【分子】0.1-0.2 CRISPR簡(jiǎn)介&組成


——CRISPR is a technology that can be used to edit genes and, as such,?
will likely change the world.
一、名詞解釋:CRISPR-Cas系統(tǒng)
????????CRISPR是規(guī)律間隔成簇短回文重復(fù)序列的簡(jiǎn)稱,廣泛存在于細(xì)菌和古菌的基因組中,是其免疫系統(tǒng)的組成部分。該系統(tǒng)由由CRISPR陣列與Cas基因家族組成,其中,CRISPR陣列由高度保守的重復(fù)序列與間隔序列的間隔排列組成,上游有負(fù)責(zé)其轉(zhuǎn)錄的前導(dǎo)序列;Cas基因家族即CRISPR相關(guān)蛋白基因,高度保守,其編碼的Cas蛋白擁有能夠切割DNA雙鏈 的結(jié)構(gòu)域。CRISPR陣列中,重復(fù)序列中包含的回文結(jié)構(gòu)可形成保守的RNA二級(jí)結(jié)構(gòu),能夠與Cas蛋白結(jié)合形成復(fù)合物,共同發(fā)揮作用。

二、CRISPR-Cas系統(tǒng)的組成
1.CRISPR陣列:前導(dǎo)序列、重復(fù)序列和間隔序列
(1)前導(dǎo)序列:通常位于CRISPR基因座上游,富含A-T堿基對(duì),可作為啟動(dòng)子啟動(dòng)下游重復(fù)序列與間隔序列的轉(zhuǎn)錄,其轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物為 CRISPR RNA(crRNA)。
(2)重復(fù)序列:由21-48 bp高度保守的核苷酸構(gòu)成,其轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物能形成發(fā)卡結(jié)構(gòu)。
(3)間隔序列:源于外源病毒基因組或質(zhì)粒DNA序列,由26-72 bp核苷酸構(gòu)成,可作為抵御外源核酸入侵時(shí)的抗原。當(dāng)含有同源序列的病毒或質(zhì)粒再次入侵時(shí),能夠引發(fā)細(xì)菌或古菌的獲得性免疫反應(yīng),從而切斷外源核酸。
2.Cas相關(guān)蛋白基因
????????Cas相關(guān)蛋白基因編碼Cas蛋白,其主要功能為外源基因組的捕獲與切割。根據(jù)不同的CRISPR系統(tǒng),Cas相關(guān)蛋白基因分為兩大類型:Class I和Class II。
(1)Class I約占90%,廣泛存在于細(xì)菌和古菌中,其發(fā)揮作用時(shí)需不同效應(yīng)蛋白組成的多聚體共同作用。
????????基于效應(yīng)蛋白家族的不同,Class I系統(tǒng)可分為3種類型(Type I、Type III和Type IV)和12種亞型(I-A、I-B、I-C、I-D、I-E、I-F、I-U、III-A、III-B、III-C、III-D和IV)
(2)Class II約占10%,主要存在于細(xì)菌中,只需單一的Cas效應(yīng)蛋白即可對(duì)外源的核酸序列進(jìn)行識(shí)別和切割。
????????基于效應(yīng)蛋白家族的不同,Class II系統(tǒng)可分為三種類型(Type II、Type V和Type VI)和九種亞型(II-A、II-B、II-C、V-A、V-B、V-C、V-U、VI-A、VI-B 和 VI-C)
