蛋白4(Nsp4):

? ? ? ? 參與病毒誘導的病毒復制所需的細胞質(zhì)雙膜囊泡的組裝。

3C樣蛋白酶(Nsp5/3CL):

? ? ? ? 在11個位點上切割復合蛋白的C端，識別包含核心序列[ILMVF]-Q-[SGACN]的底物。也能夠結(jié)合二磷酸腺苷-核糖-1''-磷酸(ADRP)。

非結(jié)構(gòu)蛋白6(Nsp6):

? ? ? ?在宿主內(nèi)質(zhì)網(wǎng)誘導自噬小體的初始過程中起作用。隨后，這些吞噬體的擴張受到限制，不再能夠?qū)⒉《境煞謧鬟f給溶酶體。

非結(jié)構(gòu)性蛋白7(Nsp7):

? ? ? ? 與Nsp8(每個蛋白8個亞基)形成一個可以作為引物參與病毒復制的16聚體，可以合成比寡核苷酸引物長得多的引物。

非結(jié)構(gòu)性蛋白8(Nsp8):

? ? ? ? 與Nsp7(每個蛋白8個亞基)形成一個可以作為引物參與病毒復制的16聚體，可以合成比寡核苷酸引物長得多的引物。

非結(jié)構(gòu)性蛋白9(Nsp9):

? ? ? ?可能通過作為ssRNA結(jié)合蛋白參與病毒復制。

非結(jié)構(gòu)性蛋白10(Nsp10):

? ? ? ? 通過刺激Nsp14(3'-5'核糖核酸外切酶)和Nsp16(2'-O-甲基轉(zhuǎn)移酶)活性，在病毒轉(zhuǎn)錄中發(fā)揮關(guān)鍵作用。因此在病毒mRNA帽甲基化中起重要作用。

RNA聚合酶(Nsp12/RdRP):

? ? ? ?負責病毒RNA基因組的復制和轉(zhuǎn)錄。

解旋酶(Nsp13):

? ? ? N端具有鋅指結(jié)構(gòu)域的多功能蛋白，具有5'到3'極性的RNA和DNA雙旋解活性。解旋酶的活性依賴于二價鎂離子。

鳥嘌呤-N-7-甲基轉(zhuǎn)移酶/3'-5'核糖核酸外切酶(Nsp14/ExoN):

? ? ?? 該蛋白具有兩種不同的活性——3'到5'方向上對ssRNA和dsRNA起作用的核糖核酸外切酶活性和N-7-鳥嘌呤甲基轉(zhuǎn)移酶活性。

尿苷酸特異性核糖核酸內(nèi)切酶(Nsp15):

? ? ? ? 在病毒轉(zhuǎn)錄/復制中發(fā)揮作用，阻止宿主細胞dsRNA傳感器的同時激活，如MDA5/IFIH1, OAS和PKR。

? ? ? ? 通過降解病毒基因組和亞基因組RNA的poly(A)區(qū)域復制過程中產(chǎn)生的5'-多尿苷。催化兩步反應，首先通過2'-O酯交換反應生成2'3'-環(huán)磷酸(2'3'-cP)，然后水解成3'-磷酸(3'-P)。

? ? ? ?如果不降解，poly(U)RNA將與poly(A)RNA尾部雜交并激活宿主dsRNA傳感器。

2'-O-甲基轉(zhuǎn)移酶(Nsp16):

? ? ? ? 介導mRNA帽2'-O-核糖甲基化到病毒mRNA的5'-帽結(jié)構(gòu)的甲基轉(zhuǎn)移酶。N-7-甲基鳥苷帽是與Nsp16結(jié)合的先決條件。因此，在病毒mRNA帽甲基化中起著重要作用，這是逃避免疫系統(tǒng)所必需的。