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百篇單細(xì)胞測(cè)序領(lǐng)域文章集

2022-10-26 09:41 作者:上海歐易生物  | 我要投稿

截至2022年10月,助力發(fā)表超過(guò)百篇單細(xì)胞文章,平均影響因子12+,總影響因子1200+,發(fā)表文章中致謝公司77次,作者署名5篇(含共同一作),可謂碩果累累。


博觀(guān)而約取,厚積而薄發(fā)。四年間,累計(jì)完成1500+個(gè)服務(wù)項(xiàng)目、15000+例樣本的單細(xì)胞解離與測(cè)序。樣本類(lèi)型涵蓋人、大/小鼠、羊、兔、猴、魚(yú)、雞、蟹、蜘蛛等400余種不同的動(dòng)物組織類(lèi)型以及擬南芥、水稻、玉米、棉花、大豆、小麥、番茄、茶樹(shù)、桑樹(shù)、楊樹(shù)及藥用植物等50余種植物樣本。將單細(xì)胞技術(shù)在農(nóng)林牧漁等諸多領(lǐng)域的廣泛應(yīng)用不斷推向深入。


《百篇單細(xì)胞客戶(hù)文章集》,匯總了助力發(fā)表的超百篇單細(xì)胞文章,內(nèi)容翔實(shí),包括期刊、影響因子以及部分文獻(xiàn)解讀。每篇文章都凝聚著客戶(hù)和歐易人的努力與心血,都見(jiàn)證著與客戶(hù)互動(dòng)、共同探索生命未知的愉悅歷程,都記錄著單細(xì)胞事業(yè)部不斷發(fā)展壯大的重要時(shí)刻,照耀著歐易人不斷奮進(jìn)前行和美好的前程。


同時(shí)這本“秘籍”能方便讀者快速查閱相關(guān)文章,也將幫助讀者更深入的了解歐易的單細(xì)胞組學(xué)服務(wù),更好掌握單細(xì)胞文章不同類(lèi)型的寫(xiě)作方法,是在單細(xì)胞論文撰寫(xiě)途中的“通關(guān)寶典”,靈感枯竭時(shí)翻看沒(méi)準(zhǔn)可以得到意外的驚喜哦~


百篇單細(xì)胞文章是個(gè)了不起的成就,但也僅僅是起點(diǎn),隨著研究的深入,更多的生物學(xué)問(wèn)題需要我們和客戶(hù)一同探索,我們也愿意和客戶(hù)一起相互并肩,成就彼此,用優(yōu)質(zhì)的服務(wù)將成果快速轉(zhuǎn)化。

期待下一個(gè)百篇甚至千篇文章的快速到來(lái)!


Global Dynamic Molecular Profiling of? Stomatal? Lineage? Cell? Development? by? Single-Cell? RNA? Sequencing

【發(fā)表時(shí)間】:2020.10.6

【發(fā)表期刊】:Mol Plant

【影響因子】:21.949

【合作單位】:河南大學(xué)

【主要研究?jī)?nèi)容】:本研究首次對(duì)擬南芥氣孔譜系細(xì)胞發(fā)育過(guò)程進(jìn)行了單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析,鑒定了氣孔發(fā)育過(guò)程中各細(xì)胞類(lèi)群顯著表達(dá)的 marker gene,并分析了其所參與的 GO 功能。為了分析氣孔細(xì)胞早期發(fā)育階段的基因表達(dá)調(diào)控機(jī)制,構(gòu)建了氣孔分生母細(xì)胞中基因表達(dá)的轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。進(jìn)一步通過(guò)分析所鑒定的標(biāo)記基因和轉(zhuǎn)錄因子的擬南芥突變體的氣孔發(fā)育表型,確定了這些基因在調(diào)控氣孔發(fā)育中所扮演的重要角色。本研究,為利用單細(xì)胞RNA-測(cè)序技術(shù)在鑒定新的標(biāo)記基因,以及解析氣孔譜系細(xì)胞發(fā)育的調(diào)控機(jī)制提供了新的研究思路和技術(shù)體系。


Topological analysis of hepatocellular carcinoma tumour microenvironment based on imaging mass cytometry reveals cellular neighbourhood regulated reversely by macrophages with different ontogeny

【發(fā)表時(shí)間】:2021.7.12

【發(fā)表期刊】:Gut

【影響因子】:31.793

【合作單位】:浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院

【主要研究?jī)?nèi)容】:通過(guò)成像質(zhì)譜流式細(xì)胞儀檢測(cè) HCC,建造了第一個(gè)且最大的單細(xì)胞病理學(xué)景觀(guān)庫(kù);確定了三種主要類(lèi)型的腫瘤內(nèi)區(qū)域,具有不同的腫瘤、基質(zhì)和免疫細(xì)胞分布模式;揭示了許多與患者臨床結(jié)果相關(guān)的區(qū)域細(xì)胞功能單元;Kupffer細(xì)胞和浸潤(rùn)巨噬細(xì)胞反向調(diào)節(jié)區(qū)域免疫;發(fā)現(xiàn)了Kupffer細(xì)胞的消耗大大增加了浸潤(rùn)性巨噬細(xì)胞的數(shù)量,減少了肝臟腫瘤的生長(zhǎng);Kupffer細(xì)胞特異性靶向可作為一種新型免疫治療藥物肝癌治療的方法。



Single-cell RNA-seq and chromatin accessibility profiling decipher the heterogeneity of mouse γ δ T cells

【發(fā)表時(shí)間】:2021.11.16

【發(fā)表期刊】:Science Bulletin

【影響因子】:20.577

【合作單位】:暨南大學(xué)/珠海人民醫(yī)院

【主要研究?jī)?nèi)容】:本文作者對(duì)小鼠胸腺、脾臟和淋巴結(jié)中的γ δ T細(xì)胞開(kāi)展了單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄和染色質(zhì)開(kāi)放性組學(xué)分析,系統(tǒng)性解析了其異質(zhì)性。作者發(fā)現(xiàn)經(jīng)典的γ δ T1(IFN-γ+)和T17(IL-17A+)亞群內(nèi)部也存在顯著的異質(zhì)性并推斷了其潛在調(diào)控機(jī)制。通過(guò)對(duì)胸腺γ δ T細(xì)胞進(jìn)行擬時(shí)序分析,作者構(gòu)建了其發(fā)育軌跡。有意思的是,作者發(fā)現(xiàn)胸腺中存在一群獨(dú)立于T1和T17的新亞群GZMA+ γ δ T細(xì)胞,并且發(fā)現(xiàn)該亞群具有前體細(xì)胞特征。作者還通過(guò)SCENIC分析、轉(zhuǎn)錄因子識(shí)別基序富集發(fā)現(xiàn)了一個(gè)新的γ δ T17轉(zhuǎn)錄抑制因子NR1D1,并利用基因敲除小鼠進(jìn)行了驗(yàn)證。綜上,本文構(gòu)建了小鼠γ δ T單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄圖譜單細(xì)胞染色質(zhì)開(kāi)放性圖譜,為深入解析γ δ T細(xì)胞異質(zhì)性和亞群調(diào)控機(jī)制提供了寶貴的資源庫(kù)。



A mechanosensitive lipolytic factor in the bone marrow promotes osteogenesis and lymphopoiesis

【發(fā)表時(shí)間】:2022.6.15

【發(fā)表期刊】:Cell Metabolism

【影響因子】:31.373

【合作單位】:中南大學(xué)湘雅醫(yī)院

【主要研究?jī)?nèi)容】:本文作者通過(guò)對(duì)關(guān)于運(yùn)動(dòng)促進(jìn)骨形成和免疫的原創(chuàng)性研究成果,揭示骨髓巨噬細(xì)胞在運(yùn)動(dòng)后分泌豐富的reticulocalbin-2(RCN2),RCN2作為一種脂解因子結(jié)合脂肪細(xì)胞受體復(fù)合物Neuropilin-2/Intergrin-b1啟動(dòng)骨髓脂肪脂解,為淋巴生成和骨形成提供能量,并且RCN2重組蛋白能顯著改善小鼠骨丟失和淋巴細(xì)胞生成下降的表型。



Single-cell atlas of keratoconus corneas revealed aberrant transcriptional signatures and implicated mechanical stretch as a trigger for keratoconus pathogenesis

【發(fā)表時(shí)間】:2022.7.12

【發(fā)表期刊】:Cell Discovery

【影響因子】:38.079

【合作單位】:山東第一醫(yī)科大學(xué)

【主要研究?jī)?nèi)容】:作者系統(tǒng)地研究了圓錐角膜和健康角膜樣本之間的細(xì)胞類(lèi)型特異性轉(zhuǎn)錄組,證實(shí)了角膜基質(zhì)細(xì)胞在該疾病中的關(guān)鍵作用。研究證明了角膜基質(zhì)細(xì)胞的細(xì)胞外基質(zhì)降解在該疾病中的重要作用,揭示了“機(jī)械力—力學(xué)信號(hào)—蛋白酶”作用軸在促進(jìn)圓錐角膜進(jìn)展中的重要作用,為“揉眼可加劇圓錐角膜”的臨床現(xiàn)象提供了解釋。此外,角膜上皮病變、免疫細(xì)胞中炎癥信號(hào)的增強(qiáng)以及細(xì)胞間通訊失調(diào)也參與了圓錐角膜的形成。以上發(fā)現(xiàn)為圓錐角膜基礎(chǔ)研究、深入理解圓錐角膜等擴(kuò)張性疾病的發(fā)病機(jī)制提供了重要的數(shù)據(jù)資源和理論參考,更為該疾病的預(yù)防和診療提供了理論依據(jù)。




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