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【文獻(xiàn)速遞】【Nature methods】【2022年】【1月】

2022-08-12 15:32 作者:Rt_Cola  | 我要投稿

聲明:本專(zhuān)欄主要對(duì)生命科學(xué)領(lǐng)域的一些期刊文章標(biāo)題進(jìn)行翻譯,所有內(nèi)容均由本人手工整理翻譯。由于本人專(zhuān)業(yè)為生物分析相關(guān),其他領(lǐng)域如果出現(xiàn)翻譯錯(cuò)誤請(qǐng)諒解。

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FlyWire:全腦連接組學(xué)在線(xiàn)社區(qū)

2. Cross-modal coherent registration of whole mouse brains

整個(gè)小鼠大腦的跨模態(tài)連貫配準(zhǔn)

3. Fast optical recording of neuronal activity by three-dimensional custom-access serial holography

通過(guò)三維定制訪(fǎng)問(wèn)串行全息術(shù)快速光學(xué)記錄神經(jīng)元活動(dòng)

4. Lineage recording in human cerebral organoids

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多克隆原代人類(lèi)靜息CD4+ T細(xì)胞的快速、高效和激活中性基因編輯允許進(jìn)行復(fù)雜的功能分析

6. Monitoring protein conformational changes using fluorescent nanoantennas

使用熒光納米天線(xiàn)監(jiān)測(cè)蛋白質(zhì)構(gòu)象變化


基于DNA或者PEG的熒光天線(xiàn),一端含有熒光基團(tuán)(比如FAM),另一端含有生物素來(lái)促進(jìn)接觸(開(kāi)始)。我們使用生物素連接納米天線(xiàn)到含有四個(gè)生物素位點(diǎn)的野生型鏈霉親和素,可以觀(guān)察到FAM熒光信號(hào)的下降(或者淬滅)。通過(guò)和生物素化的小牛腸堿性磷酸酶結(jié)合,可以觀(guān)察到明顯的熒光信號(hào)(第二步),證明FAM從鏈霉親和素上釋放。在加入堿性磷酸酶底物后,納米天線(xiàn)產(chǎn)生了一個(gè)暫時(shí)的熒光“尖峰”(第三步),可以用來(lái)實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)酶的瞬間底物結(jié)合狀態(tài)。

7. Engineered HaloTag variants for fluorescence lifetime multiplexing

用于熒光壽命多路復(fù)用的工程HaloTag變體

8. Systematic molecular evolution enables robust biomolecule discovery

系統(tǒng)的分子進(jìn)化使強(qiáng)大的生物分子發(fā)現(xiàn)成為可能

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使用 mako 快速靈活地分析關(guān)聯(lián)的微生物組數(shù)據(jù)

10. Benchmarking atlas-level data integration in single-cell genomics

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11. Method of the Year: protein structure prediction

年度方法:蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)

蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)是我們的 2021 年度方法,用于最近開(kāi)發(fā)的基于深度學(xué)習(xí)的方法,該方法以前所未有的準(zhǔn)確度預(yù)測(cè)結(jié)構(gòu)。在封面上,來(lái)自AlphaFold蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)(https://alphafold.ebi.ac.uk/)的大量蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)模型由AlphaFold2方法預(yù)測(cè)。


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