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[BioLadder云平臺(tái)] 輕松無憂繪制雷達(dá)圖

2022-04-22 12:38 作者:青蓮百奧  | 我要投稿

大家好!我是BioLadder生物信息在線可視化云平臺(tái)的工程師小宇,今天我來給大家分享怎樣用BioLadder畫出雷達(dá)圖!

如果您反饋問題,報(bào)告Bug,提出新的需求,請(qǐng)直接在公眾號(hào)內(nèi)發(fā)留言給我哦!為感謝您對(duì)BioLadder的認(rèn)可我們還有星爸爸同款收納包相贈(zèng)哦!小宇在這里先謝謝大家嘍!

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1.什么是雷達(dá)圖?

雷達(dá)圖,它將多個(gè)維度的數(shù)據(jù)量映射到坐標(biāo)軸上,每一個(gè)維度的數(shù)據(jù)都分別對(duì)應(yīng)一個(gè)坐標(biāo)軸,這些坐標(biāo)軸以相同的間距沿著徑向排列,并且刻度相同。 雷達(dá)圖也稱為網(wǎng)絡(luò)圖,蜘蛛圖,星圖,蜘蛛網(wǎng)圖,不規(guī)則多邊形,極坐標(biāo)圖。它相當(dāng)于平行坐標(biāo)圖,軸徑向排列。

雷達(dá)圖和折線圖是是很相似的,只不過坐標(biāo)軸由直線坐標(biāo)軸,變成了極坐標(biāo)軸。

點(diǎn)擊查看雷達(dá)圖視頻教程

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2.繪圖前的數(shù)據(jù)準(zhǔn)備

demo數(shù)據(jù)可以在

https://www.bioladder.cn/shiny/zyp/bioladder2/demoData/radarChart/demo.csv 下載。

包含2個(gè)維度的數(shù)據(jù),必須包含行名和列名。每一行數(shù)據(jù)會(huì)在圖上變成一條折線,列名對(duì)應(yīng)坐標(biāo)軸上的標(biāo)簽名稱。

3. BioLadder生信云平臺(tái)在線繪制雷達(dá)圖

不想寫代碼?可以用BioLadder生信云平臺(tái)在線繪制雷達(dá)圖。

網(wǎng)址:https://www.bioladder.cn/web/#/chart/64

3.1 上傳文件

點(diǎn)擊“選擇”按鈕上傳自己的文件,支持txt,csv,xlsx,xls四種格式

3.2 調(diào)整參數(shù)

根據(jù)需求調(diào)整參數(shù)即可

? 線條粗細(xì):調(diào)整圖中線條的粗細(xì)

? 點(diǎn)大小

? 標(biāo)簽字體大小:組名標(biāo)簽字體大小

? 軸字體大?。鹤鴺?biāo)軸百分比標(biāo)簽大小

? 是否自定義顏色:選中后在彈出的顏色板中選擇合適的顏色,最大支持20個(gè)分組

? 標(biāo)題名字

? 選擇圖例位置:可以選擇圖例的位置,設(shè)置圖例名稱及文字大小

3.3 提交查看

上傳完數(shù)據(jù),并調(diào)好參數(shù)后,點(diǎn)擊右上方“提交”按鈕,圖像會(huì)出現(xiàn)在左側(cè)。如果沒有上傳自己的數(shù)據(jù),會(huì)使用默認(rèn)的demo數(shù)據(jù)繪圖。

3.4 下載

首先,挑選自己想要的格式有png,jpg,svg和pdf供選擇,接著調(diào)整圖片的寬,高和分辨率(注:這里的寬高比會(huì)反饋到左上的繪圖區(qū)),最后點(diǎn)擊“Download”下載按鈕。

4.雷達(dá)圖結(jié)果解讀

將原始數(shù)據(jù)縮放到同一個(gè)比例,如圖,內(nèi)圈是0%,中圈是50%,外圈是100%

雷達(dá)圖和折線圖是是很相似的,只不過坐標(biāo)軸由直線坐標(biāo)軸,變成了極坐標(biāo)軸。

5.BioLadder生物信息在線分析可視化云平臺(tái)

網(wǎng)址:https://www.bioladder.cn/

BioLadder目前上線了生物學(xué)分析最常用的50多個(gè)模塊,主要包括以下四類:

數(shù)據(jù)可視化:箱線圖,南丁格爾玫瑰圖,韋恩圖,UpSet圖,餅圖,詞云圖,小提琴圖,餅圖/甜甜圈圖,弦圖,柱形圖等

組學(xué)數(shù)據(jù)分析:序列的多重比對(duì),表達(dá)數(shù)據(jù)的CV曲線圖,餅圖/甜甜圈圖,T-SNE,熱圖,趨勢(shì)分析的mFuzz,差異分析的火山圖,富集分析的氣泡圖,修飾位點(diǎn)上下游模體分析的seqLogo,Motif熱圖等

功能分析:GO弦圖,相互作用網(wǎng)絡(luò)圖,富集分析

數(shù)據(jù)預(yù)處理:歸一化,補(bǔ)值,F(xiàn)DR校正,長(zhǎng)寬表互換等

好了雷達(dá)圖的繪制就到這里了,后續(xù)大家想要了解什么內(nèi)容可以給我們?cè)u(píng)論反饋,我們會(huì)根據(jù)大家的意見持續(xù)更新。我們歡迎您以任何方式提出您的優(yōu)化意見,使BioLadder平臺(tái)成為廣大科研工作者的生物信息分析首選平臺(tái)!


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