看懂復(fù)雜的信號(hào)通路,組會(huì)上讓導(dǎo)師刮目相看
很多醫(yī)生一聽(tīng)到基礎(chǔ)研究就開(kāi)始頭疼,如今想發(fā)文章就得研究分子機(jī)制,攻克信號(hào)通路大關(guān),不免仰天長(zhǎng)嘆:“難道要逼我和馮唐一樣放棄這個(gè)職業(yè)嗎?就沒(méi)人同情我忙于臨床?到底如何能最短的時(shí)間入門(mén)呢?”
話說(shuō)師兄教了我信號(hào)通路入門(mén)的超實(shí)用秘訣,絕對(duì)屬于秒殺所有科研屌絲和部分學(xué)霸的技能,今天放送給大家。研一的時(shí)候,去老板辦公室確定我的課題,他說(shuō)讓我研究X信號(hào)通路在肝癌中的發(fā)病機(jī)制,先看文獻(xiàn)下次組會(huì)隨便講講。這個(gè)“隨便”把我嚇得當(dāng)場(chǎng)就暈過(guò)去了,老板直接把我扔出了辦公室,砸到地板磚驚醒后我立馬就去抱實(shí)驗(yàn)室博士師兄大腿:

可怕的信號(hào)通路?
雖說(shuō)我當(dāng)時(shí)是研究生小白,但好歹跟著聽(tīng)了幾次組會(huì)。師兄師姐講的那些信號(hào)通路在我眼中完全無(wú)跡可尋,全部錯(cuò)綜復(fù)雜不說(shuō),同一個(gè)通路中既有好鳥(niǎo)又有壞蛋,還特么特別不專情。就說(shuō)這P53信號(hào)通路吧,只在細(xì)胞周期過(guò)程中發(fā)威就算了,還跟細(xì)胞凋亡、細(xì)胞自噬、細(xì)胞代謝、DNA修復(fù)等過(guò)程緊密相關(guān);再說(shuō)一個(gè)通路上下游那么多因子,我哪知道是誰(shuí)出了問(wèn)題(當(dāng)時(shí)還不知道要先測(cè)序或者做預(yù)實(shí)驗(yàn)),所以我大腦中的信號(hào)通路完全這個(gè)樣子:

信號(hào)通路裝逼之三大秘訣
好在師兄是頗有經(jīng)驗(yàn)豐富的老司機(jī),在我答應(yīng)下面一個(gè)月承包他所有的細(xì)胞換液、傳代工作后(還好只放心把這部分交給我),詭異的一笑:你當(dāng)我們每次組會(huì)ppt上放的通路圖我們自己都記得住啊,只是撐場(chǎng)面的好么!實(shí)際上是這樣的:?

但老板還是要“應(yīng)付”的,他在組會(huì)上隨便問(wèn)你個(gè)問(wèn)題就能套你老底了。比如:你實(shí)驗(yàn)順利的話下游還準(zhǔn)備檢測(cè)哪幾個(gè)marker?往上游還可以怎么設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)?或者直接讓你把這個(gè)通路在肝癌中的研究背景介紹一下。小編你別抖啊,怕啥,你只要記住下面這幾大秘訣,我就能包你對(duì)(xue)答(hui)如(hu)流(you)!
Tip1:記住幾個(gè)大小BOSS
大Boss是誰(shuí)?是不是總是聽(tīng)到一些很牛逼的分子,比如p53、mTOR、Hippo······大Boss們都是處于信號(hào)中心,動(dòng)一發(fā)牽全身,所以信號(hào)通路常常會(huì)以它們命名。還有些大Boss會(huì)強(qiáng)強(qiáng)聯(lián)手組成一個(gè)信號(hào)通路的核心,比如TGF-β/Smad、Jak/Stat、PI3K/Akt、MAPK/ERK等。
有些小Boss也是要記的,因?yàn)槿思彝瑯庸δ軓?qiáng)大,以它們?yōu)橹鹘堑南嚓P(guān)文獻(xiàn)堆積成山,是傳說(shuō)中的明星分子,比如:BCL-2、BAX、PTEN、CDK4、caspase系列、KRAS、FOXO1等(不勝枚舉)。其余小嘍啰們(大Boss遙遠(yuǎn)的上下游蛋白),如果不是你研究的對(duì)象或者研究對(duì)象直接上下游,不要太care,除了蛇精病沒(méi)人讓你背出來(lái)!
Tip2:向大小BOSS上下游延展
所謂研究機(jī)制,入門(mén)級(jí)的無(wú)非是A-B-C三個(gè)分子之間(A調(diào)控B,C是B的底物)的相互關(guān)系,例如A在X細(xì)胞中的作用是依賴B和C的,敲除A后BC表達(dá)發(fā)生改變,用BC的抑制劑或者激活劑可以改變A敲除的效果等等。作為小白,小編建議你首先要選定自己研究的某個(gè)BOSS或者小嘍啰,然后以它們?yōu)橹行?,向上下游“開(kāi)火”。
比如老板讓你研究A,這里以抑癌基因FOXO1在肝癌細(xì)胞凋亡過(guò)程中的機(jī)制為例,要知道FOXO1正好處于處于PI3K/Akt和MAPK/ERK兩條信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路的匯聚點(diǎn):?

這時(shí)候關(guān)鍵的是確定B和C,做了相關(guān)芯片的可以去找表達(dá)差異基因是否處在這兩個(gè)通路中,窮X的實(shí)驗(yàn)室可能就得手動(dòng)大批量qRT-PCR了。
Tip3:實(shí)力裝逼
所謂裝逼,裝的好的是學(xué)霸,裝的不好的惹人笑話。別怕,小編給大家送福利來(lái)助攻各位實(shí)力裝逼:
《醫(yī)學(xué)信號(hào)通路圖解》,通過(guò)一張美觀的通路機(jī)制圖,可以讓我們形象直觀地理解復(fù)雜的通路機(jī)制網(wǎng)圖。而本書(shū)通過(guò)對(duì)一張張圖的解讀,將通路機(jī)制涉及相關(guān)知識(shí)點(diǎn)進(jìn)行拓展和歸納總結(jié),直觀和深刻地將相關(guān)通路機(jī)制的研究和應(yīng)用進(jìn)展傳達(dá)給大家。幫助大家簡(jiǎn)單高效地了解各種通路機(jī)制。


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