五、GO和KEGG分析

1.DAVID（https://david.ncifcrf.gov/）

（2）將藥物-疾病靶點(diǎn)交集復(fù)制進(jìn)“A：Paste a list”，“Step 2：Select Identifier”項(xiàng)下選擇“OFFICIAL_GENE_SYMBOL”，“Step 2a：Select species”項(xiàng)下選擇“Homo sapiens”，“Step 3：List Type”項(xiàng)下選擇“Gene List”，點(diǎn)擊“Submit List”。

（3）展開(kāi)“Gene_Ontology”，點(diǎn)擊“GOTERM_BP_DIRECT”后的“Chart”。

（4）右鍵“Download File”，點(diǎn)擊“將鏈接另存為”，選擇保存位置，命名文件，點(diǎn)擊“保存”。

（5）“GOTERM_CC_DIRECT”“GOTERM_MF_DIRECT”同上。

（6）展開(kāi)“Pathways”，“KEGG_PATHWAY”同上。

（7）打開(kāi)下載的文件，復(fù)制到EXCEL。（若復(fù)制完只有一列，則選擇分列時(shí)只勾選“Tab鍵”，若有多列但分列混亂，則點(diǎn)擊“文件”→“打開(kāi)”→選擇下載的文件→“打開(kāi)”→“下一步”，只勾選“Tab鍵”即可。）

（8）選中“Count”一列，右鍵選擇“插入”。

（9）復(fù)制“Term”欄目下“GO:0008284~positive regulation of cell proliferation”中的“~”。注：KEGG為復(fù)制冒號(hào)。

（10）選中“Term”欄，點(diǎn)擊“數(shù)據(jù)”→“分列”。

（11）點(diǎn)擊“下一步”，勾選“其他”，在后面粘貼上之前復(fù)制的“~”，點(diǎn)擊“下一步”，點(diǎn)擊“完成”。

（12）將新分列出的一列前20個(gè)數(shù)據(jù)復(fù)制到新EXCEL表格中。

（13）將表格中“PValue”、“Count”的前20項(xiàng)復(fù)制到新EXCEL，并按下圖排列。其中“GeneRatio”數(shù)據(jù)為“Count”除以“List Total”。CC、MF、KEGG同上。

2.微生信（https://www.bioinformatics.com.cn/）

（1）注冊(cè)登錄后，點(diǎn)擊“富集氣泡圖”。

（2）將上一步整理好的BP數(shù)據(jù)復(fù)制進(jìn)“繪圖數(shù)據(jù)”。

①調(diào)整“圖像大小”項(xiàng)下的“圖片寬度”為合適大小；

②在“圖標(biāo)題”處輸入“BP”；

③“X軸說(shuō)明”處輸入“GeneRatio”；

④“顏色”選項(xiàng)下選擇“顏色代表的p值進(jìn)行-log10轉(zhuǎn)化”，并選擇合適的顏色；

⑤“字體”選擇“Times New Roman”；

⑥點(diǎn)擊“提交”。

（3）點(diǎn)擊“PNG（300 dpi）”，下載保存即可，CC、MF、KEGG同上。