3.4.5. 修改原子半徑(OLEX2使用手冊(cè))
原文如下:
Modifying atomic radii
There is a way to modify atomic radii used for visualisation and calculations in Olex2. Some procedures (like CalcVoid) can take a file which contains element and it’s radius a line, however if you work in an area where atomic radii differ from the ones Olex2 uses, you can modify them permanently by creating a file called radii.xld in DataDir(). The file’s structure should be like this:
<elements
? <Sr bonding="2.15" vdw=”2” sfil=”1.65” pers=”0.3”>?
? <Nd? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ?…>?
>
You need to specify only the elements and radii you want to override. This file will be loaded on Olex2 startup. If you want to modify radii only for one section, you can use similar file and call ‘load radii file_name’ or if you have a file with element and it’s radius a line, you can specify what radii to load like ‘load radii?bonding file_name’.
譯文如下:
3.4.5. 修改原子半徑
Olex2中有一種方法可以更改用于可視化和計(jì)算的原子半徑。有些過(guò)程(例如CalcVoid)可以引用每行為元素及其半徑的文件作為其所用半徑,但如果你在原子半徑與Olex2使用的半徑不同的區(qū)域工作,則可以通過(guò)在DataDir()中創(chuàng)建一個(gè)名為radii.xld的文件以永久更改其半徑。該文件的結(jié)構(gòu)應(yīng)如下所示:
<elements
?<Sr bonding="2.15"vdw="2" sfil="1.65" pers="0.3">
?<Nd???????????????????????????????????? …>
>?
你只需要指定要替代的元素和半徑即可。此文件將在Olex2啟動(dòng)時(shí)加載。如果你只想對(duì)某一部分的半徑進(jìn)行修改,則可以使用類似的文件并鍵入“l(fā)oad radii file_name”指令,或者你有一個(gè)文件,其中元素及其半徑在同一行,則可以指定要加載的半徑,如鍵入“l(fā)oad radii bondingfile_name”指令。
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https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzU0NjkzMTM1MQ==&mid=2247485336&idx=3&sn=b3b82348b553ca3eeaa174942ab8ead3&chksm=fb575060cc20d9767f5db196ca39c8c922725c2b6b5c4b21accb89ff77c9769d447a7dd6c539&token=1126004319&lang=zh_CN#rd
