R可視化——ggplot2包繪制火山圖
2022-08-12 09:14 作者:科研那點(diǎn)事兒 | 我要投稿
火山圖(Volcano plot)是一種將統(tǒng)計(jì)測(cè)試中的統(tǒng)計(jì)顯著性量度(如p value)和變化幅度相結(jié)合,從而能夠幫助快速直觀地識(shí)別那些變化幅度較大且具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的數(shù)據(jù)點(diǎn)(基因等)的散點(diǎn)圖,因圖形與火山噴發(fā)相似而得名。
加載數(shù)據(jù)
數(shù)據(jù)主要由三行構(gòu)成——基因名稱列、Log2FoldChange(差異倍數(shù))、pvalue(p值)。

基本火山圖繪制

設(shè)置閾值并用不同顏色顯示
1、設(shè)置閾值
2、繪圖

3、添加輔助線

4、主題設(shè)置

添加標(biāo)簽

完整代碼及數(shù)據(jù)可在微信公眾號(hào)【科研后花園】后臺(tái)回復(fù)“火山圖”獲?。?/strong>
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