1939 年，佛羅倫薩在魯?shù)婪?索契克（Rudolf Soutchek）的帶領(lǐng)下重返意甲聯(lián)賽，實(shí)力大增的他們以 5-0 和 4-1 的比分分別擊敗 AC 米蘭和拉齊奧，闖入意大利杯半決賽。在半決賽中，馬里奧-塞洛利亞（Mario Celoria）的兩粒進(jìn)球和朱塞佩-巴爾迪尼（Giuseppe Baldini）的第三粒進(jìn)球幫助佛羅倫薩戰(zhàn)勝了尤文圖斯，與熱那亞（當(dāng)時(shí)被法西斯強(qiáng)制改名為了熱那亞1893足球俱樂(lè)部，Genova 1893 Circolo del Calcio）會(huì)師決賽。1940 年 6 月 16 日，在佛羅倫薩的喬瓦尼-貝爾塔球場(chǎng)，塞洛里亞在第 26 分鐘的進(jìn)球打破了僵局，路易吉-格里范蒂（Luigi Griffanti）在比賽還剩不到 10 分鐘時(shí)擋住了賈科莫-內(nèi)里（Giacomo Neri）的射門，將比分保持在 1 比 0。從那個(gè)下午開始，佛羅倫永遠(yuǎn)銘記這個(gè)勝利的時(shí)刻。

決賽陣容如下：格里范蒂；達(dá)科斯塔，皮卡爾迪；埃萊納，比戈諾，波吉；門蒂，莫塞利，塞洛利亞-巴爾迪尼，塔利亞薩基（Griffanti; Da Costa, Piccardi; Ellena, Bigogno, Poggi; Menti, Morselli, Celoria Baldini, Tagliasacchi）。

佛羅倫薩隊(duì)由佛羅倫薩人、前紫百合球員朱塞佩-加盧齊（Giuseppe Galluzzi）訓(xùn)練，球隊(duì)是熱那亞紅藍(lán)軍團(tuán)之外唯一一支采用WM體系的意大利球隊(duì)，這種來(lái)自英格蘭的陣容正在改變足球。

1940 年 6 月 10 日，意大利參戰(zhàn)。與此同時(shí)，佛羅倫薩在羅密歐-門蒂（Romeo Menti）的帶領(lǐng)下，在朱塞佩-蓋格勒（Giuseppe Geigerle）和費(fèi)魯西奧-瓦爾卡雷吉（Ferruccio Valcareggi）的支持下，在聯(lián)賽中悄然前進(jìn)。門蒂和瓦爾卡雷吉的黃金搭檔共打入約 25 個(gè)進(jìn)球，并在主教練朱塞佩-加盧齊（Giuseppe Galluzzi）的帶領(lǐng)下將佛羅倫薩帶到了第三名的位置，在意甲聯(lián)賽和意大利杯對(duì)陣尤文圖斯的三場(chǎng)比賽中打入 13 個(gè)進(jìn)球，創(chuàng)造了記錄。

接下來(lái)的一個(gè)賽季，門蒂離開佛羅倫薩轉(zhuǎn)投都靈，紫百合以令人失望的第六名收?qǐng)?。與此同時(shí)，戰(zhàn)爭(zhēng)也帶走了一些球員。以下球員在第二次世界大戰(zhàn)中喪生：阿曼多-弗里戈（Armando Frigo，1943 年中彈）、布魯諾-內(nèi)里（Bruno Neri，1944 年陣亡）、維托里奧-斯塔喬內(nèi)（Vittorio Staccione，1945 年死于毛特豪森集中營(yíng)，譯者注：有五位中國(guó)同胞也在這個(gè)集中營(yíng)去世）。

那是佛羅倫薩暫?；顒?dòng)的戲劇性時(shí)期。當(dāng)時(shí)，佛羅倫薩的秘書兼總監(jiān)奧塔維奧-巴卡尼（Ottavio Baccani）將自己的家變成了佛羅倫薩的總部。1943/44賽季，由于交通不便，而球場(chǎng)又被盟軍占用，佛羅倫薩被迫進(jìn)行非正式友誼賽，其中包括一場(chǎng)與盟軍代表隊(duì)的比賽。后來(lái)，已經(jīng)更名為Comunale的球場(chǎng)被軍隊(duì)占領(lǐng)，佛羅倫薩隊(duì)不得不自行安排訓(xùn)練和活動(dòng)。

自1944年9月（佛羅倫薩于1944年8月11日獲得解放）起成立了與市政府達(dá)成一致的重組中心，從而保證了俱樂(lè)部組織的連續(xù)性。佛羅倫薩重新組建，成為佛羅倫薩足球協(xié)會(huì)，許多人加入其中，并選舉阿里戈-帕加內(nèi)利（Arrigo Paganelli）為主席。許多球員立即重返賽場(chǎng)，穿上了紫色球衣。其中包括在個(gè)人品格面前球技都顯得黯然失色的費(fèi)魯基歐-瓦爾卡雷吉（Ferruccio Valcareggi）、“來(lái)自Campo di? Marte街區(qū)的男孩”卡利諾-皮卡爾迪（Carlino Piccardi），以及在經(jīng)歷了輝煌的職業(yè)生涯后，作為佛羅倫薩總監(jiān)回歸的埃吉斯托-潘多爾菲尼（Egisto Pandolfini）。

當(dāng)時(shí)佛羅倫薩體育重組地方委員會(huì)（the Local Commission for the Reorganisation of Sport in Florence）在阿里戈-帕加內(nèi)利的主持下，發(fā)起了地區(qū)混合錦標(biāo)賽，也稱為戰(zhàn)時(shí)托斯卡納錦標(biāo)賽。比賽于 1945 年 4 月開始，佛羅倫薩隊(duì)在 7 月的決賽中擊敗了職業(yè)利沃諾隊(duì)（Pro Livorno）奪冠。