高新申報(bào)過(guò)程中，企業(yè)研究開(kāi)發(fā)費(fèi)用必須“三表一致”，即企業(yè)年度所得稅納稅申報(bào)表、財(cái)務(wù)會(huì)計(jì)報(bào)表、研發(fā)投入專項(xiàng)審計(jì)報(bào)告中的企業(yè)研發(fā)費(fèi)用數(shù)據(jù)應(yīng)做到一致。然而，在實(shí)際操作中發(fā)現(xiàn)，由于很多企業(yè)的研發(fā)活動(dòng)發(fā)生一些特殊情況和三者遵循的政策法規(guī)規(guī)定不同，很難達(dá)到三表完全一致的情況。以下是一些可能導(dǎo)致不一致的原因：

1、委托外部研發(fā)活動(dòng)

當(dāng)企業(yè)委托外部研發(fā)活動(dòng)時(shí)，在企業(yè)年度所得稅納稅申報(bào)表中會(huì)全額填寫委托外部研究開(kāi)發(fā)費(fèi)用。然而，根據(jù)高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理辦法和工作指引的規(guī)定，委托外部研發(fā)費(fèi)用的實(shí)際發(fā)生額應(yīng)按照獨(dú)立交易原則確定，按實(shí)際發(fā)生額的80%計(jì)入委托方研發(fā)費(fèi)用總額。因此，研發(fā)投入專項(xiàng)審計(jì)報(bào)告中的企業(yè)研發(fā)費(fèi)用數(shù)據(jù)將是實(shí)際發(fā)生金額的80%，與前兩表不一致。

2、與研究開(kāi)發(fā)活動(dòng)直接相關(guān)的其他費(fèi)用

企業(yè)可能存在與研究開(kāi)發(fā)活動(dòng)直接相關(guān)的其他費(fèi)用支出，其他費(fèi)用金額在企業(yè)年度所得稅納稅申報(bào)表(A104000期間費(fèi)用明細(xì)表)的填寫時(shí)是全額填寫的，這時(shí)企業(yè)的財(cái)務(wù)會(huì)計(jì)報(bào)表上反映研發(fā)費(fèi)用與企業(yè)年度所得稅納稅申報(bào)表(A104000期間費(fèi)用明細(xì)表)是一致的。按照《高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理辦法》和《高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定管理工作指引》的規(guī)定，“與研究開(kāi)發(fā)活動(dòng)直接相關(guān)的其他費(fèi)用”不得超過(guò)研究開(kāi)發(fā)費(fèi)用總額的20%。由此得出當(dāng)企業(yè)發(fā)生的“與研究開(kāi)發(fā)活動(dòng)直接相關(guān)的其他費(fèi)用”未超過(guò)研究開(kāi)發(fā)費(fèi)用總數(shù)的20%時(shí)，三表是一致的，但是超過(guò)20%時(shí)，研發(fā)投入專項(xiàng)審計(jì)報(bào)告中的企業(yè)研發(fā)費(fèi)用數(shù)據(jù)就會(huì)小于前兩表，這樣就造成了與前兩表之間不能完全一致，其差異就是各研發(fā)項(xiàng)目“與研究開(kāi)發(fā)活動(dòng)直接相關(guān)的其他費(fèi)用”超過(guò)研究開(kāi)發(fā)費(fèi)用總數(shù)的20%的部分。

3、科技人員費(fèi)用

企業(yè)科技人員在本年累計(jì)實(shí)際工作時(shí)間超過(guò)183天時(shí)，其費(fèi)用在企業(yè)年度所得稅納稅申報(bào)表中會(huì)全額填寫。然而，根據(jù)規(guī)定，累計(jì)實(shí)際工作時(shí)間未滿183天的科技人員費(fèi)用不記入研發(fā)投入專項(xiàng)審計(jì)報(bào)告中的企業(yè)研發(fā)費(fèi)用，導(dǎo)致三表不一致。

此外，在研發(fā)費(fèi)用資本化的情況下，專項(xiàng)審計(jì)報(bào)告反映的研發(fā)費(fèi)用符合規(guī)定的研究開(kāi)發(fā)活動(dòng)定義和費(fèi)用歸集范圍，無(wú)論是資本化會(huì)計(jì)核算的研發(fā)費(fèi)用還是費(fèi)用化核算的研發(fā)費(fèi)用，都屬于申報(bào)企業(yè)近三個(gè)會(huì)計(jì)年度高新技術(shù)企業(yè)認(rèn)定研究開(kāi)發(fā)費(fèi)用歸集范圍。因此，專項(xiàng)審計(jì)報(bào)告反映的研發(fā)費(fèi)用與財(cái)務(wù)會(huì)計(jì)報(bào)表和企業(yè)年度所得稅納稅申報(bào)表是不一致的。

當(dāng)企業(yè)執(zhí)行企業(yè)會(huì)計(jì)準(zhǔn)則時(shí)，財(cái)務(wù)會(huì)計(jì)報(bào)表的研發(fā)費(fèi)用總額包括直接計(jì)入當(dāng)期損益的研究階段支出、不符合資本化條件的開(kāi)發(fā)階段支出以及資本化開(kāi)發(fā)支出的當(dāng)期攤銷金額。根據(jù)認(rèn)定辦法和工作指引的規(guī)定，專項(xiàng)審計(jì)報(bào)告中的企業(yè)研發(fā)費(fèi)用總額包括直接計(jì)入當(dāng)期損益的研究階段支出、不符合資本化條件的開(kāi)發(fā)階段支出、當(dāng)期資本化開(kāi)發(fā)支出發(fā)生額減去資本化當(dāng)期攤銷金額，以及前文提到的“當(dāng)企業(yè)研發(fā)費(fèi)用無(wú)資本化時(shí)”三種情況的差異部分。因此，研發(fā)投入專項(xiàng)審計(jì)報(bào)告中的企業(yè)研發(fā)費(fèi)用數(shù)據(jù)與財(cái)務(wù)會(huì)計(jì)報(bào)表和企業(yè)年度所得稅納稅申報(bào)表的數(shù)據(jù)是不一致的。

在三表研發(fā)費(fèi)用不能一致的情況下，我們應(yīng)該采取以下措施：

1、盡可能使三表研發(fā)費(fèi)用歸集數(shù)據(jù)保持一致。在實(shí)際操作中，企業(yè)可以盡力調(diào)整和協(xié)調(diào)各表中的研發(fā)費(fèi)用數(shù)據(jù)，以減少不一致之處。

2、如果因特殊情況導(dǎo)致無(wú)法完全一致，應(yīng)出具合理的說(shuō)明材料。企業(yè)可以在申報(bào)材料中附上說(shuō)明，解釋導(dǎo)致三表不一致的原因，并提供相關(guān)的支持文件和證明材料。

需要注意的是，三表一致并不是高新申報(bào)的必要條件，只要能夠合理解釋不一致的原因并提供相應(yīng)的說(shuō)明材料，不會(huì)影響高新申報(bào)的通過(guò)率。在實(shí)際操作中，企業(yè)可以與相關(guān)部門進(jìn)行溝通，確保符合規(guī)定的研發(fā)費(fèi)用得到合理的認(rèn)可和歸集。