繪制小提琴圖,GraphPad Prism 8一定行!
下載了GraphPad Prism 8后,迫不及待的體驗(yàn)了一下小提琴圖。之前使用傳統(tǒng)的柱狀圖遭遇過的坑,這次一定要一個(gè)個(gè)爬出來。
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以前作圖是這樣的,這樣的(小編都懷疑人生)
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再此用了一個(gè)動(dòng)畫來展示這個(gè)大坑,傳統(tǒng)的柱狀圖,數(shù)據(jù)可視化后易擠在一起,分布關(guān)系類似差異性不大。小提琴圖能夠同時(shí)展示數(shù)據(jù)的集中程度和離散程度,而柱狀圖則會(huì)丟失很多有關(guān)離散程度的信息。
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小提琴圖展示的是數(shù)據(jù)的分布形式,是箱線圖與核密度圖的結(jié)合。下面為大家介紹小提琴圖的繪制詳細(xì)步驟:
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1.打開Graphpad Prism 8.0,新版界面如下,在New table&graph下選擇Column,Data table下選擇Enter or import data a new table,Options下選擇Enter ?replaced values,stacked into columns,Create:
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2.在Data1中輸入數(shù)據(jù):
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在Graphs下,點(diǎn)擊Data1,Graph family下Column中選擇Box and violin,選擇小提琴圖:
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3.對(duì)小提琴圖進(jìn)行設(shè)置和美化
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顯示數(shù)據(jù)散點(diǎn):
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雙擊小提琴圖,F(xiàn)ormat Graph下將Plot:Violin plot only改為Violin plot ,Show all points(顯示所有數(shù)據(jù)點(diǎn)):
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顯示數(shù)據(jù)點(diǎn)如下:
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雙擊小提琴圖,F(xiàn)ormat Graph下Symbols可對(duì)數(shù)據(jù)點(diǎn)顏色和形狀以及大小進(jìn)行設(shè)置。在Violin plot對(duì)填充顏色及邊界厚度及顏色進(jìn)行設(shè)置,F(xiàn)ill pattern為不同的填充模式,同樣在Format Graph下可對(duì)四分位數(shù)及中位數(shù)進(jìn)行設(shè)置,設(shè)置參數(shù)包括顏色,線條模式,線條厚度最終得到如下效果:
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?4.標(biāo)記差異或文本
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Graphpad Prism 8.0中Draw下可以繪制Lines with text(上周我們提到的新功能),Lines with text有和獨(dú)特之處,即在連接線的正中間預(yù)設(shè)了一些常用的文本例如ns,以及差異標(biāo)記#及方框,這能夠方便我們?cè)谶B接線正中間添加文本,提高效率:
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?5.導(dǎo)出圖片
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GraphPad?Prism?8.0導(dǎo)出tiff圖片最大分辨率(dpi)可高達(dá)1200 dpi,對(duì)于導(dǎo)出圖像的大小GraphPad?Prism?8.0也有提高,Prism?7只能導(dǎo)出最大寬度達(dá)到11英寸tiff圖片,而GraphPad?Prism?8.0將最大寬度提升至25英寸。
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Graphpad Prism 8.0繪制小提琴的技巧就介紹到這,操作非常簡單,不會(huì)使用R語言繪制也可以繪制。關(guān)于Graphpad Prism 8.0更多使用方法技巧歡迎下方留言討論哦!
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