文獻管理軟件是學(xué)者或者作者用于記錄、組織、調(diào)閱引用文獻的計算機程序。一旦引用文獻被記錄，就可以重復(fù)多次地生成文獻引用目錄。例如，在書籍、文章或者論文當(dāng)中的參考文獻目錄。此外，文獻管理軟件可以直接鏈接到不同的數(shù)據(jù)庫進行檢索，免去登錄不同數(shù)據(jù)庫的麻煩，提高效率。還可以管理文獻信息，檢索摘要、全文、DOI號等，輕松快捷。
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Endnote

EndNote 是Thomson Scientific 公司開發(fā)的軟件，支持國際期刊的參考文獻格式有3776 種，寫作模板幾百種，涵蓋各個領(lǐng)域的雜志。能直接連接上千個數(shù)據(jù)庫，并提供通用的檢索方式，提高科技文獻的檢索效率。能管理的數(shù)據(jù)庫沒有上限，至少能管理數(shù)十萬條參考文獻。Endnote快捷工具嵌入到Word 編輯器中，可以很方便地邊書寫論文邊插入?yún)⒖嘉墨I，書寫過程中不用擔(dān)心插入的參考文獻會發(fā)生格式錯誤或連接錯誤。EndNote 的系統(tǒng)資源占用小，很少發(fā)生因EndNote 數(shù)據(jù)庫過大發(fā)生計算機死機現(xiàn)象，這是EndNote 最重要的特色之一。缺點：使用需收費；在導(dǎo)入中文PDF文獻時不能直接生成題錄。
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NoteFirst

NoteFirst是一款國產(chǎn)網(wǎng)絡(luò)版文獻管理軟件。針對個人用戶， 它集成了文件管理，文獻收集，論文中參考文獻的自動形成，參考文獻自動校對，免費科技文獻等功能。支持多種其他軟件的文件格式，并集成了多語言系統(tǒng)。提供專門的讀書筆記模塊，方便讀者記錄一些好的研究想法；內(nèi)置PDF閱讀器功能較強大，包括添加各種標記、注釋以及書簽；不僅是文獻管理軟件，更是一個分享資源、協(xié)作研究的專業(yè)平臺；缺點：需注冊賬戶才能使用。
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mendeley

mendeley 是一款免費的文獻管理軟件，有一鍵抓取網(wǎng)頁上的文本添加到個人library中的功能，安裝插件后還可以編輯文本。還可安裝MS Word和Open Office插件，方便在文字編輯器中插入和管理參考文獻。參考文獻格式與Zotero一樣用各種期刊格式的CLS文件。缺點：不支持中文參考文獻標準；不能在軟件中聯(lián)機檢索文獻；軟件沒有漢化版本，學(xué)習(xí)和使用的難度較大。
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zotero

zotero是開源的文獻管理工具，可以方便的收集，組織，引用，和共享文獻的工具。由安德魯·w·梅隆基金會，斯隆基金會以及美國博物館和圖書館服務(wù)協(xié)會資助開發(fā)。Zotero的最大優(yōu)點是能夠?qū)υ诰€文獻數(shù)據(jù)庫網(wǎng)頁中的文獻題錄直接抓取。如我們打開SD數(shù)據(jù)庫中的某篇文獻的網(wǎng)頁，在安裝有Zotero的Firefox的地址欄末端會出現(xiàn)一個“頁面”標志。缺點：必須使用Firefox瀏覽器；文獻管理、分類方式較單一。
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NoteExpress

NoteExpress 是北京愛琴海軟件公司開發(fā)的一款專業(yè)級別的文獻檢索與管理系統(tǒng)，其核心功能涵蓋“知識采集，管理，應(yīng)用，挖掘”的知識管理的所有環(huán)節(jié)，是學(xué)術(shù)研究，知識管理的必備工具，發(fā)表論文的好幫手。??從互聯(lián)網(wǎng)上數(shù)以千計的國內(nèi)外電子圖書館，文獻數(shù)據(jù)庫中檢索，下載文獻書目信息，軟件內(nèi)置多線程，是同類軟件中下載速度最快的。以后將提供用戶自己添加，管理這些連接的功能。檢索方便，檢索結(jié)果可以保存下來作為一個研究方向?qū)ｎ}。數(shù)據(jù)庫容易攜帶，備份。缺點：使用需收費；不具有內(nèi)置的PDF閱讀器；不具備網(wǎng)絡(luò)同步功能。
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CNKI E-Study

CNKI E-Study（目前名為知網(wǎng)研學(xué)）是中國知網(wǎng)官方推出的科研工具，不僅具備文獻管理功能，還具備在線投稿和寫作功能。支持在線閱讀，運用XML碎片化技術(shù)，實現(xiàn)全文結(jié)構(gòu)化索引、知識元智能關(guān)聯(lián)，提供強大的原文編改工具，深化研究式閱讀體驗。支持對學(xué)習(xí)過程中的劃詞檢索和標注，包括檢索工具書、檢索文獻、詞組翻譯、檢索定義、Google Scholar檢索等；支持將兩篇文獻在同一個窗口內(nèi)進行對比研讀。缺點：收費使用；搜索結(jié)果會中外文獻混雜顯示；高級檢索窗口使用不便。