115846-45-2、二肽標(biāo)記肽Suc-GP-對(duì)硝基苯胺、 Suc-Gly-Pro-pNA
高靈敏度,熒光底物succ - gp - amc適用于脯氨酸內(nèi)肽酶(脯氨酸裂解后酶)活性的測(cè)定。
編號(hào): 175863
中文名稱: 二肽標(biāo)記肽Suc-GP-對(duì)硝基苯胺
英文名: Suc-Gly-Pro-pNA
CAS號(hào): 115846-45-2
單字母: Suc-GP-pNA
三字母: Suc-Gly-Pro-pNA
氨基酸個(gè)數(shù): 2
分子式: C17H20O7N4
平均分子量: 392.36
精確分子量: 392.13
等電點(diǎn)(PI): -
pH=7.0時(shí)的凈電荷數(shù): -
平均親水性: -
疏水性值: -1
來源: 人工化學(xué)合成,僅限科學(xué)研究使用,不得用于人體。
鹽體系: 可選TFA、HAc、HCl或其它
儲(chǔ)存條件: 負(fù)80℃至負(fù)20℃
標(biāo)簽: pNA修飾肽 Suc修飾肽 酶底物肽 二肽(Dipeptide)
參考文獻(xiàn):
Caspase酶對(duì)應(yīng)的底物,Caspases(半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶,半胱氨酸依賴性天冬氨酸定向蛋白酶)是一類蛋白酶家族,其功能與凋亡(程序性細(xì)胞死亡),壞死和發(fā)燒(炎癥)的過程密切相關(guān)。
什么是胱天蛋白酶?
胱天蛋白酶(Caspases)是含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶,它們是為細(xì)胞凋亡的主要介質(zhì)。多種受體,例如TNF-α 受體,F(xiàn)asL受體,TLR和死亡受體,以及Bcl-2和凋亡抑制劑(IAP)蛋白家族參與并調(diào)節(jié)該caspase依賴性凋亡途徑。一旦Caspase受到上游信號(hào)(外部或內(nèi)在)刺激被激活,即會(huì)參與執(zhí)行下游蛋白底物的水解作用,并觸發(fā)一系列事件,導(dǎo)致細(xì)胞分解,死亡,吞噬作用和細(xì)胞碎片的清除。
人Caspases酶
人的Caspases家族基于序列相似性和生物學(xué)功能等共性主要可分為三大類:第一類由具有長(zhǎng)胱天蛋白酶募集結(jié)構(gòu)域的“炎癥”胱天蛋白酶組成,他們對(duì)P4位上的較大的芳香族或疏水性殘基具有親和力。第二類由具有短的前體結(jié)構(gòu)域的“細(xì)胞凋亡效應(yīng)”胱天蛋白酶組成,而第三類由具有長(zhǎng)的前提結(jié)構(gòu)域的Pap位置具有亮氨酸或纈氨酸底物親和力的“凋亡引發(fā)劑”胱天蛋白酶組成(表1)。
啟動(dòng)器Caspase和效應(yīng)器Caspase酶
根據(jù)其在凋亡胱天蛋白酶途徑中的作用,胱天蛋白酶可分為兩類:?jiǎn)?dòng)器和效應(yīng)器Caspase酶。啟動(dòng)器和效應(yīng)器Caspas酶都具有由小亞基和大亞基組成的催化位點(diǎn),Caspase酶的識(shí)別位
凋亡啟動(dòng)器Caspase酶,例如caspase-2,-8,-9和-10可以啟動(dòng)caspase激活級(jí)聯(lián)反應(yīng)。Caspase-8對(duì)于形成死亡誘導(dǎo)信號(hào)復(fù)合物(DISC)是必不可少的,并且在激活后,Caspase-8激活下游效應(yīng)子Caspase(例如Caspase 3)并介導(dǎo)線粒體中細(xì)胞色素c的釋放。Caspase-8已被證明對(duì)IETD肽序列具有相對(duì)較高的底物選擇性。凋亡效應(yīng)胱天蛋白酶例如Caspase-3,-6和-7雖然不負(fù)責(zé)啟動(dòng)級(jí)聯(lián)途徑,但是當(dāng)被激活時(shí),它們?cè)诩?jí)聯(lián)的中間和后續(xù)步驟中起著不可或缺的作用。Caspase-3(CPP32 / apopain)是關(guān)鍵效應(yīng)器,因?yàn)樗糯罅藖碜詥?dòng)器Caspase的信號(hào),使用對(duì)Caspase-3有選擇性的DEVD肽序列對(duì)活化的Caspase-3進(jìn)行檢測(cè),可以檢測(cè)Caspase-3的活性。
Caspase酶底物和抑制劑
Caspase底物和抑制劑由兩個(gè)關(guān)鍵成分組成:Caspase識(shí)別序列和信號(hào)產(chǎn)生或蛋白酶抑制基序。不同Caspase識(shí)別序列不同,一般由三個(gè)或四個(gè)氨基酸組成(表2)。Caspase酶識(shí)別序列的N端通常有乙?;ˋc)或碳苯甲氧基(Z)基團(tuán)修飾,以增強(qiáng)膜的通透性。對(duì)應(yīng)的Caspase識(shí)別特定的肽序列為其酶促反應(yīng)切割位點(diǎn),釋放產(chǎn)生信號(hào)或抑制信號(hào)的基序。Caspase的顯色和熒光底物均以相似的方式起作用,其中底物的信號(hào)或顏色強(qiáng)度與蛋白水解活性成正比。
Caspase酶的顯色底物
Caspase的顯色底物是有Caspase識(shí)別序列及生色基團(tuán)組成,常見的生色團(tuán)有pNA(對(duì)硝基苯胺或4-硝基苯胺),可使用酶標(biāo)儀或分光光度計(jì)在405 nm處進(jìn)行光密度檢測(cè)。
Caspase的熒光底物
Caspase的熒光底物的結(jié)構(gòu)包含與半胱天冬酶識(shí)別相關(guān)的熒光團(tuán),例如7-氨基-4-甲基香豆素(AMC),7-氨基-4-三氟甲基香豆素(AFC), Rhodamine 110(R110)或ProRed?620。R110的Caspase底物比基于香豆素的Caspase底物(例如AMC和AFC)更敏感,但由于兩步裂解過程,其動(dòng)態(tài)范圍更窄。 建議將R110標(biāo)記的Caspase底物用于終點(diǎn)法測(cè)定,而將AMC和AFC標(biāo)記的 Caspase底物用于動(dòng)力學(xué)測(cè)定。
圖.從左到右,分別是AMC(7-氨基-4-甲基香豆素),AFC(7-氨基-4-三氟甲基香豆素),Rhodamine 110(R110)和ProRed?620的激發(fā)和發(fā)射光譜。