蛋白質是由氨基酸脫水縮合形成的生物大分子，不同的蛋白質之間氨基酸組成、數(shù)目、排列方式、高級空間結構以及翻譯后修飾方式等都不盡相同，導致其分子質量和生物學功能也不相同。蛋白質定性就是回答“這個蛋白是什么”的問題，即對蛋白質的種類和性質進行鑒定，是蛋白質組學研究中的首要問題。要判斷一個蛋白質是什么，可以從其分子質量、氨基酸組成和排列順序以及翻譯后修飾情況等方面來描述。進行蛋白質定性鑒定主要就包括對其相對分子質量、氨基酸序列以及翻譯后修飾情況等參數(shù)進行鑒定，目前能同時對這三種參數(shù)進行鑒定的技術非質譜技術莫屬。