原核生物反轉(zhuǎn)錄PCR——生物制藥綜合實(shí)驗(yàn)
一、實(shí)驗(yàn)?zāi)康?/span>
(1)掌握反轉(zhuǎn)錄PCR的原理
(2)掌握反轉(zhuǎn)錄PCR的操作技術(shù)
(3)以原核生物為材料進(jìn)行cDNA的擴(kuò)增
?
二、實(shí)驗(yàn)原理
(1)反轉(zhuǎn)錄PCR原理
(2)PCR擴(kuò)增原理
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三、材料、試劑、儀器與設(shè)備
(1)材料:大腸桿菌過(guò)夜培養(yǎng)物
(2)試劑:RNA提取試劑盒、反轉(zhuǎn)錄試劑盒、PCR mix
(3)儀器與設(shè)備:移液槍、離心機(jī)、PCR儀、電泳儀、凝膠成像系統(tǒng)、天平、電磁爐等
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四、實(shí)驗(yàn)過(guò)程
(1)細(xì)菌RNA提取
① 挑取大腸桿菌單菌落于 LB 中37 ℃ 180 rpm 振蕩過(guò)夜培養(yǎng)。
② 向 1.5 mL 離心管中加入 1 mL 菌液,12,000 rpm 離心 2 min。除去上清留下菌體沉淀。
③ 用 100 μL溶菌酶重懸菌體沉淀并輕輕敲打混勻。
④ 加入200 μL RNA裂解液,混勻,室溫孵育3-5 min。
⑤ 加入300 μL RNA稀釋液,混勻,室溫放置3-5 min。
⑥ ?加入 0.5 倍體積無(wú)水乙醇,充分混勻,并將此混合物轉(zhuǎn)移到離心柱裝配體中。
12,000 rpm 離心 1min。
⑦從離心柱裝配體上拿下離心柱,棄去收集管中的液體。將離 心柱裝回到收集管上。加 600 μL RNA 洗液于離心柱裝配體,12,000 rpm 離心 1 min。
⑧加入50 μL DNA酶I孵育液,室溫孵育15min。
⑨重復(fù)⑦兩次。?
⑩ 清空收集管,12,000 rpm 離心 2 min。將離心柱從收集管上轉(zhuǎn)移到 1.5 mL 洗脫管上,向膜上加 60 μL 無(wú)核酸酶水。
14,000 rpm 離心 1 min。丟棄離心柱。蓋好RNA 的洗脫管,存于‐80 ℃保存?zhèn)溆谩?
(2)cDNA合成
① 于冰上加入以下反應(yīng)組分:
總 RNA? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ????50 ng ~ 1 μg
RTIII All-in-one Mix ?????????4 μL
dsDNase? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?????1 μL
Nuclease-free water ??????????to 20 μL
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② 輕輕吸打混勻,瞬離。
③ 37 ℃溫育2 min,去除基因組DNA;55 ℃溫育15 min 。
④ 85 ℃溫育5 min以終止反應(yīng),迅速將獲得的cDNA置于冰上。
(3)16S rDNA擴(kuò)增與檢測(cè)
反應(yīng)體系(25 μL):?
cDNA 模版 ????? ? ? ? ? ???1 μL
上游引物(10 μM)? ??1 μL
下游引物(10 μM)????1 μL
PCR Mix (2X)? ? ? ? ?????12.5?μL????
? ? ?? ddH2O? ? ? ? ? ? ?????9.5 μL
?反應(yīng)程序:
95 ℃ 3 min;94℃?30 sec,56 ℃ 30 sec,72 ℃ 2 min,35 循環(huán);72 ℃ 5min;
12 ℃保存。取 5μL PCR擴(kuò)增反應(yīng)產(chǎn)物,于1%瓊脂糖凝膠中進(jìn)行電泳檢測(cè)。
?
五、實(shí)驗(yàn)結(jié)果記錄

1、RNA提取過(guò)程注意事項(xiàng)有哪些?2、提高RNA提取濃度和質(zhì)量的方法?
?
