WB實(shí)驗(yàn)流程
WB(Western Blot):即蛋白質(zhì)免疫印跡,是在蛋白質(zhì)電泳分離和抗原抗體檢測(cè)的基礎(chǔ)上發(fā)展起來(lái)的一項(xiàng)檢測(cè)蛋白質(zhì)的技術(shù),它結(jié)合了SDS聚丙烯酰胺凝膠電泳對(duì)蛋白的高分辨率及抗原抗體反應(yīng)的特異性。
WB的特點(diǎn):
??????? 利用抗原抗體的特異性反應(yīng)完成檢測(cè),結(jié)果更可靠;
??????? 可以做內(nèi)部參照(加入內(nèi)參),分析更方便;
??????? 可以分辨出相同分子量大小的目標(biāo)表蛋白;
典型的印記實(shí)驗(yàn)包括3個(gè)步驟:
??????? 蛋白質(zhì)的電泳分離
??????? 電泳后凝膠上的蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)移到膜上,用非特異性,非反應(yīng)活性分子封閉固體膜上未吸附蛋白質(zhì)區(qū)域
??????? 免疫學(xué)檢測(cè)
WB ——常規(guī)樣品處理
常用裂解液類型

?? 貼壁/懸浮細(xì)胞
??????? 收集細(xì)胞
取生長(zhǎng)狀態(tài)良好的細(xì)胞,輕輕倒掉培養(yǎng)瓶中的培養(yǎng)基;
加2ml預(yù)冷的PBS,洗2次,去掉死細(xì)胞;
加入胰酶消化細(xì)胞;
加入完全培養(yǎng)基終止消化,收集細(xì)胞懸液,離心收集細(xì)胞沉淀;(懸浮細(xì)胞直接離心收集細(xì)胞沉淀,不需要消化)
PBS漂洗,離心,重復(fù)兩遍,洗掉殘余培養(yǎng)基,棄倒殘余的PBS,只留細(xì)胞沉淀(可凍存于-80后一起提蛋白)
??????? 裂解
取上一步收集的細(xì)胞沉淀;
加入RIPA(強(qiáng))裂解液,裂解液需要提前加入蛋白酶和磷酸酶抑制劑(1:100);
冰上裂解10—20min;
??????? 收集樣品
裂解好之后,4℃,高速離心,12000rpm/10min;
收集上清,轉(zhuǎn)移至1.5ml EP管中,整個(gè)過(guò)程需在冰上進(jìn)行;
分裝保存于-20℃或者-80℃中備用;
?? 腫瘤組織樣品
??????? 勻漿機(jī)(上海凈信全自動(dòng)樣品快速研磨儀)
取小鼠腫瘤組織,純水沖洗,吸水紙吸掉多余水分;
剪刀剪取30mg組織樣品;每管加入300ul RIPA強(qiáng)裂解液,加入3ul蛋白酶抑制劑(1:100的比例加入),加入2顆鋼珠;
勻漿儀勻漿,65HZ,30s,勻漿2次后,冰上裂解30min;
棄掉鋼珠,4℃,12000rpm/10min高速離心;
收集上清,轉(zhuǎn)移至1.5ml EP管中,整個(gè)過(guò)程需在冰上進(jìn)行;
分裝保存于-20℃或者-80℃中備用;
??????? 超聲破碎儀
取小鼠腫瘤組織,純水沖洗,吸水紙吸掉多余水分;
剪刀剪取30mg組織樣品;每管加入300ul RIPA強(qiáng)裂解液,加入3ul蛋白酶抑制劑(1:100的比例加入);
超聲破碎儀破碎,10-15s,超聲頻率是30%-40%,重復(fù)3次(期間每次間隔10s),冰上裂解10-30min;(樣品之間,探頭需要沖洗)
4℃,12000rpm/10min高速離心;
收集上清,轉(zhuǎn)移至1.5ml EP管中,整個(gè)過(guò)程需在冰上進(jìn)行;
分裝保存于-20℃或者-80℃中備用;
WB —— 蛋白定量
常用的蛋白定量方法對(duì)比

提取的樣品中若含有去垢劑則需要選用BCA法進(jìn)行蛋白濃度測(cè)定,若樣品中含有螯合劑(EDTA,EGTA)、還原劑(DTT,巰基乙醇)和脂類等,則需要選用Bradford法進(jìn)行蛋白濃度測(cè)定。
??????? BCA法蛋白定量(雅酶試劑盒,ZJ101,實(shí)驗(yàn)室在用的)
取試劑盒中最大濃度8號(hào),以PBS進(jìn)行2倍連續(xù)稀釋,稀釋6個(gè)點(diǎn)(第一孔為標(biāo)準(zhǔn)品原液,10ul標(biāo)準(zhǔn)品+10ulPBS稀釋),最后一個(gè)點(diǎn)為PBS陰性對(duì)照,加入到96孔板中;
蛋白樣品按照10倍稀釋,取2ul蛋白樣品+18ulPBS,加入到96孔板中;
按照試劑盒說(shuō)明書(shū)配制顯色液,充分混勻,每孔加顯色液200ul;
37度孵育30min;
酶標(biāo)儀562nm檢測(cè)OD值;
蛋白樣品濃度歸一化(有模板,有需要私信或評(píng)論)
WB —— 蛋白變性(加熱)
金屬浴95°C-100°C,加熱5-10min,加熱使樣品變性(若加熱10min仍然粘稠可適當(dāng)補(bǔ)加SDS-Loading buffer;煮蛋白時(shí)間不能太長(zhǎng),會(huì)產(chǎn)生蛋白交聯(lián)或降解);
煮沸變性后的蛋白應(yīng)立刻置于冰上降溫,防止蛋白聚集復(fù)性;
膜蛋白,多重跨膜蛋白的變性:70℃ 加熱10分鐘(煮沸可能會(huì)使膜蛋白發(fā)生聚合);
樣品短期可保存在-20°C,長(zhǎng)期保存在-80°C;
WB —— SDS-PAGE電泳
上樣規(guī)格:0.1mm/15孔梳子,上樣10ul,總量15ug;
SDS-PAGE(自己配制,碧云天的試劑盒,P0012A):上樣前可用針管吹一吹,避免氣泡和多余凝膠堵塞上樣孔,以免樣品溢出到電泳緩沖液中;
上樣前蛋白處理:上樣的蛋白樣品95-100℃加熱5min,12000rpm離心5min(凍存樣品會(huì)有SDS沉淀析出,影響跑膠結(jié)果),吸取上清上樣;一般1mm/15孔的梳子,上樣10ul;為了區(qū)分加樣的順序,marker可一邊加5ul,一邊加2-3ul;
SDS-PAGE Running Buffer:一般是買(mǎi)的10X的成品buffer,純水稀釋至1X后使用;
SDS-PAGE電泳條件:一般以小電壓80-100V起跑,10-15min,樣品會(huì)跑到一條平齊的線上,marker可看到條帶時(shí)(即樣品跑入分離膠中),再加大電壓換120V/50-60min;
WB —— SDS-PAGE轉(zhuǎn)膜
轉(zhuǎn)膜緩沖液的配制(現(xiàn)配現(xiàn)用,電泳跑到分離膠就可以配制了):
1L體系:3.03g的Tris;14.4g的甘氨酸;200mL甲醇;純水定容至1L,充分?jǐn)嚢杈鶆颍湃胫票鶛C(jī)或者-20℃提前預(yù)冷;
轉(zhuǎn)膜條件:濕轉(zhuǎn),200V/90min,若蛋白過(guò)大,可適當(dāng)延長(zhǎng);
實(shí)驗(yàn)步驟:
換用干凈手套,取PVDF膜,并剪至合適大小,放于甲醇中浸泡數(shù)十秒(甲醇可活化PVDF膜上面的正電基團(tuán),使它更易跟帶負(fù)電荷的蛋白質(zhì)結(jié)合)
將提前預(yù)冷的轉(zhuǎn)膜緩沖液倒入盤(pán)中;
準(zhǔn)備轉(zhuǎn)膜三明治夾,海綿,濾紙,浸濕備用;

取出電泳完的玻璃板,撬去玻板(動(dòng)作要輕,上下都需要撬),切掉上下多余的部分,借助轉(zhuǎn)膜緩沖液輕輕松動(dòng)凝膠,放入轉(zhuǎn)膜緩沖液中備用;
平放轉(zhuǎn)膜轉(zhuǎn)移槽,依次在黑色面疊放海綿,3張浸泡過(guò)的濾紙(按照濾紙的厚度進(jìn)行增減),凝膠,PVDF膜(為了區(qū)分,可減角進(jìn)行標(biāo)識(shí)),每疊放一層,都需要趕走氣泡,紅面上疊放海綿,3張浸泡過(guò)的濾紙;

夾緊后,放入轉(zhuǎn)膜槽,黑板對(duì)黑板;

轉(zhuǎn)膜槽內(nèi)兩側(cè)可放冰袋,外側(cè)可用冰水混合物+冰袋包圍,降低溫度(轉(zhuǎn)膜過(guò)程中,會(huì)發(fā)熱,避免膜被燒干)
設(shè)置轉(zhuǎn)膜條件,200V/90min;
WB —— 封閉
試劑配制(轉(zhuǎn)膜開(kāi)始之后就可以配)
1XPBST(0.02%):1L PBS+2mL Tween 20,充分混勻后室溫存放;
5%的脫脂奶粉(現(xiàn)配現(xiàn)用):稱量2.5g脫脂奶粉到1XPBST中,充分渦旋混勻,4℃保存?zhèn)溆茫?/p>
封閉:取出轉(zhuǎn)膜成功的PVDF膜,放置于5%脫脂奶粉中,室溫?fù)u床封閉1h;
(封閉的作用:用大分子物質(zhì)封閉非相關(guān)的蛋白結(jié)合位點(diǎn),降低抗體與膜的特異性吸附,降低背景,Tween 20的作用也是減少非特異性吸附)
WB —— 一抗孵育
封閉完成后,即可開(kāi)始孵一抗;
參考一抗的說(shuō)明書(shū),按照適當(dāng)比例稀釋一抗,一般1:1000稀釋,用含5%脫脂牛奶的PBST進(jìn)行配制(注意樣品和抗體的種屬需要匹配);
根據(jù)實(shí)驗(yàn)所需要檢測(cè)的蛋白大小,將膜進(jìn)行切割(可將膜放入PE手套,加一點(diǎn)封閉液,用尺子比著marker,用切膠的小刀切膜),并將膜的一角切除或者標(biāo)記筆標(biāo)記進(jìn)行區(qū)分;
將稀釋好的一抗加入到孵育的盒子里,放入對(duì)應(yīng)切好的條帶,4度搖床過(guò)夜孵育;
內(nèi)參根據(jù)實(shí)驗(yàn)?zāi)康倪M(jìn)行選擇,一般是β-actin,GAPDH抗體,1:10000進(jìn)行稀釋,具體的參照實(shí)驗(yàn)室買(mǎi)的抗體的說(shuō)明書(shū);
孵育完的一抗可進(jìn)行回收,一般可重復(fù)利用5-10次;
WB —— 二抗孵育
回收一抗;
將孵育過(guò)一抗的膜夾到洗膜的容器里(我們實(shí)驗(yàn)室常用的是96孔板的殼子),加入1X PBST,一般洗3次,每次5min(如果有實(shí)驗(yàn)耽擱,洗久一點(diǎn)也沒(méi)關(guān)系);
用1X PBST配制二抗,參照說(shuō)明書(shū),注意種屬,一般是1:10000稀釋,室溫下?lián)u床孵育1h;
將孵育過(guò)二抗的膜夾到洗膜的容器里(我們實(shí)驗(yàn)室常用的是96孔板的殼子),加入1X PBST,一般洗3次,每次5min(如果有實(shí)驗(yàn)耽擱,洗久一點(diǎn)也沒(méi)關(guān)系);
WB —— 化學(xué)發(fā)光
在實(shí)驗(yàn)臺(tái)上鋪一張PE手套,將PVDF膜放在PE手套上;
將ECL的A液和B液在EP管內(nèi)等體積混合,均勻滴在PVDF膜的蛋白面,反應(yīng)2-5min;
在照膠儀內(nèi)鋪一張PE手套;
取孵育好的PVDF膜,吸干多余的ECL工作液,將膜放到PE手套上;
照膠儀曝片,保存,數(shù)據(jù)分析;