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看來傳統(tǒng)材料計算方法真的要淘汰了!原來材料計算可以這么方便?!

2021-09-17 16:57 作者:邁高科技  | 我要投稿

上篇文章, 我們整理了傳統(tǒng)地, 開始材料計算前, 需要做的準備:

由圖可見,傳統(tǒng)地,? 在正式開始計算前要購置服務器、服務器定期維護、熟練掌握Linux操作系統(tǒng)、安裝軟件、學習計算模擬理論知識、掌握各種后處理軟件至少需要半年的準備時間,然而后期對服務器的維護也需要耗費一定的精力時間寶貴,如何將有限的時間運用到做計算中成為提高科研效率的關鍵.?
其實, 我們可以從如下三個方面來進行材料計算的“加速”
我們以石墨烯吸附COOH分子為例展示平臺是如何進行計算并得到體系的能帶和態(tài)密度。
(1)首先是上傳結構。MatCloud+支持多種格式文件的上傳,如果您需要使用VASP進行計算,直接上傳cif格式也是可以的,平臺會自動將其轉變?yōu)镻OSCAR文件。


(2) 然后是建模。MatCloud+的建模功能可以輕松的實現(xiàn)擴胞、切面、隨機取代、建立吸附構型等操作。對于本例中的石墨烯吸附構型我們可是使用【擴胞】以及【吸附建?!縼硗瓿伞?/span>首先對石墨烯結構進行擴胞來控制吸附濃度,創(chuàng)建工作流,將左側【通用導入組件】推拽到右側工作流搭建頁面,然后在建模中的【超晶胞(擴展原始晶胞)】拖拽到右側,點擊參數(shù)設置晶胞擴展的倍數(shù),設置成功后保存提交任務,此過程不需要超算核實,很快便可完成;


然后將擴胞完成的結構導出到結構集,創(chuàng)建新的工作流,將左側【通用導入組件】推拽到右側工作流搭建頁面,然后在建模中的【吸附建模(分子)】拖拽到右側,在設置中進行簡單的參數(shù)設置,保存之后提交任務便可得到一個石墨烯吸附COOH分子的結構。將結構導入結構集以備進行計算。

(3) 計算過程。不同于傳統(tǒng)的計算,MatCloud+中的參數(shù)都可以通過點選的形式進行設置,對于Linux的小白這是很友好的。
首先是搭建工作流,在這里我們添加【并行控制器】和【分支控制器】,這樣就可以同時進行能帶以及態(tài)密度的計算了。設置各組件參數(shù),之后保存提交任務。


(4) 在計算完成后我們點擊【能帶結構】組件的【查看結果】就得到了如下的頁面。不同于傳統(tǒng)計算需要對能帶結果進行復雜的后處理,能帶圖直接展示在頁面中,并且費米能級與帶隙的大小也以數(shù)值形式展示在頁面上。同樣的態(tài)密度的結果也不需要進行后處理,MatCloud+還支持PDOS的繪制。


如上的一系列操作之后我們的計算就結束了,總共耗時約20分鐘。相同的內(nèi)容我們以傳統(tǒng)方式進行處理、計算需要消耗的時間也列在下表中。? ? ? ? ? ? ? ??? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 表 1? MatCloud+, 與傳統(tǒng)方式開展材料計算的比較


? ? ? ? ? ? ??? ?MatCloud+, 與傳統(tǒng)方式開展材料計算的比較
可以發(fā)現(xiàn)在傳統(tǒng)的計算中中間的操作過程耗費了更多的時間,而這正是MatCloud+可以幫助您的地方——解放您的雙手,不需要進行重復的敲擊鍵盤,眾多操作只需要用鼠標點一點便可實現(xiàn),為您的計算過程進行“加速”,輕松實現(xiàn)高通量計算!它將計算模擬軟件、計算集群、數(shù)據(jù)庫、和模擬仿真一體化置于云端,用戶僅需一個網(wǎng)頁瀏覽器(只要有網(wǎng)絡便可以提交計算任務),通過鼠標的點擊便可開展高通量材料計算和篩選、數(shù)據(jù)管理、以及數(shù)據(jù)挖掘等。
MatCloud+材料云提供了集成的建模工具、工作流模板、數(shù)據(jù)庫、可視化展示、和云存儲,實現(xiàn)了材料計算作業(yè)的在線提交和監(jiān)控、結果分析,數(shù)據(jù)提取和數(shù)據(jù)存儲的自動化流程實現(xiàn)。
這為您大大減少了服務器制備、軟件安裝、后處理的時間。而且, 你不需要下載,安裝其它前處理, 后處理軟件.你只需要一個瀏覽器, 就能開展材料計算, 數(shù)據(jù) 和 AI的工作我們以后會推出用MatCloud+如何開展機器學習的文章,請大家關注,

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