實(shí)用蛋白質(zhì)譜分析數(shù)據(jù)庫資源
1. GPMdb
GPMdb全稱為Global Proteome Machine Database。這是一個(gè)持續(xù)更新的大型數(shù)據(jù)庫,包含許多被質(zhì)譜鑒定過的蛋白質(zhì)質(zhì)譜數(shù)據(jù)。
網(wǎng)站鏈接:http://gpmdb.thegpm.org

網(wǎng)站界面很簡(jiǎn)單,可以通過搜索蛋白、基因名稱,或者motif等,加上對(duì)應(yīng)的種屬即可獲得有關(guān)這個(gè)蛋白的質(zhì)譜鑒定數(shù)據(jù),包括肽段序列,翻譯后修飾等等。這個(gè)數(shù)據(jù)庫可以提供直接的質(zhì)譜數(shù)據(jù)參考,非常實(shí)用?。?/p>
2. EBI PRIDE Archive
EBI PRIDE Archive是一個(gè)shotgun proteomics 質(zhì)譜研究數(shù)據(jù)庫,主要包括shotgun蛋白組學(xué)相關(guān)質(zhì)譜數(shù)據(jù),蛋白多肽鑒定,翻譯后修飾等質(zhì)譜鑒定信息。能夠?yàn)閟hotgun proteomics研究提供一些相關(guān)參考依據(jù)。
網(wǎng)站鏈接:http://www.ebi.ac.uk/pride/archive/

3. Human Proteome Map
Human Proteome Map是一個(gè)指示蛋白質(zhì)在各部分組織中的分布表達(dá)量的數(shù)據(jù)庫。蛋白質(zhì)在各個(gè)組織中的表達(dá)量的數(shù)據(jù)均基于質(zhì)譜研究數(shù)據(jù)。因此,這個(gè)數(shù)據(jù)庫可以為研究組織中某一蛋白的表達(dá)量提供一定的參考。
網(wǎng)站鏈接:http://www.humanproteomemap.org

4. UniProt
UniProt 是一個(gè)包含蛋白序列,修飾,功能注釋,研究文獻(xiàn),蛋白的亞細(xì)胞定位,以及相關(guān)疾病等的數(shù)據(jù)庫。UniProt 在研究蛋白質(zhì)功能以及與其它蛋白的關(guān)系等方面提供了很全面的信息,可以使我們快速了解一個(gè)蛋白的重要研究發(fā)現(xiàn),并查找到具體研究的文獻(xiàn)。
網(wǎng)站鏈接:http://www.uniprot.org
