基因敲除 NCI-H1299細(xì)胞系助力肺癌研究-源井生物
基因敲除?NCI-H1299細(xì)胞系
NCI-H1299細(xì)胞系,也稱為H1299或CRL-5803,是衍生自淋巴結(jié)的人類非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)穩(wěn)轉(zhuǎn)細(xì)胞系與其他永生細(xì)胞系相似,H1299細(xì)胞可以無限分裂。另外,H1299細(xì)胞具有TP53基因的純合部分缺失,因此它們不表達(dá)會導(dǎo)致其增殖傾向的抑癌p53蛋白。此外,據(jù)報道,這些細(xì)胞可以分泌肽激素神經(jīng)調(diào)節(jié)素B(NMB),但不能分泌胃泌素釋放肽(GRP)。具有這些有趣的特征,NCI-H1299細(xì)胞成為涉及基因敲除,基因敲入和點突變的生物學(xué)領(lǐng)域的流行基因敲除細(xì)胞系。
肺癌是全世界男性和女性中第二大最普遍,最致命的惡性腫瘤。另一方面,NSCLC約占肺癌的85%,這是全球癌癥死亡的主要原因。由于H1299細(xì)胞系來源于淋巴結(jié),因此這些細(xì)胞已被廣泛用于肺癌研究。表征癌細(xì)胞中累積的遺傳改變對理解腫瘤生物學(xué)和指導(dǎo)藥物設(shè)計都具有重要意義。此外,它可能通過基因定制的癌癥相關(guān)細(xì)胞,例如基因敲除的H1299細(xì)胞等,使有針對性癌癥治療的患者受益。研究表明,NCI-H1299細(xì)胞系是一種穩(wěn)定的細(xì)胞系,具有純合子敲除的功能。一些人類基因使用CRISPR-Cas9。因此,NCI-H1299的基因敲除技術(shù)通常用于治療肺癌。
應(yīng)用:
紫杉醇降低了Rsf-1基因敲除NCI-H1299的遷移和增殖能力
?紫杉醇是治療肺癌的經(jīng)典藥物,但很容易引起耐藥性。因此,迫切需要克服耐藥性的新方法。 Rsf-1表達(dá)在肺癌中較高,并通過NF-κB途徑提高紫杉醇的耐受性。許多其他基因也與藥物抗性有關(guān),例如影響凋亡和穩(wěn)轉(zhuǎn)細(xì)胞系周期的基因。
Chen及其同事使用CRISPR-Cas9技術(shù)敲除了肺癌細(xì)胞和異種移植小鼠中的Rsf-1,并通過調(diào)節(jié)NF-κB途徑的激活及其下游表達(dá)來測試Rsf-1是否影響肺癌對紫杉醇的敏感性?;颉=Y(jié)果表明紫杉醇降低了Rsf-1-基因敲除的NCI-H1299和NCI-H460細(xì)胞遷移和增殖的能力,并增加了細(xì)胞凋亡。在患有源自Rsf-1基因敲除細(xì)胞的異種移植腫瘤的小鼠中,紫杉醇的抗腫瘤作用增強(qiáng)。因此,通過CRISPR-Cas9技術(shù)靶向Rsf-1也已成為治療肺癌的方法之一。
敲低PON2基因以研究NCI-H1299細(xì)胞系增殖
?先前的研究表明,與相應(yīng)的相鄰非腫瘤組織相比,NSCLC患者的癌組織中對氧合酶2(PON2)(一種具有抗氧化特性的內(nèi)酯酶/芳基酯酶)的表達(dá)明顯增強(qiáng)。此外,增加的PON2表達(dá)可能有助于NSCLC細(xì)胞對經(jīng)典的抗NSCLC治療藥物產(chǎn)生抗藥性。然而,研究人員發(fā)現(xiàn),通過siRNA穩(wěn)定降低PON2的表達(dá)可以減少NSCLC細(xì)胞(如NCI-H1299細(xì)胞)的增殖。
?為了進(jìn)一步闡明PON2在NSCLC穩(wěn)轉(zhuǎn)細(xì)胞構(gòu)建增殖中的作用,在NSCLC細(xì)胞系NCI-H1299中應(yīng)用了兩個基因編輯系統(tǒng)TALEN和CRISPR / Cas。結(jié)果表明,Cas9表達(dá)是由外源性強(qiáng)力霉素以可逆方式誘導(dǎo)的,為研究基因表達(dá)的變化如何調(diào)控NSCLC細(xì)胞株增殖提供了一個平臺。
基因敲除切割效率不僅可以讓人具有生成人糖基化譜和建立調(diào)控記錄的能力,而且具有多種優(yōu)勢,是一種特別有吸引力的重組蛋白表達(dá)系統(tǒng)。首先,它在谷氨酸上羧基化,在酪氨酸上硫酸化。第二,操作簡單,通過瞬時基因表達(dá)可以快速產(chǎn)生重組蛋白。第三,可用于穩(wěn)定的重組蛋白生產(chǎn)。一些研究人員利用基因敲除切割效率系統(tǒng)產(chǎn)生基因編輯細(xì)胞系,對GLUL基因組位點進(jìn)行靶向測序,產(chǎn)生產(chǎn)生產(chǎn)生EPO的穩(wěn)轉(zhuǎn)細(xì)胞系,并發(fā)現(xiàn)重組促紅細(xì)胞生成素在人體內(nèi)穩(wěn)定表達(dá)的機(jī)制。
根據(jù)需求,源井生物結(jié)合靶基因的情況進(jìn)行基因穩(wěn)轉(zhuǎn)敲除方案設(shè)計
?方案1:小片段基因敲除方案,gRNA設(shè)在外顯子2兩端的內(nèi)含子中,敲除外顯子編碼堿基數(shù)為非3倍數(shù),敲除后可造成移碼。
方案2:移碼基因敲除方案,gRNA設(shè)在外顯子上,缺失的堿基數(shù)為非3倍數(shù),敲除后可發(fā)生移碼突變。
方案3:大片段基因敲除方案,將整個基因的編碼序列敲除,達(dá)到大片段敲除的效果。

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Reference:
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