臺灣媒體報道稱，蘇澳區(qū)漁會漁業(yè)電臺27日下午2時30分接獲“新凌波236號”?船長陳吉雄通報，稱漁船在釣魚島西方12海里海域作業(yè)時，遭日本海上保安廳公務船沖撞。27日傍晚，臺外事部門證實，兩船發(fā)生擦撞。根據查證，“新凌波236號”船頭受損嚴重，所幸7名船員平安。臺海巡單位派遣“基隆艦”馳援，與“新凌波236號”船會合，漁船在28日凌晨5時許平安返回南方澳漁港。

據朝日新聞報道，日本內閣官房長官加藤勝28日上午在記者會上表示，是臺灣漁船接近提出警告的日本巡邏艇而發(fā)生碰撞。但船長陳吉雄當天反駁稱，當時他在海上作業(yè)時，并沒有進入釣魚島12海里內，因海流很強，漁具被沖入釣魚島12海里內，他只是將船只開入撿拾漁具，日本公務船就在沒有示警情況下，從漁船右方緊貼急駛，以甩尾方式撞擊漁船右前方，導致部分船體受損。臺外事部門稱，事發(fā)詳細原因尚待臺漁業(yè)單位及海巡單位調查，該部門將視調查結果對日方采取相應措施，并要求日方說明本案詳情及確保海域現場安全，不得對臺灣漁船采取任何不當行為。

28日，臺外事部門主管吳釗燮到臺立法機構接受質詢，中國國民黨籍民代馬文君、溫玉霞追問目前處理進度，溫玉霞更說不能遇到日本就軟，吳釗燮辯稱“沒有碰到日本就軟弱”。吳釗燮還自稱民進黨上臺后，所謂“臺日關系友好”，以致所謂“臺日協(xié)議捕魚”的漁獲量比過去多。吳釗燮的此番說法也遭到外界批評。