系統(tǒng)進(jìn)化樹

1.找目的蛋白protein，blastp，選擇其他近緣物種，導(dǎo)出fasta格式，導(dǎo)出在一個文件夾中。

2.在文件夾中建立一個txt文件，文件內(nèi)容“轉(zhuǎn)化格式”，fasta?txt

3.修改后綴為“bat”，雙擊文件觸發(fā)

4.改回后綴“txt”，修改文件內(nèi)容“將所有內(nèi)容合并”。文件命名為”all“

5.改后綴”bat“，雙擊觸發(fā)，改后綴為”fasta“

6.MEGA打開fasta文件，選擇”比對“align

7.data\export\mega 導(dǎo)出為MEGA文件

8.MEGA文件導(dǎo)入軟件，點擊TA，NJ法設(shè)計三個參數(shù)，左邊編輯欄調(diào)整進(jìn)化樹外形

1.all.fasta文件直接導(dǎo)入Jalview

2.

另外CLUSTALW可以直接輸入多序列

保存文件后用snapgene打開

在軟件進(jìn)行設(shè)計

但圖片有背景，需要用其他軟件優(yōu)化。