Eddie Cano-Gamez和同事如今推出了SepstratifieR系統(tǒng)，這是一種機(jī)器學(xué)習(xí)工具，它能對(duì)各種細(xì)菌和病毒感染所致的敗血癥患者進(jìn)行層級(jí)劃分與分類(lèi)。

敗血癥仍然是一個(gè)重大的健康負(fù)擔(dān)，它每年在全世界會(huì)導(dǎo)致1100萬(wàn)人死亡?？茖W(xué)家們正在尋找可以對(duì)患者群體進(jìn)行分類(lèi)并預(yù)測(cè)個(gè)體結(jié)局有幫助的新工具和生物標(biāo)記物，因?yàn)樗鼈兓蚰転橹委熡?jì)劃提供信息。
然而，此前很難對(duì)敗血癥患者進(jìn)行層級(jí)劃分，因?yàn)閿⊙Y可由許多不同的細(xì)菌和病毒感染所致。此外，許多嚴(yán)重感染患者并不符合敗血癥的診斷標(biāo)準(zhǔn)，對(duì)這一較大患者群體的生物標(biāo)志物和預(yù)測(cè)因子的研究一直滯后。

該研究團(tuán)隊(duì)首先查驗(yàn)了3149個(gè)血液樣本的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)，這些樣本采自由肺炎或腹膜炎所致的敗血癥患者。通過(guò)將這些數(shù)據(jù)整合到基因表達(dá)圖中，科學(xué)家們成功地推導(dǎo)出了一個(gè)敗血癥評(píng)分工具，該工具能判斷基因特征和免疫功能障礙等可以幫助預(yù)測(cè)患者結(jié)局的臨床特征。
當(dāng)應(yīng)用于多個(gè)敗血癥或其他感染患者群組（包括兒科敗血癥患者和新冠肺炎或流感患者）時(shí)，SepstratifieR可根據(jù)疾病的嚴(yán)重程度將患者正確地劃分至與臨床相關(guān)的群組。
Cano-Gamez等人判斷：“SepstratifieR可以改善對(duì)免疫功能障礙的風(fēng)險(xiǎn)估計(jì)和臨床結(jié)果，并為設(shè)計(jì)臨床試驗(yàn)提供信息，從而使我們更接近于對(duì)嚴(yán)重感染進(jìn)行精準(zhǔn)治療?！?/span>

如下是此研究中使用的所有公開(kāi)可用的基因表達(dá)數(shù)據(jù)集列表，用于模型訓(xùn)練或結(jié)果驗(yàn)證。所有數(shù)據(jù)集均由全血轉(zhuǎn)錄組組成。

作者采用了提取RNA，分別用Q-PCR ，芯片，和RNA-Seq，三個(gè)方式進(jìn)行了檢測(cè)， 如下表:

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如下是客戶的整個(gè)科研思路，作者通過(guò)將這些數(shù)據(jù)整合到基因表達(dá)圖中，科學(xué)家們成功地推導(dǎo)出了一個(gè)敗血癥評(píng)分工具，該工具能判斷基因特征和免疫功能障礙等可以幫助預(yù)測(cè)患者結(jié)局的臨床特征。

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