蛋白質(zhì)的分離和鑒定是蛋白質(zhì)組學研究中的重要內(nèi)容，蛋白質(zhì)分離是獲得蛋白樣本的重要來源，蛋白鑒定即對蛋白質(zhì)進行定性或定量等鑒定，兩者通常是前后相繼進行的。

理想的蛋白質(zhì)分離方法首先要具備超高的分辨率，能夠?qū)⒊汕先f種蛋白質(zhì)包括他們的修飾物同時分離并與后續(xù)的鑒定技術(shù)有效銜接，還應(yīng)對不同類型的蛋白質(zhì)，包括酸性的、堿性的、疏水的、親水的等，均能有效的分離。常用的蛋白質(zhì)分離技術(shù)包括電泳技術(shù)（一維電泳、雙向電泳、熒光差異顯示凝膠電泳和毛細管電泳等）和色譜分離技術(shù)（液相色譜、離子交換色譜、親和色譜、反相色譜、尺寸排阻色譜等）。分離后的蛋白質(zhì)樣本可以進行后續(xù)鑒定，如分子質(zhì)量、氨基酸序列含量以及翻譯后修飾鑒定等，目前最常用的蛋白質(zhì)鑒定技術(shù)是高分辨率、高靈敏度和高準確度的質(zhì)譜技術(shù)?？傊鞍踪|(zhì)的分離和鑒定技術(shù)各不相同，蛋白質(zhì)分離技術(shù)在實