你一直沒學(xué)會(huì)的科研技能——GO分析和Pathway分析
解螺旋
當(dāng)通過測(cè)序或者生信數(shù)據(jù)庫(kù)獲取差異基因后，go和pathway分析就是不必可少的步驟。通過GO富集分析可以找到富集差異基因的GO類條目，尋找不同樣品的差異基因可能和哪些基因功能的改變有關(guān)。Pathway分析可以找到富集差異基因的Pathway條目，尋找不同樣品的差異基因可能與哪些細(xì)胞通路的改變有關(guān)。（文末查看領(lǐng)取方式）
1 、單基因GO和Pathway分析
一般lncRNA下游間接功能機(jī)制研究會(huì)通過敲減或過表達(dá)lncRNA后，再以高通量手段檢測(cè)下游編碼蛋白R(shí)NA水平表達(dá)變化，設(shè)定閾值后則表達(dá)差異變化2倍或以上的分子可定為候選分子。
而對(duì)候選分子進(jìn)行分析最常采用的方法是GO分析和Pathway分析。本節(jié)課程主要介紹單基因GO和pathway分析常用工具，并手把手傳授其使用方法。
GO分析的網(wǎng)站其實(shí)有很多，但是主要的網(wǎng)站有NCBI、Ensembl、AmiGo以及GoA。視頻中以DUSP6為例，詳細(xì)演示了各個(gè)網(wǎng)站的操作方式，方便學(xué)員們即學(xué)即會(huì)。
AmiGO2的搜索界面及GO分析結(jié)果：
GOA的搜索界面以及搜索結(jié)果：
至于單基因的Pathway分析，我們有基礎(chǔ)的KEGG入門訓(xùn)練營(yíng)（點(diǎn)擊即可報(bào)名），課程就不再贅述，而是聚焦Reactome網(wǎng)站，并詳細(xì)介紹該網(wǎng)站的使用方法。
多基因GO和Pathway分析
當(dāng)候選分子數(shù)量龐大時(shí)，單基因GO和pathway分析顯得效率不足。此時(shí)多基因GO和pathway分析顯得尤為重要。
課程仍以DUSP6為例，詳細(xì)介紹PANTHER、GOC、DAVID和Gorilla這4個(gè)生物信息學(xué)網(wǎng)站對(duì)lncRNA下游信號(hào)通路和網(wǎng)絡(luò)的預(yù)測(cè)分析。
3 、資源領(lǐng)取方式
①轉(zhuǎn)發(fā)本條動(dòng)態(tài)到朋友圈
②報(bào)名免費(fèi)訓(xùn)練營(yíng)，營(yíng)內(nèi)學(xué)習(xí)領(lǐng)取? ? 報(bào)名戳：??
