「青蓮聚焦」“肽”有用,碼了碼了
「青蓮聚焦」“肽”有用,碼了碼了
近日,一篇發(fā)表在國(guó)際雜志The Lancet Healthy Longevity上題為“Urinary peptidomic profiles to address age-related disabilities: a prospective population study”的研究報(bào)告中,來(lái)自比利時(shí)哈塞爾特大學(xué)、魯汶大學(xué)格拉斯哥大學(xué)等機(jī)構(gòu)的科學(xué)家們通過(guò)對(duì)來(lái)自FLEMENGHO隊(duì)列的數(shù)據(jù)進(jìn)行的一項(xiàng)前瞻性研究,通過(guò)測(cè)定和驗(yàn)證尿肽組譜(UPP)中預(yù)測(cè)因子,揭示了人群機(jī)體與年齡相關(guān)的慢性疾病潛在的靶向分子途徑。

文章研究思路

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結(jié)果速遞
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? ? ? ?研究人員統(tǒng)計(jì)了長(zhǎng)達(dá)34年(1985-2019)的隨訪,對(duì)隨訪數(shù)據(jù)進(jìn)行了時(shí)移內(nèi)部驗(yàn)證和同步內(nèi)部驗(yàn)證研究。
? ? ? ?在產(chǎn)生的數(shù)據(jù)庫(kù)中UPP包含21560個(gè)肽。在4080個(gè)測(cè)序肽中,67個(gè)親本蛋白肽在70%以上的參與者中具有可檢測(cè)信號(hào),并用于進(jìn)一步分析。
? ? ? ?對(duì)性別、平均動(dòng)脈壓、體重指數(shù)、血糖、γ-谷氨酰轉(zhuǎn)移酶、吸煙狀況、總膽固醇與高密度脂蛋白血清膽固醇比率和eGFR進(jìn)行調(diào)整,并通過(guò)錯(cuò)誤發(fā)現(xiàn)率校正顯著性,按時(shí)間順序排列的年齡與210個(gè)序列肽相關(guān),識(shí)別出39個(gè)親代蛋白。對(duì)于排名靠前的肽,并且通過(guò)驗(yàn)證,其中85%(33個(gè))年齡與源自同一蛋白的多個(gè)尿肽片段的相關(guān)性上都是相似的。

圖1?整體分析策略
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? ? ? 這項(xiàng)研究產(chǎn)生并驗(yàn)證了一種穩(wěn)定且可重復(fù)的尿肽組生物標(biāo)記物,該標(biāo)記物反映了普通人群、患有慢性年齡相關(guān)疾?。ㄈ缣悄虿』蚵阅I?。┑幕颊咭约盎加屑毙圆《靖腥镜幕颊邚慕】道匣D(zhuǎn)變?yōu)椴唤】道匣纳鼩v程。

圖2 ?FLEMENGHO隊(duì)列推導(dǎo)、與時(shí)移和同步數(shù)據(jù)集表現(xiàn)出高度一致性
小結(jié)
? ? ? 雖然研究數(shù)據(jù)具有一定的局限性,比如說(shuō)研究對(duì)象FLEMENGHO隊(duì)列在長(zhǎng)期的隨訪過(guò)程中由于參與者年齡的增長(zhǎng)、年輕人的流動(dòng)性、源生家庭因素以及男女性生理構(gòu)造等客觀因素的影響,但是其反映的衰老與UPP信號(hào)的特異性和可重復(fù)性仍然具有臨床適用性。UPP衰老時(shí)鐘可能把解決當(dāng)前衰老和年齡相關(guān)疾病的重點(diǎn)從治療轉(zhuǎn)移到預(yù)防上來(lái),從抑制膠原合成的藥物轉(zhuǎn)移到促進(jìn)纖維化解決的藥物,這為當(dāng)前醫(yī)療對(duì)于治療衰老及其相關(guān)疾病提供一個(gè)有力說(shuō)明。
? ??青蓮百奧可提供一站式蛋白質(zhì)組學(xué)、代謝組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、多組學(xué)聯(lián)合分析等科研服務(wù)。青蓮百奧在生物活性肽檢測(cè)項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)豐富,界內(nèi)最全的Bioactive Database、NeuroPedia Database,專(zhuān)業(yè)分析軟件Peaks、Spectronaut,海歸坐鎮(zhèn)生信分析團(tuán)隊(duì),助您在科研道路上乘風(fēng)破浪,沖擊高水平文章。
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