31篇腫瘤領(lǐng)域單細(xì)胞測序文章盤點(diǎn)之頭頸腫瘤和泌尿系統(tǒng)腫瘤領(lǐng)域
截至2022年8月,單細(xì)胞在腫瘤領(lǐng)域合作的研究碩果累累,助力發(fā)表31篇腫瘤領(lǐng)域單細(xì)胞文章,平均IF達(dá)12.62。
之前,生殖系統(tǒng)和神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤的合集意猶未盡,這一次來看看頭頸腫瘤和泌尿系統(tǒng)腫瘤的文獻(xiàn)合集吧~
頭頸癌:
單細(xì)胞RNA測序剖析原發(fā)性和復(fù)發(fā)性鼻咽癌微環(huán)境的異質(zhì)性
Dissecting the heterogeneity of the microenvironment in primary and recurrent nasopharyngeal carcinomas using single-cell RNA sequencing
發(fā)表期刊:OncoImmunology
影響因子:7.723
材料:4例原發(fā)性鼻咽癌和2例復(fù)發(fā)性鼻咽癌
文章概述:鼻咽癌(NPC)10-15%的復(fù)發(fā)率,目前沒有長期的治療方案。研究分析了原發(fā)性鼻咽癌和復(fù)發(fā)性鼻咽癌(rNPC)免疫細(xì)胞和腫瘤細(xì)胞的異質(zhì)性。該研究有助于設(shè)計(jì)有效的抗癌治療,特別是免疫治療方案。研究為揭示rNPC免疫微環(huán)境提供了重要線索,有助于推進(jìn)rNPC的靶向免疫治療。
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析揭示視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤腫瘤內(nèi)異質(zhì)性和惡性進(jìn)展
Single-cell transcriptome profiling reveals intratumoural heterogeneity and malignant progression in retinoblastoma
發(fā)表期刊:Cell Death & Disease
影響因子:9.685
材料:兩個(gè)視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤樣本
文章概述:視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤是一種兒童視網(wǎng)膜腫瘤,是最常見的原發(fā)性惡性眼內(nèi)腫瘤。該研究揭示了多種腫瘤相關(guān)通路的細(xì)胞組分以及UBE2C與腫瘤惡性進(jìn)展的激活態(tài)相關(guān),為人類視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤早期進(jìn)展的關(guān)鍵階段提供了一個(gè)潛在的“開關(guān)基因”標(biāo)記。該研究提高了目前對視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤進(jìn)展機(jī)制的理解,并提供了一種視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤新的預(yù)后標(biāo)志。
轉(zhuǎn)錄因子c-Maf控制小鼠和人的差異代謝需求決定先天γδT17的功能
Differential metabolic requirement governed by transcription factor c-Maf dictates innate γδT17 effector functionality in mice and humans
發(fā)表期刊:Science Advances
影響因子:14.957
材料:兩例配對的口腔癌和癌旁組織
文章概述:細(xì)胞代謝可以調(diào)控γδ T細(xì)胞的功能,但潛在的分子機(jī)制仍不清楚。研究發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)錄因子c-Maf通過直接調(diào)控IDH2啟動子活性來調(diào)控γδT17的功能。γδ T細(xì)胞中c-Maf的缺失降低了轉(zhuǎn)移性肺癌的發(fā)展,提示c-Maf可能是癌癥免疫治療的一個(gè)潛在靶點(diǎn)。此外,c-Maf也控制外周血和口腔癌中的人γδ T細(xì)胞中IL-17的產(chǎn)生。研究表明,轉(zhuǎn)錄因子c-Maf通過IDH2介導(dǎo)的代謝重編程在調(diào)節(jié)γδT17效應(yīng)功能中發(fā)揮了關(guān)鍵作用。
泌尿系統(tǒng)腫瘤:
單細(xì)胞RNA測序強(qiáng)調(diào)炎性腫瘤相關(guān)的成纖維細(xì)胞在膀胱尿路上皮癌中的作用
Single-cell RNA sequencing highlights the role of in?ammatory cancer-associated ?broblasts in bladder urothelial carcinoma
發(fā)表期刊:Nature Communications
影響因子:17.694
材料:8例膀胱癌腫瘤樣本(2例低級別和6例高級別)和3例配對癌旁樣本
文章概述:膀胱癌是世界上最常見的泌尿生殖系統(tǒng)惡性疾病之一,每年約有430,000新診斷病例和超過165,000的死亡病例。該研究發(fā)現(xiàn)腫瘤細(xì)胞低表達(dá)MHC-II類分子,揭示下調(diào)腫瘤細(xì)胞中免疫原性的功能可能有助于形成一個(gè)免疫抑制的微環(huán)境。髓系亞群LAMP3+ DC可能通過CCL17和CCL22通訊作用關(guān)系招募Treg細(xì)胞,參與形成免疫抑制微環(huán)境。此外,本文重點(diǎn)探討了iCAFs的炎性作用,發(fā)現(xiàn)iCAFs與臨床預(yù)后和腫瘤生長增殖等密切相關(guān)。以上結(jié)果闡明了iCAFs的作用機(jī)理,對膀胱癌的治療提供了新見解。
5mC調(diào)控子分子亞型系統(tǒng),描繪膀胱癌微環(huán)境特征并指導(dǎo)精準(zhǔn)醫(yī)療
5mC regulator-mediated molecular subtypes depict the hallmarks of the tumor microenvironment and guide precision medicine in bladder cancer
發(fā)表期刊:BMC Medicine
影響因子:11.150
材料:1例BLCA根治樣本(肌浸潤性,高級別)和1個(gè)公開的BLCA單細(xì)胞數(shù)據(jù)集(GSE145137)
文章概述:膀胱癌(BLCA)是最常見的泌尿系統(tǒng)惡性腫瘤之一,BLCA的腫瘤微環(huán)境具有明顯的異質(zhì)性。盡管在免疫檢查點(diǎn)阻斷、新輔助化療和靶向治療方面取得了可喜的進(jìn)展,但晚期BLCA預(yù)后仍然很差。本研究整合了湘雅隊(duì)列和多個(gè)外部BLCA隊(duì)列,開發(fā)了一種新的基于5-甲基胞嘧啶(5-Methylcytosine,5mC)調(diào)節(jié)子介導(dǎo)的分子亞型系統(tǒng),并采用5mC評分作為定量評價(jià)指標(biāo)。確定了兩個(gè)5mC clusters,其評分可準(zhǔn)確預(yù)測經(jīng)典分子亞型、免疫表型、預(yù)后和多種治療方案的療效。
單細(xì)胞多組學(xué)分析揭示腎透明細(xì)胞癌的調(diào)控程序
Single-cell multiomics analysis reveals regulatory programs in clear cell renal cell carcinoma
發(fā)表期刊:Cell Discovery
影響因子:38.079
材料:三名腎透明細(xì)胞癌患者進(jìn)行了配對的scRNA-seq和scATAC-seq,另外一名患者單獨(dú)的scRNA-seq
文章概述:腎透明細(xì)胞癌(ccRCC)是腎細(xì)胞癌最常見和最具侵襲性的類型。該研究應(yīng)用單細(xì)胞RNA測序和單細(xì)胞轉(zhuǎn)座酶可及染色質(zhì)測序揭示ccRCC的轉(zhuǎn)錄組和表觀基因組特征。研究確定了由四個(gè)關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子(HOXC5,VENTX,ISL1和OTP)介導(dǎo)的腫瘤特異性調(diào)控程序,這些轉(zhuǎn)錄組因子在癌癥基因組圖譜(TCGA)數(shù)據(jù)庫中具有預(yù)后意義。該研究深入了解了腫瘤異質(zhì)性和潛在的調(diào)節(jié)因素,有利于未來選擇更有效的臨床治療策略。
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(單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組、單細(xì)胞測序、空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué))
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