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在超算平臺安裝高斯16(Gaussian16 for Linux)

2022-07-17 21:21 作者:光聲電子  | 我要投稿

(以北京超算為例)

1. 上傳安裝包(G16-A03-AVX2.tbz),并解壓:

????tar -jxvf G16-A03-AVX2.tbz

?

2. 解壓完成會自動生成g16文件夾,在該目錄下新建scratch文件夾:

?????? mkdir scratch

?

3. 給g16和scratch文件夾分別賦予權(quán)限:

?????? chmod -R 750 ./g16

?????? chmod -R 777 ./scratch

?

4. 修改系統(tǒng)環(huán)境變量:

?????? vi ~/.bashrc

?

在bashrc文件中加入以下內(nèi)容:

????# Gaussian-16

????export PATH=/public1/home/......./bin:$PATH

????GAUSS_SCRDIR=/public1/home/......./Gaussian/scratch

????g16root=/public1/home/....../Gaussian/gaussian

????export g16root GAUSS_SCRDIR

????source $g16root/g16/bsd/g16.profile

?

5. 由于當(dāng)前高斯版本與北京超算的CPU架構(gòu)有沖突,故需在環(huán)境變量中加入如下內(nèi)容:

????export PGI_FASTMATH_CPU=haswell

?

6. 查看g16是否裝好:

????which g16

?

出現(xiàn)類似如下內(nèi)容說明安裝完成:

????~/Gaussian/gaussian/g16/g16

?

7. 使用腳本提交作業(yè):

????略



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