眾所周知，利用組學技術進行研究時，數(shù)據(jù)的分析尤為重要。而在LC-MS數(shù)據(jù)分析中，可重復性、可追溯性和透明度(Reproducibility, traceability, and transparency)一直是LC-MS數(shù)據(jù)分析的長期存在的問題。雖然現(xiàn)在已經(jīng)開發(fā)了多種工具，但是他們仍然存在著局限性。

7月27日，Nature Communications日刊發(fā)布：TidyMass an object-oriented reproducible analysis framework for LC–MS data。

面向對象的LC-MS數(shù)據(jù)可重復分析計算框架，來自斯坦福大學遺傳系的研究成果。它成功解決LC-MS數(shù)據(jù)分析中可重復性、可追溯性和透明度的痛點，基于R語言的綜合計算框架，可以實現(xiàn)LC-MS數(shù)據(jù)的可追溯、可共享和可重復的數(shù)據(jù)處理和分析工作流程。TidyMass是一個共享底層設計理念、語法和數(shù)據(jù)結構的R包生態(tài)系統(tǒng)，它提供了一個全面的、可重現(xiàn)的和面向對象的計算框架。模塊化架構使TidyMass成為一個高度靈活和可擴展的工具，其他用戶可以改進并與其他工具集成以定制自己的管道。

TidyMass現(xiàn)在主要支持LC-MS的非靶向代謝組學的數(shù)據(jù)分析,也支持一部分的蛋白質組學的數(shù)據(jù)分析。后續(xù)開發(fā)者將繼續(xù)完善其用于蛋白質組學的全流程分析。

重磅來襲

百趣生物聯(lián)合此論文的兩位一作，斯坦福大學申小濤博士后與耶魯大學閆紅博士后，將開展為期5天的線上培訓班。帶領大家從質譜代謝組學數(shù)據(jù)基礎入手，一站式進行物質的定性定量，數(shù)據(jù)分析，數(shù)據(jù)清洗，預處理，常規(guī)統(tǒng)計建模以及通路分析。

此次培訓班課程由申小濤博士后和閆紅博士后全程指導教學，帶大家深入了解代謝組學在疾病和其他領域的應用前景，掌握R語言和TidyMass全流程的代謝組學數(shù)據(jù)分析和相關功能應用，對代謝組學的數(shù)據(jù)結構，數(shù)據(jù)分析和生物學意義，代謝物數(shù)據(jù)庫的建立和代謝物鑒定有更深入的了解。

講師介紹

申小濤? 博士后

斯坦福大學醫(yī)學院，主要研究方向為質譜數(shù)據(jù)生信軟件開發(fā)，多組學數(shù)據(jù)整合分析及其在精準醫(yī)學上的應用。

閆紅? 博士后

耶魯大學醫(yī)學院與公共衛(wèi)生學院，主要研究方向：質譜數(shù)據(jù)分析的方法；結直腸癌的代謝組學研究及其多組學分析；KRAS變異在結直腸癌中的性別差異；鐵死亡在結直腸癌中的代謝機制；機器學習在癌癥多組學分析中的應用。

優(yōu)惠福利

1早鳥福利：于9月16日前購買該課程，原價2199元現(xiàn)享早鳥優(yōu)惠價1999元/人！

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該活動優(yōu)惠可疊加使用！可疊加使用！即16號前團購滿5人該課程價格可低至1799元！

注：本次活動以到款時間計算優(yōu)惠！

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3在此微信公眾號后臺留言“姓名+單位+電話＋郵箱+課程”，我們將盡快與您取得聯(lián)系。

4發(fā)送郵件至marketing@biotree.cn，我們會盡快與您電話取得聯(lián)系。郵件標題“TidyMass線上課程”正文包含報名課程名稱及時間、姓名、電話及單位名稱。

注：1.本次培訓班實行人滿開班制哦~報名滿50人開班，100人滿員截止！請有意參加課程的老師及時聯(lián)系我們進行報名注冊！2.報名成功后以到款時間計算優(yōu)惠，不參與優(yōu)惠報名的老師也需在9月21日前付款到賬，為您保留名額哦~

Q基礎薄弱適合學習這門課程嗎？

A：課程設計是帶領大家從質譜代謝組學數(shù)據(jù)基礎入手，一站式進行物質的定性定量，數(shù)據(jù)分析，數(shù)據(jù)清洗，預處理，常規(guī)統(tǒng)計建模以及通路分析。只要認真上課問題不大哦~

Q線上在上課途中遇到問題怎么辦？

A：全程設置微信群答疑，講師親自解答。講課結束后亦可與講師開麥交流。

Q上課沒跟上，還能提供復習嗎？

A：當日課程結束后下午即提供視頻課程回放，隨時回顧，鞏固知識點。再也不怕忘記內容了。

Q對電腦配置有什么要求嗎？

A：8G以上運行內存皆可~

文獻下載鏈接：

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