歡迎各位來到“circRNA研究報道匯總”欄目，本期從pubmed中檢索收集最新（20230206-0212）發(fā)布的circRNA文獻共計22篇，下面我們一起來看看，circRNA研究最近有哪些新進展。

檢索式：(circRNA[Title/Abstract]) OR circular RNA[Title/Abstract]

01.病毒誘導(dǎo)的環(huán)狀RNA維持卡波西肉瘤皰疹病毒的潛在感染

標題：A virus-induced circular RNA maintains latent infection of Kaposi's sarcoma herpesvirus

雜志：Proc Natl Acad Sci USA

影響因子：12.779

通訊作者：Joseph M Ziegelbauer（美國國家癌癥研究所）

背景：

環(huán)狀RNA（circRNAs）是單鏈、封閉的環(huán)狀RNA，與其他RNA或蛋白質(zhì)結(jié)合以調(diào)節(jié)其功能。circRNA在病毒感染過程中的重要性在很大程度上是難以捉摸的。在這里，作者鑒定了一種circRNA，hsa_cir_0001400，在感染包括卡波西肉瘤皰疹病毒（KSHV）在內(nèi)的各種致病性病毒時被誘導(dǎo)，并控制病毒和人類基因的表達，從而使感染的人類細胞產(chǎn)生更少的病毒，但細胞生長更好。KSHV有兩個階段：潛伏循環(huán)和溶解循環(huán)。circ_0001400使細胞偏向于潛伏周期，在潛伏周期中，病毒只表達有限數(shù)量的基因，以在宿主的生命中存活。我們的結(jié)果揭示了一種新的病毒-宿主相互作用，通過circRNA來維持感染致癌病毒后的潛伏期。

綜上所述，作者鑒定了一種促生長和抗裂解復(fù)制的circRNA。這些結(jié)果支持KSHV誘導(dǎo)circ_0001400表達以維持延遲的模型。由于circ_0001400是由多種病毒誘導(dǎo)的，這種新的病毒策略可能被其他病毒廣泛采用。

02.HNRNPL誘導(dǎo)的circFAM13B通過IGF2BP1/PKM2途徑抑制糖酵解增加膀胱癌癥免疫治療敏感性

標題：HNRNPL induced circFAM13B increased bladder cancer immunotherapy sensitivity via inhibiting glycolysis through IGF2BP1/PKM2 pathway

雜志：J Exp Clin Cancer Res

影響因子：12.658

通訊作者：楊海偉（南京醫(yī)科大學第一附屬醫(yī)院）

背景：

膀胱癌（BCa）患者對免疫治療的反應(yīng)率仍然相對較低?？紤]到circRNA的穩(wěn)定存在和在腫瘤代謝中的重要功能，circRNA在調(diào)節(jié)免疫逃逸和免疫治療敏感性中的作用正受到越來越多的關(guān)注。

對五對BCa樣品進行circRNA（circRNA）測序，并篩選出circFAM13B（hsa_cir_0001535），因為其在BCa中的表達非常低。進行了進一步的mRNA測序，證實了circFAM13B與糖酵解過程和CD8+T細胞活化的關(guān)聯(lián)。circFAM13B的功能通過增殖試驗、糖酵解試驗、BCa細胞-CD8+T細胞共培養(yǎng)試驗和人免疫重建NOG小鼠中的腫瘤發(fā)生實驗得到驗證。進行生物信息學分析、RNA–蛋白質(zhì)下拉、質(zhì)譜、RNA免疫沉淀、熒光素酶報告物測定和熒光原位雜交，以驗證HNRNPL/cirFAM13B/IGF2BP1/PKM2級聯(lián)。

在BCa中觀察到circFAM13B的低表達，并且與BCa患者的腫瘤分期較低和預(yù)后較好呈正相關(guān)。circFAM13B可促進CD8+T細胞的功能，并可減弱BCa細胞的糖酵解作用，逆轉(zhuǎn)酸性腫瘤微環(huán)境（TME）。從機制上講，circFAM13B與IGF2BP1的KH3-4結(jié)構(gòu)域競爭性結(jié)合，隨后降低了IGF2BP1和PKM2 3’UTR的結(jié)合。因此，PKM2 mRNA的穩(wěn)定性降低，糖酵解誘導(dǎo)的酸性TME受到抑制。

03.大腦對新冠肺炎的反應(yīng)：腦脊液蛋白質(zhì)組、RNA和炎癥的分析

標題：The brain reacting to COVID-19: analysis of the cerebrospinal fluid proteome, RNA and inflammation

雜志：J Neuroinflammation

影響因子：9.587

通訊作者：Dirk Reinhold（德國馬格德堡奧托·馮·蓋里克大學）

背景：

新冠肺炎患者可能有各種神經(jīng)癥狀，但中樞神經(jīng)系統(tǒng)（CNS）在新冠肺炎中的積極參與尚不清楚。雖然新冠肺炎神經(jīng)系統(tǒng)癥狀患者的常規(guī)腦脊液（CSF）分析通常顯示沒有或只有輕度炎癥，但關(guān)于新冠肺炎患者CSF中炎癥介質(zhì)的更詳細數(shù)據(jù)卻很少。作者研究了新冠肺炎患者配對腦脊液和血清樣本的炎癥反應(yīng)（n=38）。單純皰疹病毒性腦炎（HSVE，n=10）患者和非炎性、非神經(jīng)退行性神經(jīng)疾病患者（n=28）作為對照。使用蛋白質(zhì)組學、酶聯(lián)免疫測定和半定量細胞因子陣列來表征炎癥蛋白。用基于細胞的測定和天然組織染色進行自身抗體篩選。對長非編碼RNA和環(huán)狀RNA進行RNA測序以研究轉(zhuǎn)錄組。

單蛋白水平的蛋白質(zhì)組學和隨后的通路分析顯示，與HSVE患者相比，新冠肺炎患者腦脊液中的炎癥變化類似但強烈減弱。重要的是，白介素-6、白介素-16和CXCL10 CSF/血清指數(shù)的計算表明，這些炎癥介質(zhì)從全身循環(huán)到達CSF，而不是在CNS內(nèi)產(chǎn)生?？贵w篩查未發(fā)現(xiàn)已知神經(jīng)元自身抗體的病理水平。將新冠肺炎患者分為有和無細菌重疊感染的患者，如降鈣素原水平升高所示，細菌重疊感染患者的炎癥標記物顯著升高（p<0.01）。腦脊液中的RNA測序顯示，101個線性RNA包含信使RNA，兩個circRNAs在新冠肺炎中的表達與非神經(jīng)炎癥對照組和神經(jīng)退行性疾病患者顯著不同。盡管存在SARS-CoV2感染相關(guān)的神經(jīng)系統(tǒng)癥狀，該文章的研究結(jié)果可能解釋了常規(guī)腦脊液檢測時沒有鞘內(nèi)炎癥的跡象。腦脊液中血液衍生炎癥介質(zhì)與神經(jīng)性新冠肺炎和新冠肺炎后癥狀的相關(guān)性值得進一步研究。

參考文獻列表

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