R語言邏輯回歸分析連續(xù)變量和分類變量之間的“相關性“
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原文出處:拓端數據部落公眾號
?
比如說分類變量為是否幸存、是因變量,連續(xù)變量為年齡、是自變量,這兩者可以做相關分析嗎?兩者又是否可以做回歸分析?
我們考慮泰坦尼克號數據集,
titanic = titanic[!is.na(titanic$Age),]
attach(titanic)
?考慮兩個變量,年齡x(連續(xù)變量)和幸存者指標y(分類變量)
X = ?Age
Y = ?Survived
?年齡可能是邏輯回歸中的有效解釋變量,
summary(glm(Survived~Age,data=titanic,family=binomial))
Coefficients:
Estimate Std. Error z value Pr(>|z|)
(Intercept) -0.05672 0.17358 -0.327 0.7438
Age -0.01096 0.00533 -2.057 0.0397 *
---
Signif. codes: 0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1
(Dispersion parameter for binomial family taken to be 1)
Null deviance: 964.52 on 713 degrees of freedom
Residual deviance: 960.23 on 712 degrees of freedom
AIC: 964.23
?此處的顯著性檢驗的p值略低于4%。實際上,可以將其與偏差值(零偏差和殘差)相關聯(lián)。

而

在x毫無價值的假設下,D_0趨于具有1個自由度的χ2分布。我們可以計算似然比檢驗的p值自由度,
1-pchisq(
[1] 0.03833717
?與高斯檢驗一致。但是如果我們考慮非線性變換
glm(Survived~bs(Age)
Coefficients:
Estimate Std. Error z value Pr(>|z|)
(Intercept) 0.8648 0.3460 2.500 0.012433 *
bs(Age)1 -3.6772 1.0458 -3.516 0.000438 ***
bs(Age)2 1.7430 1.1068 1.575 0.115299
bs(Age)3 -3.9251 1.4544 -2.699 0.006961 **
---
Signif. codes: 0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1
(Dispersion parameter for binomial family taken to be 1)
Null deviance: 964.52 on 713 degrees of freedom
Residual deviance: 948.69 on 710 degrees of freedom
Age的p值更小,似乎“更重要”
[1] 0.001228712
為了可視化非零相關性,可以考慮給定y = 1時x的條件分布,并將其與給定y = 0時x的條件分布進行比較,
Two-sample Kolmogorov-Smirnov test
data: X[Y == 0] and X[Y == 1]
D = 0.088777, p-value = 0.1324
alternative hypothesis: two-sided
?即p值大于10%時,兩個分布沒有顯著差異。
v= seq(0,80
v1 = Vectorize(F1)(vx)
?

我們可以查看密度

?
另一種方法是離散化變量x并使用Pearson的獨立性檢驗,
table(Xc,Y)
Y
Xc 0 1
(0,19] 85 79
(19,25] 92 45
(25,31.8] 77 50
(31.8,41] 81 63
(41,80] 89 53
Pearson's Chi-squared test
data: table(Xc, Y)
X-squared = 8.6155, df = 4, p-value = 0.07146
?p值在此處為7%,分為年齡的五個類別。實際上,我們可以比較p值
pvalue = function(k=5){
LV = quantile(X,(0:k)/k)
plot(k,p,type="l")
abline(h=.05,col="red",lty=2)
?

?
只要我們有足夠的類別,P值就會接近5%。實際上年齡在試圖預測乘客是否幸存時是一個重要的變量。

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