蛋白組學(xué)、代謝組學(xué)~你“嗑”的科研CP是哪對(duì)?
2022.2.22百年一天的“有愛日”
今天超多糖可以“嗑”
祝愿天下有情人終成眷屬
在一年中最有愛的日子
在這充滿儀式感的一天
鹿明生物CP款“網(wǎng)紅”產(chǎn)品來(lái)打卡,快來(lái)看看吧~
歡迎各位老師在文末留言(念)
CP1
4D蛋白組+雙平臺(tái)全譜代謝組
全新4D-DIA+4D-PRM蛋白組和GC-MS&LC-MS雙平臺(tái)代謝組學(xué)技術(shù)組合,可以更好的從多個(gè)維度提高信息的全面性和準(zhǔn)確性,挖掘到更多更精準(zhǔn)的信息,從而能產(chǎn)出更多有價(jià)值的結(jié)果,便于后續(xù)深入的研究與應(yīng)用。
研究策略:
1. 通過對(duì)蛋白組和代謝組兩個(gè)分子層次的組學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行整合分析,可以結(jié)合兩個(gè)組學(xué)的分析結(jié)果,進(jìn)行相互驗(yàn)證,提高后續(xù)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證成功率;
2.?通過蛋白組和代謝組進(jìn)行優(yōu)勢(shì)互補(bǔ),并且使研究更加系統(tǒng)。最終實(shí)現(xiàn)對(duì)生物變化大趨勢(shì)與方向的綜合了解,提出分子生物學(xué)變化機(jī)制模型;
3. 篩選出重點(diǎn)代謝通路相關(guān)的蛋白質(zhì)或者代謝產(chǎn)物,從而為后續(xù)進(jìn)行深入實(shí)驗(yàn)與分析提供數(shù)據(jù)基礎(chǔ)。
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CP2
16s微生物測(cè)序+全譜代謝組雙平臺(tái)
微生物組測(cè)序 (主要指 16S 擴(kuò)增子測(cè)序與宏基因組測(cè)序) 可提供腸道細(xì)菌構(gòu)成、基因豐度和功能性信息,可以解決「who is there?」(那兒有誰(shuí)) 和「what are they doing?」(在干嘛) 的問題。
而代謝組學(xué)是研究生物體中代謝產(chǎn)物變化的科學(xué),常用研究方法包括LC/MS(液質(zhì)聯(lián)用)和GC/MS(氣質(zhì)聯(lián)用),可以解決「what have really happened?」(究竟發(fā)生了啥) 的問題。
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“有愛cp組”案例展示
英文標(biāo)題:Improvement in sperm quality and spermatogenesis following faecal microbiota transplantation from alginate oligosaccharide dosed mice
中文標(biāo)題:移植褐藻寡糖喂養(yǎng)小鼠的糞便微生物群可提升精子的質(zhì)量和生成量
發(fā)表期刊:Gut?
影響因子:17.943
合作單位:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院動(dòng)物科學(xué)研究所&青島農(nóng)業(yè)大學(xué)
主要技術(shù)手段:16S微生物多樣性、LC-MS非靶向代謝組(由歐易/鹿明生物提供技術(shù)支持)
研究背景:多囊卵巢綜合征(PCOS)患者的FMT導(dǎo)致卵巢功能紊亂和生育能力下降,提示腸道微生物群的改變可能是PCOS治療的一個(gè)有價(jià)值的途徑。在高脂肪飲食下形成的腸道微生物的FMT進(jìn)入正常飲食的小鼠體內(nèi),導(dǎo)致精子無(wú)法產(chǎn)生且活力降低,這表明恢復(fù)腸道微生物群可能是改善由環(huán)境因素引起的男性不育障礙的一種手段。然而,到目前為止,還沒有任何報(bào)告提到FMT后生育率的改善。
CP技術(shù)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)
參考文獻(xiàn):Zhang, Pengfei , et al. "Improvement in sperm quality and spermatogenesis following faecal microbiota transplantation ?from alginate oligosaccharide dosed mice." Gut (2020):gutjnl-2020-320992.
CP3
定量蛋白質(zhì)組+修飾蛋白組
隨著定量蛋白質(zhì)組與磷酸化蛋白質(zhì)組關(guān)聯(lián)分析在癌癥發(fā)病機(jī)制和精準(zhǔn)治療、擬南芥生長(zhǎng)發(fā)育調(diào)控機(jī)制等研究領(lǐng)域發(fā)表了大量CNS級(jí)高水平文章,定量蛋白質(zhì)組與修飾蛋白質(zhì)組作為新晉“黃金搭檔”助力更深入的調(diào)控和分子機(jī)制研究,可以多維度高深度解析生物反應(yīng)機(jī)制,更精準(zhǔn)定位主導(dǎo)調(diào)控作用更系統(tǒng)深入地揭示生命活動(dòng)調(diào)節(jié)機(jī)制和規(guī)律。
服務(wù)優(yōu)勢(shì)
1.儀器平臺(tái)升級(jí):采用4D-tims-TOF-Pro質(zhì)譜儀,提高定量的準(zhǔn)確性、鑒定深度,鑒定數(shù)量
2.使用值得信賴的CST原廠抗體等進(jìn)行膚段富集,保證實(shí)驗(yàn)結(jié)果
3.關(guān)聯(lián)分析深度挖掘調(diào)控和分子機(jī)制
4.激酶分析、激酶-底物分析及互作網(wǎng)絡(luò)關(guān)系分析
5.系統(tǒng)深入研究:從蛋白表達(dá)量和修飾層面對(duì)生物學(xué)問題進(jìn)行更全面的解析
6.一站式服務(wù):蛋白組+磷酸化蛋白組聯(lián)合分析及后期PRM驗(yàn)證,以及多組學(xué)聯(lián)合分析
7.采用4D-DIA/LFQ技術(shù)
研究案例
英文標(biāo)題:Integrative Proteomic Characterization of Human Lung Adenocarcinoma
中文標(biāo)題:人肺腺癌的綜合蛋白組學(xué)特征
實(shí)驗(yàn)材料:肺腺癌肺組織
影響因子:38.637
發(fā)表期刊:Cell
研究結(jié)論:
該研究對(duì)103例LUAD患者進(jìn)行了蛋白質(zhì)組學(xué)綜合分析。蛋白質(zhì)組、磷酸化蛋白質(zhì)組、轉(zhuǎn)錄組和整個(gè)外顯子組測(cè)序數(shù)據(jù)的綜合分析揭示了癌癥相關(guān)的特征?;诘鞍踪|(zhì)組學(xué)對(duì)LUAD分型,顯示了三個(gè)亞型(S-I、S-II和S-III),它們與不同的臨床和分子特征有關(guān)。此外,研究者發(fā)現(xiàn)了潛在的藥物靶點(diǎn),并在一個(gè)獨(dú)立隊(duì)列中驗(yàn)證了血漿中HSP9β的水平可作為L(zhǎng)UAD的潛在預(yù)后生物標(biāo)志物。本次的綜合蛋白質(zhì)組學(xué)分析能夠更全面地了解LUAD,并為更精確的診斷和治療提供機(jī)會(huì)。
其他參考文獻(xiàn)
[1] Mass-spectrometry-based draft of the Arabidopsis proteome. Nature 2020.
[2] Proteogenomics of Non-smoking Lung Cancer in East Asia Delineates Molecular Signatures of Pathogenesis and?
Progression. Cell 2020.
[3] Circadian rhythms in the absence of the clock gene Bmal1. Science 2020.
三款CP您“嗑”中了哪款?
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End本文系鹿明生物原創(chuàng)