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核酸檢測——生物PCR技術(shù)

2020-07-19 10:13 作者:滑稽大法好233666  | 我要投稿

“核酸檢測”這一詞在今年深入人心,但究竟什么是核酸檢測,檢測原理,檢測目標(biāo)是什么?下面,我就簡單介紹一下核酸檢測。

關(guān)于核酸檢測的新聞

在疫情期間,最早出現(xiàn),也是目前最有效的新型冠狀病毒檢測方式便是核酸檢測

——PCR檢測(RT-PCR檢測)

PCR技術(shù)用于擴(kuò)增特定序列的DNA片段,也就是只能以DNA為模板復(fù)制出一模一樣的DNA

圖片來自于百度百科“PCR”


但眾所周知,冠狀病毒是單鏈RNA病毒,所以常規(guī)PCR不能擴(kuò)增。于是RT-PCR技術(shù)成為首選。

RT-PCR與常規(guī)的不同之處僅在于,在第一步要先將單鏈RNA轉(zhuǎn)cDNA(沒什么卵用的互補(bǔ)DNA),簡稱RT,再進(jìn)行PCR。RT與PCR步驟類似,但要求更加嚴(yán)格,此處不多贅述。

這里有朋友就會問了,你說了PCR是擴(kuò)增,但到底咋檢測核酸???

這里舉出兩種最常規(guī)PCR檢測方法——熒光PCR

一、Taqman水解探針法

(雖然更精準(zhǔn),但核酸檢測不用...太貴了,費(fèi)時(shí)間)

水解探針法圖解

備注:圈R和圈Q連成的線段表示Taqman探針,探針斷裂(水解)發(fā)出熒光,反之無

? ? ? ? ? ?圈R表示報(bào)告基團(tuán)暨發(fā)出熒光的基團(tuán),圈Q表示淬滅基團(tuán)暨阻止發(fā)出熒光的基團(tuán),當(dāng)RQ連接時(shí)無熒光,反之有


首先,收集到樣本之后不能直接用PCR+探針檢測,因?yàn)闃颖緮?shù)量過少,所以要先常規(guī)擴(kuò)增。

PCR分為三步:變性、退火、延伸

變性:將雙螺旋結(jié)構(gòu)的DNA完全展開,并形成DNA單鏈

不解旋就如同下面的鋼繩一樣,根本無法復(fù)制。

退火:放入引物(一小段已知序列DNA,由于某些化學(xué)原因,DNA無法憑空形成一條鏈,具體原因可自行搜索,點(diǎn)個(gè)贊下期接著講DNA復(fù)制 :D )

延伸:在DNA聚合酶的作用下,形成互補(bǔ)的一條完整的雙螺旋DNA

這樣,你就會得到雙倍的快樂DNA

以上步驟是一個(gè)循環(huán),重復(fù)上述步驟幾十次才能達(dá)到檢測濃度。

檢測的步驟如圖所示,與常規(guī)PCR一樣,只不過加了一條探針(也就是一段與已知序列互補(bǔ)的DNA鏈)。

由于DNA復(fù)制單鏈的時(shí)候,復(fù)制過程必須完整,所以DNA聚合酶就會把在它前進(jìn)方向擋路的探針水解,于是乎報(bào)告基團(tuán)與淬滅基團(tuán)分離,報(bào)告基團(tuán)就發(fā)出了bulinbulin的亮光。

于是,檢測儀檢測到熒光就得出陽性,反之是陰性。

二、熒光染料法

(核酸檢測用這個(gè),但是某些情況不如探針精準(zhǔn)...畢竟簡單快捷哇)

圖片來自于百度百科“熒光染料”

核酸熒光染料在游離時(shí)幾乎不發(fā)光,但與DNA結(jié)合后發(fā)光,由此可以檢測

在一般情況下,由于熒光染料自身的物理性質(zhì),它能結(jié)合DNA某個(gè)特定的位置,但是并不能特異性識別DNA片段

說人話就是,只能檢測DNA的有無

以冠狀病毒核算檢測為例,在提取病毒的RNA的時(shí)候,若不小心摻雜了DNA,就有可能造成假陽性(雖然正常不會:D)

在確保了提取RNA的純度之后,通過前文提到的RT-PCR過程,通過檢測儀看bulinbulin的光強(qiáng),就可以確定 陰性/陽性?了

end?

如有其它對生物科技感興趣的,歡迎在下面留言討論~


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