那些正在改變實(shí)驗(yàn)室模式的科學(xué)家們——實(shí)驗(yàn)室自動化(一)
正如前一篇專欄所提到的,一些研究人員開始以自動化和智能化的方式來著手解決合成實(shí)驗(yàn)中效率低、重復(fù)性差和安全性的問題。為了讓大家更深入地了解,我們決定開個系列來逐個介紹這些科學(xué)家以及他們的成就,未來也將持續(xù)追蹤關(guān)注他們最新的工作。希望為實(shí)驗(yàn)人員轉(zhuǎn)變思想,擁抱自動化、智能化和物聯(lián)化的實(shí)驗(yàn)室模式做出一丟丟貢獻(xiàn)。內(nèi)容很精彩,關(guān)注up主,不會走丟( ̄▽ ̄)ノ
第一位要介紹的是來自多倫多大學(xué)Alan Aspuru-Guzik教授。

Alan Aspuru-Guzik是多倫多大學(xué)的化學(xué)和計算機(jī)科學(xué)的教授, 長期從事量子信息、化學(xué)以及將機(jī)器學(xué)習(xí)和化學(xué)融合的研究。他是將量子計算機(jī)專門用于化學(xué)系統(tǒng)和量子模擬器的算法開發(fā)以及其實(shí)驗(yàn)實(shí)現(xiàn)的先驅(qū)。不過最近,Alán 更多的興趣放在了加速科學(xué)發(fā)現(xiàn)的自動化化學(xué)實(shí)驗(yàn)室上,并且在學(xué)術(shù)界和工業(yè)界都做出了卓越的成果。
1? 目標(biāo)&解決方案
學(xué)術(shù)上,對于Alan Aspuru-Guzik的“AI for Discovery and Self-Driving Labs”研究小組來說,目標(biāo)是將發(fā)現(xiàn)新功能材料或優(yōu)化已知功能材料所需的時間和金錢減少 10 倍,即從估計的 1000 萬美元和 10 年的開發(fā)時間減少到 100 萬美元和 1 年。他們提出應(yīng)對這一挑戰(zhàn)的解決方案是開發(fā)自我驅(qū)動的實(shí)驗(yàn)室,將人工智能與自動化機(jī)器人平臺相結(jié)合,以自主發(fā)現(xiàn)新材料。而創(chuàng)建一個完全自主的自動駕駛實(shí)驗(yàn)室是一項(xiàng)多學(xué)科任務(wù),小組探索了多個領(lǐng)域,包括利用人工智能設(shè)計用于控制和設(shè)計實(shí)驗(yàn)的優(yōu)化算法、用于執(zhí)行這些實(shí)驗(yàn)的機(jī)器人系統(tǒng)以及用于分析結(jié)果的自動表征方法,這些領(lǐng)域以智能化、物聯(lián)化的模式在Alan Aspuru-Guzik實(shí)驗(yàn)室組成了閉環(huán),最大化的減少實(shí)驗(yàn)過程中的低端人工成分,而把精力放在創(chuàng)新和設(shè)計上。當(dāng)然這種實(shí)驗(yàn)室模式也在多個工作中展示了它閉環(huán)自主發(fā)現(xiàn)的生產(chǎn)力:(1)在一次運(yùn)行過程中來產(chǎn)生大約40種用于激光設(shè)備的有機(jī)半導(dǎo)體分子(2)在廣泛空間內(nèi),大大優(yōu)化了薄膜材料的成分和加工參數(shù)(SCIENCE ADVANCE,13 May 2020,Vol 6, Issue 20,DOI: 10.1126/sciadv.aaz8867)。
2??自動化實(shí)驗(yàn)室組成
讓我們簡單地來看看這個實(shí)驗(yàn)室循環(huán)模式四大組成部分-虛擬篩選、機(jī)器人平臺合成、自動化表征以及“大腦”控制軟件-centos。

Alan的實(shí)驗(yàn)室里,基于量子化學(xué)和計算化學(xué)進(jìn)行高通量計算的虛擬篩選是他們的拿手好戲。通過計算模擬和機(jī)器學(xué)習(xí)得到合適范圍內(nèi)的分子就交由實(shí)驗(yàn)室內(nèi)的Chemspeed機(jī)器人平臺旨來進(jìn)行高通量的樣品制備、合成、工藝開發(fā)、配方、應(yīng)用或測試,加速產(chǎn)品的研發(fā)。

產(chǎn)品合成后緊跟著的是他們的自動表征平臺,除了在多臺傳統(tǒng)意義上的表征儀器間進(jìn)行通信和產(chǎn)物的傳遞。在人臉識別、自動駕駛等領(lǐng)域正在大放異彩的計算機(jī)視覺,也作為一個新的研究方向,被用來增強(qiáng)進(jìn)行化學(xué)和材料科學(xué)實(shí)驗(yàn)時的視覺感知,例如在實(shí)驗(yàn)過程中對液體類型、材料的相(例如,液體、固體、泡沫、懸浮液)、容器的類型以及容器的特性(透明、不透明)的實(shí)時觀察。

ChemOS軟件作為大腦,管理著數(shù)據(jù)收集、實(shí)驗(yàn)程序和相關(guān)的機(jī)器人設(shè)備。它還支持設(shè)備的遠(yuǎn)程控制,這使得 ChemOS 能夠跨不同的實(shí)驗(yàn)室運(yùn)行,甚至位于不同機(jī)構(gòu)的實(shí)驗(yàn)室。ChemOS能夠幫助不同的實(shí)驗(yàn)室之間共享互補(bǔ)各自專業(yè)領(lǐng)域,可以加快發(fā)現(xiàn)和創(chuàng)新過程。一個這樣的“共享”實(shí)驗(yàn)室曾在加拿大溫哥華和美國劍橋之間建立, ChemOS校準(zhǔn)了一個機(jī)器人采樣序列,用于直接注射HPLC分析。這個過程在沒有人監(jiān)督的情況下完全自主地運(yùn)行了幾天,總共累積了1100個由ChemOS設(shè)計的實(shí)驗(yàn)。
3??實(shí)驗(yàn)室之外...
除了自己實(shí)驗(yàn)室的工作外,他同樣是2021年八月英國皇家化學(xué)學(xué)會新創(chuàng)建的Open Access期刊? Digital Discovery 的主編,該期刊正面迎合高程度自動化、數(shù)據(jù)驅(qū)動等與化學(xué)、材料學(xué)、生物技術(shù)融合的趨勢,目標(biāo)是捕捉該交叉領(lǐng)域的頂級研究,以及與機(jī)器學(xué)習(xí)、高通量計算相關(guān)的主題和實(shí)驗(yàn)篩選,來快科學(xué)發(fā)現(xiàn)的進(jìn)程。

當(dāng)然Alan Aspuru-Guzik并不僅僅是在自己的實(shí)驗(yàn)室自娛自樂,他也在產(chǎn)業(yè)界積極開拓。Aspuru-Guzik于 2017 年在哈佛大學(xué)聯(lián)合推出了Kebotix,這家公司正為機(jī)器學(xué)習(xí)和機(jī)器人自動化在未來幾年內(nèi)為材料科學(xué)帶來革命做準(zhǔn)備,正如公司的slogan所說:只需按一下按鈕,就能以更快的速度發(fā)現(xiàn)和創(chuàng)造先進(jìn)的化學(xué)品和材料。Kebotix日前獲得了500萬美元融資,由One Way Ventures領(lǐng)投,走出了隱形模式。另外投資者還包括百度風(fēng)投、波士頓Flybridge Capital Partner、洛杉磯Embark Ventures、挪威Propagator Ventures以及紐約WorldQuant Ventures。最近,Kebotix實(shí)驗(yàn)室在市面銷售的700萬個分子中識別出極少數(shù)個可以用作電致變色玻璃材料的分子,并且AI還設(shè)計出數(shù)百個額外的新型電致變色分子,每個分子都滿足了目標(biāo)特性。這項(xiàng)工作證明了Kebotix以極快的速度發(fā)掘一種新型材料來證明自己正在履行 Kebotix 成立時的使命.

此外,他還協(xié)調(diào)成立了一個名為 Acceleration Consortium 的聯(lián)盟,這是是學(xué)術(shù)界、工業(yè)界和政府之間的一項(xiàng)新的全球性合作,總部位于多倫多大學(xué)(U of T)。Acceleration Consortium有3個相互關(guān)聯(lián)的目標(biāo):(1)轉(zhuǎn)變科技創(chuàng)新:推動材料加速平臺(Materials Acceleration Platform,MAPS)的設(shè)計,以加快新材料的發(fā)現(xiàn),并在AI、機(jī)器人技術(shù)、計算和材料科學(xué)領(lǐng)域取得根本性突破;(2)構(gòu)建創(chuàng)新生態(tài)系統(tǒng):建立致力于材料創(chuàng)新的學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)、科技公司和企業(yè)家組成的全球網(wǎng)絡(luò);(3)培養(yǎng)高技能的勞動力:為下一代研究人員制定全國性的培訓(xùn)計劃。
Alan Aspuru-Guzik的實(shí)驗(yàn)室主頁:https://www.matter.toronto.edu/