生物化學 藥立波 b站視頻配套 第二章:核酸的結(jié)構(gòu)與功能
第二章:核酸的結(jié)構(gòu)與功能
核酸:是以核苷酸為基本組成單位的生物信息大分子,具有復雜的結(jié)構(gòu)和重要的生物學功能。核酸可分為脫氧核糖核酸和核糖核酸兩大類。
第一節(jié):核酸的化學組成以及一級結(jié)構(gòu)
核酸-核苷酸=磷酸+核苷=堿基+核糖或脫氧核糖
核糖/脫氧核糖+堿基=核苷
核苷+磷酸=核苷酸
一:核苷酸是構(gòu)成核酸的基本組成單位
堿基:是構(gòu)成核苷酸的基本組分之一。堿基是含氮的雜環(huán)化合物,可分為嘌呤和嘧啶兩類。常見的嘌呤包括腺嘌呤,鳥嘌呤,常見的嘧啶包括尿嘧啶,胸腺嘧啶和胞嘧啶。堿基與核糖或脫氧核糖反應生成核苷。
二:DNA是脫氧核糖核苷酸通過3;5;-磷酸二酯鍵連接形成的大分子。
三:rna也是具有3;5;-磷酸二酯鍵的線性大分子
四:核酸的一級結(jié)構(gòu)是核苷酸的排列順序
核酸的一級結(jié)構(gòu):是構(gòu)成rna的核糖核苷酸或DNA的脫氧核糖核苷酸自5;-端至3;-端的排列順序。由于核苷酸之間的差異在于堿基的不同,因此核酸的一級結(jié)構(gòu)也就是它的堿基序列
第二節(jié):DNA的空間結(jié)構(gòu)與功能
DNA的空間結(jié)構(gòu):構(gòu)成DNA的所有原子在三維空間的相對位置關(guān)系是DNA的空間結(jié)構(gòu)。DNA的空間結(jié)構(gòu)可分為二級結(jié)構(gòu)和高級結(jié)構(gòu)
一:DNA的二級結(jié)構(gòu)是雙螺旋結(jié)構(gòu)
(一)DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)的實驗基礎(chǔ)
Chargaff規(guī)則:1.不同生物個體的DNA其DNA堿基組成不同。2.同一個個體不同器官或不同組織的DNA具有相同的堿基組成。3.對于一特定的生物體而言,腺嘌呤和胸腺嘧啶的摩爾數(shù)相等,而鳥嘌呤與胞嘧啶的摩爾數(shù)相等。
(二)DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)模型要點
1.DNA由兩條多聚脫氧核苷酸鏈組成:它們圍繞同一個螺旋軸形成右手螺旋,兩條鏈中的一條鏈的5;-3;方向是自上而下,而另一條鏈的5;-3;方向是自下而上的,呈現(xiàn)出反向平行的特征。
2.磷酸和核糖位于外側(cè):由脫氧核糖和磷酸基團構(gòu)成的親水性骨架位于雙螺旋結(jié)構(gòu)的外側(cè),而疏水堿基位于內(nèi)側(cè)
3.DNA雙鏈之間形成了互補堿基對:一條鏈上的腺嘌呤與另一條鏈上的胸腺嘧啶形成了兩個氫鍵,一條鏈上的鳥嘌呤和另一條鏈上的胞嘧啶形成了三個氫鍵
4.堿基對的疏水作用力和氫鍵共同維持著DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定。
(三)DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)的多樣性
(四)DNA的多鏈結(jié)構(gòu)
二:DNA的高級結(jié)構(gòu)是超螺旋結(jié)構(gòu)
超螺旋結(jié)構(gòu):由DNA雙鏈盤繞形成的空間構(gòu)象。當盤繞的方向與DNA雙螺旋方向相同時,其超螺旋結(jié)構(gòu)為正超螺旋,反之則為負超螺旋。
(一)原核生物的DNA環(huán)狀超螺旋結(jié)構(gòu)
(二)真核生物DNA以核小體為單位形成高度有序的致密結(jié)構(gòu)
核小體:是染色質(zhì)的基本組成單位,它是由DNA和五種組蛋白共同構(gòu)成的。兩分子的h2a,
H2b,h3和h4形成一個八聚體的組蛋白核心,長度約為150bp的DNA雙鏈在核心組蛋白八聚體上盤繞1.75圈形成核小體的核心顆粒。
端粒:是染色體末端膨大的顆粒狀結(jié)構(gòu),由染色體末端DNA和dna結(jié)合蛋白構(gòu)成。端粒DNA由簡單重復序列構(gòu)成,人的端粒重復序列富含鳥嘌呤(G),端粒在維持染色體結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定和維持復制過程中DNA的完整性方面有重要作用,還與衰老及腫瘤的發(fā)生發(fā)展有關(guān)。
三:DNA是遺傳信息的物質(zhì)基礎(chǔ)
DNA的功能:
DNA是生物遺傳信息的載體,并為基因復制和轉(zhuǎn)錄提供了模板,它是生命遺傳的物質(zhì)基礎(chǔ),也是個體生命活動的信息基礎(chǔ)。
第三節(jié):rna的結(jié)構(gòu)與功能
Rna的分類:mrna,tRNA,rrna
一:mrna是蛋白質(zhì)合成中的模板
1.真核生物mrna的5;-端有特殊的帽子結(jié)構(gòu)
功能:維持mrna的穩(wěn)定性,協(xié)同mrna從細胞核向細胞質(zhì)的轉(zhuǎn)運,以及在蛋白質(zhì)生物合成中促進核糖體和翻譯起始因子的結(jié)合
2.真核生物mrna的3;-端有多聚腺苷酸尾
功能:維持mrna的穩(wěn)定性,協(xié)同mrna從細胞核向細胞質(zhì)的轉(zhuǎn)運,以及翻譯起始的調(diào)控
3.mrna的堿基序列決定蛋白質(zhì)的氨基酸序列:
功能:Mrna為蛋白質(zhì)的生物合成提供模板
二:tRNA是蛋白質(zhì)合成中的氨基酸載體
1.tRNA含有多種稀有堿基
2.tRNA含有莖環(huán)結(jié)構(gòu)
3.tRNA的3;-端可連接氨基酸
4.tRNA的反密碼子能夠識別mrna的密碼子
三:以rrna為組分的核糖體是蛋白質(zhì)合成的場所
Rrna:是細胞內(nèi)含量最多的rna,rrna與核糖體蛋白共同構(gòu)成核糖體。
四:其他非編碼rna參與基因表達的調(diào)控
五:核酸在真核細胞和原核細胞中表現(xiàn)不同的時空特性
第四節(jié):核酸的理化性質(zhì)
一:核酸分子具有強烈的紫外吸收
嘌呤和嘧啶含有共軛雙鍵。因此,堿基,核苷,核苷酸,核酸在260nm處有紫外吸收的性質(zhì)
二:DNA變性是雙鏈解離為單鏈的過程
DNA變性:在某些物理和化學因素下,DNA的雙鏈互補堿基對之間的氫鍵發(fā)生斷裂,使DNA雙鏈解離為單鏈。在變性過程中,由于更多的共軛雙鍵得以暴露,含DNA的溶液在260nm處紫外吸收增加,稱為增色效應。
DNA復性:當變性條件緩慢除去后,兩條解離的互補鏈可重新互補配對,恢復原來的雙螺旋結(jié)構(gòu)。這一現(xiàn)象稱為復性。隨著DNA的復性,更少的共軛雙鍵暴露在外,含DNA的溶液在260nm處的紫外吸收降低,稱為減色效應。
Tm:在DNA變性解鏈的過程中,紫外吸收變化達到最大變化值一半時的溫度。Tm值與DNA的長短以及堿基的gc含量相關(guān)。Gc含量越高,tm值越大。
三:變性的核酸可以復性或形成雜交雙鏈
核酸雜交:如果將不同的DNA單鏈或rna放在同一溶液中,只要兩種核酸單鏈之間存在著一定程度的堿基配對關(guān)系,他們就有可能形成雜化雙鏈,這種現(xiàn)象稱為核酸雜交。核酸雜交可發(fā)生在DNA和DNA,rna和DNA或rna和rna之間。
第五節(jié):核酸酶
核酸酶:是所有可以水解核酸的酶。根據(jù)核酸酶底物的不同可以將其分為DNA酶和rna酶,依據(jù)對底物作用的方式可將核酸酶分為核酸外切酶和核酸內(nèi)切酶。
核酸酶的功能:
1.參與DNA的合成與修復以及rna合成后的剪接等重要的基因復制和基因表達的過程。
負責清除多余的、結(jié)構(gòu)和功能異常的核酸,同時也可以清除侵入細胞的外源性核酸。