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一圖看懂 | 多組學(xué)聯(lián)合為何需要樣本一一對應(yīng)

2021-05-19 10:54 作者:中科新生命  | 我要投稿

近期,有一些實驗設(shè)計上的問題非常具有共性——例如:三個組學(xué)應(yīng)該如何取樣?如果做6重復(fù),能否取18個樣本,每個組學(xué)各分6個樣本進行做組學(xué)聯(lián)合?

針對這個問題,一圖讓您看懂:

在多組學(xué)聯(lián)合分析中,經(jīng)常會用到相關(guān)性分析(簡單的如pearson, spearman相關(guān)性分析,高級的如O2PLS模型)。這些分析的目的是在統(tǒng)計學(xué)角度建立不同組學(xué)分子的相互調(diào)控關(guān)系,原則都是保證樣本一一對應(yīng),避免組內(nèi)的個體差異引起結(jié)果誤差。如上圖所示,2組6重復(fù)樣本,可以看到基因A的表達量與代謝物B的含量具有極高的相關(guān)性(R2=0.9996)。然而,假設(shè)我們把樣本順序打亂,用同組不同個體的基因表達和代謝物含量去做映射,由于組內(nèi)個體差異的緣故,基因A和代謝物B就不再具有顯著的相關(guān)性(R2=0.7227)。

因此,為了獲得客觀,有效的多組學(xué)聯(lián)合數(shù)據(jù),不同組學(xué)采樣的個體一一對應(yīng)原則非常重要。如個體樣本量不足以滿足多種組學(xué)檢測需求,可以事先進行混樣,再平均分配到各個組學(xué)進行檢測。

好的實驗設(shè)計是理想實驗的基礎(chǔ),可千萬不要馬虎哦!


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