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揭秘醫(yī)學(xué)大類組織|空間代謝組物質(zhì)檢出一覽及切片攻略放送

2023-04-18 11:56 作者:鹿明生物  | 我要投稿

鹿明生物【一作講座】組蛋白磷酸化響應(yīng)激素信號(hào)調(diào)控肝臟糖異生的分子機(jī)制

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空間代謝組學(xué)(Spatial Metabolomics)結(jié)合了質(zhì)譜成像(Mass Spectrometry Imaging, MSI)和代謝組學(xué),利用離子源直接掃描生物樣品成像,不僅可以鑒定成千上萬(wàn)種代謝物的結(jié)構(gòu)和相對(duì)含量,還可以在同一張組織切片上同時(shí)分析大量代謝物的空間分布特征,為傳統(tǒng)代謝組學(xué)分析提供了全新的可視化視角,實(shí)現(xiàn)對(duì)代謝物進(jìn)行定性、定量、定位三個(gè)維度的深入分析。


本文核心內(nèi)容:

空間代謝組學(xué)在切片過(guò)程中需要注意哪些事項(xiàng)?

空間代謝組學(xué)檢測(cè)不同類型樣本的物質(zhì)檢出情況如何?

首先,好的數(shù)據(jù)結(jié)果離不開(kāi)前期的實(shí)驗(yàn)處理。對(duì)于空間代謝組學(xué)的數(shù)據(jù)來(lái)說(shuō),其中成敗的關(guān)鍵一定離不開(kāi)切片,線上的研究資料中很少詳細(xì)對(duì)空間代謝組切片的關(guān)注,鹿明生物經(jīng)過(guò)多年的空間代謝組學(xué)研究經(jīng)驗(yàn),梳理了部分切片攻略,接下來(lái)具體看看吧。

1空間代謝組學(xué)切片實(shí)驗(yàn)具體流程

step1.?樣本核對(duì)

step2.?樣本固定及安裝

step3.?樣本修片

step4.?確認(rèn)切面

step5.?正式樣本收集

step6.?切片檢查核對(duì)

2切片技巧和注意事項(xiàng)

3空間代謝組學(xué)在各類型組織中檢出的物質(zhì)大類占比

鹿明生物AFADESI空間代謝組學(xué)常測(cè)定出的腦組織代謝物主要包含有:5-羥色胺、乙酰膽堿、GABA、多巴胺、組氨、褪黑激素等,運(yùn)用鹿明生物空間代謝組學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)鑒定腦組織中大類物質(zhì)的檢出占比,如下圖所示:

鹿明生物AFADESI空間代謝組學(xué)常測(cè)定出的肝臟組織中代謝物主要有ATP、正磷酸鹽、D-葡萄糖、草酰琥珀酸鹽等,運(yùn)用鹿明生物空間代謝組學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)鑒定肝臟組織中大類物質(zhì)的檢出占比,如下圖所示:

鹿明生物AFADESI空間代謝組學(xué)常測(cè)定出的腎臟組織中代謝物主要有N-乙酰組胺、磷酸絲氨酸、肌苷、果糖基賴氨酸等,運(yùn)用鹿明生物空間代謝組學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)鑒定腎臟組織中大類物質(zhì)的檢出占比,如下圖所示:

鹿明生物AFADESI空間代謝組學(xué)常測(cè)定出的腫瘤組織中代謝物主要有天冬氨酸、脯氨酸、次黃嘌呤、腺嘌呤等,運(yùn)用鹿明生物空間代謝組學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)鑒定中腫瘤組織中大類物質(zhì)的檢出占比,如下圖所示:

鹿明生物AFADESI空間代謝組學(xué)常測(cè)定出的肺組織中代謝物主要有L-乳酸、D-葡糖糖、水楊酸、檸檬酸鹽等,運(yùn)用鹿明生物空間代謝組學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)鑒定中組織中大類物質(zhì)的檢出占比,如下圖所示:

鹿明生物AFADESI空間代謝組學(xué)常測(cè)定出的心臟組織中代謝物主要有D-葡糖糖、熊果苷、草酰琥珀酸鹽、D-阿洛糖等,運(yùn)用鹿明生物空間代謝組學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)鑒定中心臟組織中大類物質(zhì)的檢出占比,如下圖所示:

本期內(nèi)容就到這了,鹿明生物提供優(yōu)質(zhì)的空間代謝組服務(wù),更多關(guān)于空間代謝組學(xué)的技術(shù)交流,歡迎大家在下方互動(dòng)留言哦~


Dragon撰文

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本文系鹿明生物原創(chuàng)

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