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干貨!一篇文章了解全部空間代謝組學(xué)內(nèi)容

2022-07-21 10:21 作者:上海歐易生物  | 我要投稿

?空間代謝組在解吸電噴霧電離質(zhì)譜成像(DESI-MSI)技術(shù)上進(jìn)一步升級(jí),形成了空氣動(dòng)力輔助離子化解吸電噴霧電離質(zhì)譜成像(AFAI-MSI)技術(shù)。利用空氣流與傳輸管對(duì)帶電液滴進(jìn)行遠(yuǎn)距離傳輸,傳輸管中的帶電液滴在高速氣流和電壓的作用下進(jìn)一步脫溶劑、富集、離子化,繼而提高檢測靈敏度,同時(shí)擴(kuò)展了待測樣品的空間和操作靈活性,不僅適用于單一組織樣本,也適合于大體積樣品的遠(yuǎn)距離離子采集和成像分析。


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圖 | AFADESI-MSI空間代謝組技術(shù)原理圖


技術(shù)流程

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1)在電噴霧毛細(xì)管噴嘴上施加一定高電壓,噴霧溶劑從霧化器的內(nèi)套管中流出,由外套管中噴出的高壓氮?dú)庋杆賹婌F溶劑霧化形成帶電噴霧液滴

2)噴出的高速帶電液滴轟擊待測樣品表面,在溶劑萃取作用下樣品同時(shí)被解吸與電離

3)含有被測樣品的帶電液滴迅速發(fā)生去溶劑化作用,從質(zhì)譜分析器的采集錐孔進(jìn)入分析器并被檢測

4)樣品固定在承載平臺(tái),連續(xù)或脈沖移動(dòng)承載平臺(tái)對(duì)樣品進(jìn)行二維掃描

5)同時(shí)質(zhì)譜儀記錄質(zhì)譜信號(hào)強(qiáng)度獲得樣品表面的分子及其含量

6)這些信息通過質(zhì)譜圖像分析軟件轉(zhuǎn)換后,即可獲得選擇離子或離子群的二維空間強(qiáng)度分布圖




技術(shù)優(yōu)勢(shì)

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1.高靈敏度:靈敏度可達(dá)pg級(jí)別


圖 |?含量為pg級(jí)的硫苷脂類代謝物在大鼠腦的成像圖



2.寬動(dòng)態(tài)范圍:數(shù)量級(jí)103


圖 | 甘油磷脂酰膽堿在大鼠腎組織不同區(qū)域呈3個(gè)數(shù)量級(jí)梯度差異



3.高覆蓋度:涵蓋多種類型小分子代謝物


膽堿類、多胺類、氨基酸類、肉堿類、核苷類、核苷酸類、有機(jī)酸類、碳水化合物類、膽固醇類、膽酸類、脂質(zhì)類等多種類代謝物


4.高特異性


高分辨分析器+強(qiáng)分辨力軟件

實(shí)現(xiàn)m/z?相近代謝物的準(zhǔn)確識(shí)別

Δm/z =0.001

圖 | 大鼠腎臟中m/z相近代謝物的空間成像


5.高異質(zhì)性


實(shí)現(xiàn)組織結(jié)構(gòu)和功能

代謝物的識(shí)別與特征分布

圖 | 人食管癌組織中代謝物的高異質(zhì)性空間分布


鹿明優(yōu)勢(shì)


1.項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)

小鼠/大鼠:腦、腎、心、肝、脾、脊髓、垂體、胰腺、皮膚、整只小鼠/大鼠

腫瘤組織:食管癌、甲狀腺癌、肺癌、乳腺癌、胃癌、腦膠質(zhì)瘤、鼻咽癌、皮膚癌、肝癌

植物組織:根、種子


2.硬件支持

自有AFAI-MSI

Thermo QE 高分辨質(zhì)譜

空間分辨率(100um*100um、20um*20um)+高質(zhì)量分辨率:儀器持續(xù)升級(jí)


3.發(fā)明專利

3項(xiàng)授權(quán)發(fā)明專利、1項(xiàng)軟件著作權(quán)(如下)

  • 敞開式噴霧場解吸離子化方法及離子化裝置,發(fā)明專利,授權(quán)號(hào):ZL 2007 1 0303649.0

  • ?質(zhì)譜成像平臺(tái)裝置及其控制方法,發(fā)明專利,授權(quán)號(hào) :ZL 2012 1 0055424.9

  • 一種離子源溫控加熱裝置,發(fā)明專利,授權(quán)號(hào):ZL 2012 1 0348043.X

  • ?一種用于生物組織質(zhì)譜成像的離子傳輸裝置,實(shí)用新型專利,授權(quán)號(hào) :ZL 201520580709.3

4.數(shù)據(jù)庫支持

LM空間代謝組學(xué)自建數(shù)據(jù)庫:SmetDB、SmetPB

SmetDB針對(duì)人和動(dòng)物,目前含4000+物質(zhì),涵蓋氨基酸、脂質(zhì)、核苷酸、碳水化合物、維生素和輔助因子、激素等物質(zhì);

SmetPB目前針對(duì)植物,含有6000+物質(zhì),涵蓋生物堿類、酚酸類、黃酮類、香豆素類、苯丙素類、木脂素、萜類等10大類代謝物;


5.軟件支持

基于大數(shù)據(jù)與人工智能的MassImager質(zhì)譜成像處理軟件


6.服務(wù)支持

學(xué)術(shù)支持:賀玖明教授,國內(nèi)早期開發(fā)空間代謝組學(xué)方法的科學(xué)家之一

PNAS、Theranostics、Advanced Science、AC等雜志發(fā)表文章10余篇(見參考文獻(xiàn))



技術(shù)流程

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應(yīng)用領(lǐng)域


醫(yī)學(xué)領(lǐng)域

1.疾病分子機(jī)制,如阿爾茨海默癥、抑郁、腦缺血、糖尿病、心血管疾病等

2.生殖發(fā)育學(xué),如胚胎、器官發(fā)育過程中代謝調(diào)控和代謝表型等

3.腫瘤代謝與腫瘤免疫,如腫瘤代謝微環(huán)境與腫瘤免疫逃逸等

4.腫瘤分子病理診斷、分子分期/分型、生物標(biāo)志物篩選等

5.腫瘤耐藥與用藥研究等

6.環(huán)境毒理學(xué),如環(huán)境污染物的體內(nèi)毒性效應(yīng)和分子機(jī)制等

7.新藥藥理和毒理,如藥物的空間分布和體內(nèi)效應(yīng)和分子機(jī)制等


農(nóng)林牧漁領(lǐng)域


1.發(fā)育學(xué),如種子、胚胎、器官發(fā)育過程中的空間代謝調(diào)控等

2.分子機(jī)制,如鹽脅迫、病毒/真菌侵染、光合作用等機(jī)制研究

3.基因調(diào)控機(jī)制,如轉(zhuǎn)基因、基因沉默、基因敲除后代謝物變化的機(jī)制研究,了解基因與代謝物之間的精確關(guān)系等

4.植物與環(huán)境互作研究,如昆蟲選擇性侵害植物部位、土壤與根部互作研究等

5.植物藥用成分定位


樣本準(zhǔn)備指南


1.樣本類型

未經(jīng)過福爾馬林浸泡、HE染色,熒光標(biāo)記等處理的新鮮組織樣本。

5mm*2mm~2cm*4cm,大至整只大鼠/小鼠(15cm*10cm)。常規(guī)樣本大小為1cm3左右。


2.送樣準(zhǔn)備

1)實(shí)驗(yàn)前準(zhǔn)備

預(yù)冷生理鹽水

50mL離心管中

封口膜或保鮮膜、錫箔紙、干冰、液氮、濾紙片、鑷子、記號(hào)筆等;

2)樣本處理流程

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3.送樣流程

干冰寄送時(shí),將樣本盒埋沒于干冰中,保證其上下都有干冰覆蓋;?

干冰的量根據(jù)每天4公斤來計(jì)算,使用厚實(shí)(2cm以上厚度)的泡沫箱寄送。


4.送樣注意事項(xiàng)

在允許的條件下,建議多準(zhǔn)備一份樣品作為備用;

樣本質(zhì)量是影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果的最關(guān)鍵因素,因此在采集、制備、貯存、運(yùn)輸過程中應(yīng)盡可能地做到迅速,最大限度的縮短樣本從采集到實(shí)驗(yàn)的時(shí)間。


儀器設(shè)備


歡迎百度搜索鹿明生物——訪問鹿明生物官網(wǎng)——了解多組學(xué),空間代謝組學(xué)技術(shù)

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