Holliday交叉(Holliday Junction)是以英國(guó)生物學(xué)家Robin Holliday的姓氏命名的一種發(fā)生在DNA分子之間的"交叉"(Crossing-Over)結(jié)構(gòu)。

1964年Robin Holliday推測(cè)，參與同源重組的DNA分子之間通過(guò)形成“交叉”作為"中間體"，并造成彼此之間的交換。后來(lái)這一推測(cè)得到證實(shí)，因此，同源重組DNA分子雙方的交叉被定名為Holliday Junction。

Holliday交叉的形成是同源重組進(jìn)行到第二個(gè)階段的重要標(biāo)志。整個(gè)過(guò)程是需要酶催化。在原核生物細(xì)胞中需要RecA和RuvAB等蛋白質(zhì)的催化，而在真核生物細(xì)胞中則是RAD51等。RecA負(fù)責(zé)催化“鏈交換”，形成“交叉”，之后，可以利用其“分支遷移”催化活性穩(wěn)固所建立的“交叉”，之后RuvAB的解旋酶活性可進(jìn)一步促進(jìn)“交叉”向縱深方向移動(dòng)，形成更加穩(wěn)固的“十字交叉”，RuvAB可"推動(dòng)”Holliday交叉沿整個(gè)基因組分子移動(dòng)（原核）。Holliday交叉又包括兩種形式，一種是“十字交叉”，一種則是“T交叉”（Three-way Junction)。Holliday交叉必需得到精確的拆分，否則會(huì)妨礙DNA分子向子代細(xì)胞內(nèi)的分配。人群中出現(xiàn)的染色體三體綜合征就是因?yàn)樵跍p數(shù)分裂同源重組過(guò)程中同源染色體之間形成的“交叉”沒(méi)有被拆所致。這個(gè)過(guò)程被稱(chēng)為Non-disjunction。