醫(yī)學(xué)正交實驗案例
一、案例介紹
想要從某種草藥中提取植物酚,利用專業(yè)知識發(fā)現(xiàn)可能有三個條件會影響植物酚的提取,每個條件有三個水平,想要通過實驗,尋找植物酚的最佳提取條件,其中提取植物酚的參考標(biāo)準(zhǔn)為植物酚的含量(案例數(shù)據(jù)虛構(gòu),不具有實際參考意義,不需要考慮交互項)。數(shù)據(jù)如下:
二、問題分析
本案例分析的目的是想要尋找植物酚的最佳提取條件,并且有三個因素三個水平,如果一次實驗一次實驗進(jìn)行分析最后對比實驗結(jié)果,共需要進(jìn)行3*3*3=27次實驗,顯然,耗時較長,且效率不高,對此,為了解決該問題,可以使用正交實驗來完成,不僅可以節(jié)省大量時間,還可以高效率的得到實驗結(jié)果,至于想要尋找植物酚的最佳提取條件可以使用方差分析來研究。
三、軟件操作及結(jié)果解讀
(一) 正交表設(shè)計
1.軟件操作
分析的第一步需要進(jìn)行正交表的設(shè)計,利用SPSSAU可以快速得到正交表,進(jìn)入SPSSAU頁面,點擊醫(yī)學(xué)實驗/研究里的正交實驗,選擇因子個數(shù)以及每個因子水平數(shù),由于數(shù)據(jù)的因子個數(shù)為三個每個水平數(shù)為三,所以操作如下,最后點擊開始分析,如下:
2.設(shè)計結(jié)果
生成的正交表如下:
共有9次實驗,并且所得到的正交表滿足特點(每列中不同數(shù)字出現(xiàn)的次數(shù)相等,在任意2列其橫向組成的數(shù)字對中,每種數(shù)字對出現(xiàn)的次數(shù)相等)。得到的正交表可以上傳到SPSSAU系統(tǒng)內(nèi)進(jìn)行下一步分析。
(二) 數(shù)據(jù)導(dǎo)入
1.數(shù)據(jù)格式
將得到的正交表以及實驗數(shù)據(jù)進(jìn)行上傳分析,第一步需要整理正確的數(shù)據(jù)格式,需要上傳帶有標(biāo)簽的數(shù)據(jù),比如因子1中的數(shù)字1代表加水量為6,2代表加水量為8,以此類推。整理如下:
2. 導(dǎo)入數(shù)據(jù)
將整理好的數(shù)據(jù)導(dǎo)入到SPSSAU系統(tǒng)內(nèi),點擊頁面右上角“上傳數(shù)據(jù)”按鈕,點擊上傳文件,將數(shù)據(jù)進(jìn)行上傳即可,如下:
將數(shù)據(jù)上傳后進(jìn)行方差分析。結(jié)果如下:
(三) 方差分析
1. 軟件操作
方差分析又可以進(jìn)行細(xì)分。X的個數(shù)為一個時,我們稱之為單因素方差;X為2個時則為雙因素方差;X為3個時則稱作三因素方差,依次下去。當(dāng)X超過1個時,統(tǒng)稱為多因素方差。由于因變量是“含量”自變量是“加水量”、“時間”以及“次數(shù)”,所以使用三因素方差進(jìn)行分析。點擊進(jìn)階方法中的三因素方差分析→拖拽分析項→點擊開始分析。
2. 結(jié)果解讀
結(jié)果如下:
從三因素方差分析的結(jié)果可以得到,加水量呈現(xiàn)出顯著性(F=32.738,p=0.030<0.1) ,說明主效應(yīng)存在,次數(shù)(F=56.721,p=0.017
想要知道影響因素哪個水平最好,應(yīng)該怎么辦?可以通過繪制圖進(jìn)行直觀的查看或者通過事后多重比較進(jìn)行分析,由于繪制圖形比較直觀并且容易分析,所以本例子以繪制圖形進(jìn)行分析,結(jié)果如下:
橫坐標(biāo)為因子水平數(shù),從圖形中可以看出加水量為8L時最優(yōu),煎藥時間為1.5h最優(yōu),煎藥次數(shù)為2時最優(yōu),最優(yōu)組合為“加水量8l,時間為1.5h最優(yōu),含水量30%,煎藥次數(shù)為2次”。
四、結(jié)論
通過正交實驗得到三因素三水平的正交表,然后整理為正確的數(shù)據(jù)進(jìn)行上傳至系統(tǒng)內(nèi),進(jìn)行三因素方差分析,得到3個因素的主次關(guān)系是:“次數(shù)>加水量>時間”并且通過圖形得到最優(yōu)組合為“加水量8l,時間為1.5h最優(yōu),含水量30%,煎藥次數(shù)為2次”。
五、知識小貼士
(1)為什么數(shù)據(jù)做不了多因素方差分析?
正交表和多因素方差分析,二者完全獨立,因此有時候會出現(xiàn)正交表出來了但無法進(jìn)行多因素方差分析,原因在于實驗次數(shù)過少自由度不足導(dǎo)致無法進(jìn)行多因素方差分析。比如正交表L9.3.4,4因子3水平的正交表。如果需要進(jìn)行多因素方差分析,至少需要的自由度數(shù)量需要大于:4*(3-1)+1=9,那么最少需要10次實驗才夠4因子3水平的正交表進(jìn)行多因素方差分析。解決辦法有兩個,一是選擇實驗次數(shù)更高的正交表;二是自己多做最少一次實驗(且實驗組合不能與正交表中已有的組合相同)。
(2)正交表和文獻(xiàn)結(jié)果不一樣?
正交表有很多,同樣的因子數(shù)量和水平數(shù),生成得到的正交表均有可能不同。
(3)事后多重比較的類型選擇說明?
通常建議使用Bonferroni校正法較優(yōu)。如果各組別樣本不同時可使用scheffe,如果各組別樣本完全相同可使用tukey法等。