質(zhì)譜常見污染蛋白
因?yàn)橘|(zhì)譜的靈敏度高,外來引入的蛋白質(zhì)可能會(huì)影響樣品的質(zhì)譜分析結(jié)果,所以在準(zhǔn)備樣品時(shí)需要避免引入污染蛋白。百泰派克生物科技提供基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)鑒定、蛋白質(zhì)組學(xué)分析和蛋白質(zhì)測序等服務(wù)。
質(zhì)譜常見污染蛋白
在質(zhì)譜分析中,最常見的蛋白質(zhì)污染物包括角蛋白和血清白蛋白。其他質(zhì)譜(MS)蛋白污染物還包括酪蛋白和大腸桿菌蛋白質(zhì)。角蛋白是一種表皮結(jié)構(gòu)蛋白,存在于皮膚、頭發(fā)、指甲的外層,最終存在于灰塵中。人和牛角蛋白(一種常見的細(xì)胞培養(yǎng)試劑污染物)的大小在40-70kDa之間,在進(jìn)行抗體蛋白測序時(shí)該大小可能與測序的50 kDa抗體樣品重鏈相混淆。這樣,抗體樣品在凝膠中看起來可能是完美的,但是仍然具有角蛋白污染。牛血清白蛋白(BSA)在日常生命科學(xué)實(shí)驗(yàn)中被廣泛使用,從蛋白質(zhì)定量、western blot到PCR。酪蛋白是一種基于牛奶的蛋白質(zhì),在western blot過程中也會(huì)存在。大腸桿菌蛋白質(zhì)則是在目標(biāo)重組蛋白或抗體的純化實(shí)驗(yàn)中有時(shí)會(huì)被拉下來,從而造成樣品污染。

如何避免污染蛋白
在實(shí)驗(yàn)中,可以通過以下方法避免將上述蛋白質(zhì)污染物引入樣品:1. 保持實(shí)驗(yàn)室清潔、減少灰塵和空氣流動(dòng);2. 使用一次性過濾吸頭;3. 定期清洗電泳、染色、微量離心機(jī)等設(shè)備,避免通過接觸或氣溶膠引入污染物顆粒;4. 穿戴潔凈的實(shí)驗(yàn)服和手套。