2021年2月和11月，中南大學(xué)湘雅醫(yī)院產(chǎn)科張衛(wèi)社教授團(tuán)隊(duì)利用一份單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分別從轉(zhuǎn)錄組和免疫組兩個方向進(jìn)行研究，在?Cell Proliferation?和?Frontiers in Cell and Developmental Biology?上發(fā)表了兩篇蛻膜樣本文章。該研究中的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序服務(wù)由博奧晶典提供。

接下來小編帶大家一起走進(jìn)這兩篇文章深入了解作者的研究思路及主要結(jié)論！

01、單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)解析圍產(chǎn)期蛻膜組織的異質(zhì)性和差異表達(dá)

Single-cell RNA sequencing reveals heterogeneity and differential expression of decidual tissues during the peripartum period

【發(fā)表期刊】Cell Proliferation

【影響因子】6.831

研究背景

蛻膜是一種接觸母體和胎兒的組織，分娩起關(guān)鍵作用。由于蛻膜組織的異質(zhì)性，研究其在圍產(chǎn)期的作用具有挑戰(zhàn)性。為此，研究者對分娩前后的蛻膜進(jìn)行了單細(xì)胞 RNA 測序，并確定了主要細(xì)胞群和亞群。采用生物信息學(xué)方法對不同細(xì)胞類型和亞型在分娩開始時的功能進(jìn)行評價，結(jié)果顯示蛻膜細(xì)胞在分娩開始時發(fā)生改變。這些發(fā)現(xiàn)為進(jìn)一步的研究提供了基礎(chǔ)，為圍產(chǎn)期蛻膜的研究提供了一個新的視角。

研究思路

主要結(jié)果

1、6例產(chǎn)婦的蛻膜組織消化成單細(xì)胞懸液，檢測到29231個蛻膜細(xì)胞，分為16個細(xì)胞群。經(jīng)過注釋鑒定出8種主要的細(xì)胞類型（包括內(nèi)皮細(xì)胞、蛻膜基質(zhì)細(xì)胞、成纖維細(xì)胞、絨毛外滋養(yǎng)層細(xì)胞、T 細(xì)胞、平滑肌細(xì)胞、樹突狀細(xì)胞和子宮內(nèi)膜細(xì)胞），并發(fā)現(xiàn)它們具有不同的功能。

2、與分娩前比較，分娩后蛻膜基質(zhì)細(xì)胞、絨毛外滋養(yǎng)細(xì)胞和T細(xì)胞亞群出現(xiàn)不同程度激活，包括細(xì)胞增殖等。

3、擬時間分析結(jié)果顯示蛻膜基質(zhì)細(xì)胞和絨毛外滋養(yǎng)層細(xì)胞亞群間的分化。

02、破譯協(xié)調(diào)分娩的圍生期蛻膜組織細(xì)胞間通訊網(wǎng)

Deciphering the intercellular communication network of peripartum decidua that orchestrates Delivery

【發(fā)表期刊】Frontiers in Cell and Developmental Biology

【影響因子】6.684

研究背景

蛻膜是在母胎界面發(fā)現(xiàn)的一種重要組織，是細(xì)胞間相互交流的部位，在連接母胎系統(tǒng)、維持妊娠和分娩過渡中起著重要作用。盡管技術(shù)進(jìn)步，但對蛻膜的特性及其在懷孕和分娩期間的功能的理解仍遠(yuǎn)未明確。蛻膜細(xì)胞間通訊的進(jìn)一步闡明有助于我們理解懷孕的基礎(chǔ)，并有助于揭示妊娠相關(guān)疾病的致病機(jī)制。這項(xiàng)研究中，將發(fā)生在圍產(chǎn)期的細(xì)胞間通信可視化，并識別與分娩開始相關(guān)的關(guān)鍵細(xì)胞間轉(zhuǎn)導(dǎo)信號通路。

研究思路

主要結(jié)果

1、在 DBD 和 DAD 中，各種細(xì)胞間通信信號廣泛分布在不同類型的細(xì)胞之間。與其他細(xì)胞類型相比，EECs 和 DSCs 向其他細(xì)胞傳遞的信號明顯更多，表明分娩時 EECs 和 DSCs 在母胎界面細(xì)胞間交流中起主導(dǎo)作用。

2、為了研究分娩過程中細(xì)胞間的重要信號，分析了 DBD 和 DAD 共有的細(xì)胞間通信，EECs和 EVT 細(xì)胞間通信普遍存在。通路活性分析顯示，這些常見的細(xì)胞間通訊主要富集在 PI3K-Akt 信號通路、Jak-STAT 信號通路、黏附和癌組織蛋白多糖中。

3、T 細(xì)胞在人類懷孕期間蛻膜中發(fā)揮關(guān)鍵作用，進(jìn)一步研究了 T 細(xì)胞和其他蛻膜細(xì)胞之間的細(xì)胞間通訊。與 DBD 相比，在 DAD 中 T 細(xì)胞向其他細(xì)胞發(fā)出的細(xì)胞間信號明顯增多，例如TNFSF14-TNFRSF14 / LTBR 和 FASLG-FAS，參與母胎免疫耐受和促進(jìn)分娩發(fā)作。

4、為了揭示分娩過程中母胎免疫系統(tǒng)的動態(tài)變化，使用 scBCR/TCR 序列進(jìn)一步探討了 DBD 和 DAD 中 BCR 和 TCR 序列的特點(diǎn)。在 DAD 中，B克隆細(xì)胞和 T 克隆細(xì)胞的頻率似乎高于 DBD。然而，6個樣品的 Shannon Entropy 和 D50 indexes 表明，BCR/TCR 的克隆多樣性在 DBD 和 DAD 之間沒有顯著變化。樣品間的基尼系數(shù)表明，DBD 和 DAD 之間 BCR/TCR 的克隆均勻性也沒有明顯變化。

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