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拓端tecdat|R語言混合正態(tài)分布極大似然估計和EM算法

2021-06-30 23:27 作者:拓端tecdat  | 我要投稿

原文鏈接:http://tecdat.cn/?p=18794

原文出處:拓端數(shù)據(jù)部落公眾號

為了在統(tǒng)計過程中發(fā)現(xiàn)更多有趣的結(jié)果,我們將解決極大似然估計沒有簡單分析表達(dá)式的情況。舉例來說,如果我們混合了各種分布,

作為說明,我們可以使用樣例數(shù)據(jù)


  1. > X=height

第一步是編寫混合分布的對數(shù)似然函數(shù)

  1. > logL=function(theta){

  2. + p=theta[1]

  3. + m1=theta[2]

  4. + s1=theta[3]

  5. + m2=theta[4]

  6. + s2=theta[5]

  7. + logL=-sum(log(p*dnorm(X,m1,s1)+(1-p)*dnorm(X,m2,s2)))

  8. + return(logL)

  9. + }

極大似然性的最簡單函數(shù)如下(從一組初始參數(shù)開始,只是為了獲得梯度下降的起點)

  1. > optim(c(.5,160,1,180,1 ,logL ?> ?theta=opt$par)

  2. [1] 0.5987635 165.2547700 5.9410993 178.4856961 6.3547038

因為我們可以通過使用約束優(yōu)化算法來做到“更好”,例如,概率一定在0到1之間。

為了可視化估計的密度,我們使用

  1. > hist(X,col="light green probability=TRUE)

  2. > lines(density(X )

另一個解決方案是使用EM算法。我們將從參數(shù)的初始值開始,并比較屬于每個類的機(jī)會


  1. > p=p1/(p1+p2)

從屬于每個類別的這些概率中,我們將估算兩個正態(tài)分布的參數(shù)。使用極大似然

  1. > m1=sum(p*X)/sum(p)


  2. + logL=-sum(log(p*dnorm(X,m1,s1)+(1-p)*dnorm(X,m2,s2)))

  3. + return(logL)

這個想法實際上是有一個循環(huán)的:我們估計屬于這些類的概率(考慮到正態(tài)分布的參數(shù)),一旦有了這些概率,就可以重新估計參數(shù)。然后我們再次開始


  1. > for(s in 1:100){


  2. + p=p1/(p1+p2)


  3. + s1=sqrt(sum(p*(X-m1)^2)/sum(p))

  4. + s2=sqrt(sum((1-p)*(X-m2)^2)/sum(1-p))


  5. + }

然后,我們恢復(fù)混合分布的“最佳”參數(shù)

  1. > hist(X,col="light green",probability=TRUE)

  2. > lines(density(X))

這相對接近我們的估計。

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