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單細(xì)胞測序結(jié)果如何驗證呢?加上它們高分文章十拿九穩(wěn)!

2023-05-23 15:18 作者:科研顯微鏡  | 我要投稿


目前,單細(xì)胞測序相關(guān)的文章越來越多,同傳統(tǒng)測序一樣,越來越多的雜志也開始要求對單細(xì)胞測序結(jié)果進行驗證,那么單細(xì)胞測序能做哪些驗證實驗?zāi)?,下面小薇就帶大家了解一下?/p>

01.免疫熒光染色

根據(jù)單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)識別的特定細(xì)胞標(biāo)志,進行免疫熒光染色驗證。需要注意,該方法通常只能驗證一些表面標(biāo)志物,對于一些異質(zhì)性細(xì)胞可能不夠精確。

02.Western blot和免疫組化

在蛋白水平檢測marker基因在組織細(xì)胞中的表達。


03.細(xì)胞原位雜交(FISH)

使用FISH技術(shù)對單個細(xì)胞進行基因擴增和探針雜交,以驗證單細(xì)胞測序結(jié)果。該方法通常較為耗時并需要對目標(biāo)基因進行擴增和標(biāo)記。

04.流式細(xì)胞術(shù)

通過流式細(xì)胞儀將特定的細(xì)胞分選處理,隨后利用RT-qPCR或者western blot檢測目標(biāo)基因的表達。此外,流式細(xì)胞儀也可以用來檢測免疫細(xì)胞浸潤情況。

05.機制研究

主要是通過體外分選(流式分選)特定細(xì)胞后,通過敲除或過表達marker基因,分析細(xì)胞功能相關(guān)基因表達變化及細(xì)胞表型變化(如細(xì)胞增殖、凋亡、遷移和侵襲等);此外,也可以通過構(gòu)建marker基因的敲除或過表達動物模型,進行體內(nèi)實驗驗證。


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