開發(fā)出的這種顯微鏡,可以準(zhǔn)確快速的識(shí)別:受瘧疾感染的紅細(xì)胞!

杜克大學(xué)工程師開發(fā)了一種顯微鏡,它可以調(diào)整其照明角度、顏色和圖案,同時(shí)自學(xué)完成給定診斷任務(wù)所需的最佳設(shè)置。在最初的概念驗(yàn)證研究中,顯微鏡同時(shí)開發(fā)了照明模式和分類系統(tǒng),使其能夠比訓(xùn)練有素的醫(yī)生和其他機(jī)器學(xué)習(xí)方法更準(zhǔn)確地快速識(shí)別受瘧疾寄生蟲感染的紅細(xì)胞。

其研究結(jié)果發(fā)表在《生物醫(yī)學(xué)光學(xué)快報(bào)》期刊上。杜克大學(xué)生物醫(yī)學(xué)工程助理教授Roarke Horstmeyer說:標(biāo)準(zhǔn)顯微鏡用來自四面八方相同數(shù)量的光照射樣本,數(shù)百年來,照明一直為人眼優(yōu)化。

但是計(jì)算機(jī)可以看到人類看不到的東西,因此不僅重新設(shè)計(jì)了硬件,提供了多種照明選擇,還允許顯微鏡為自己優(yōu)化照明。工程師們沒有從下方擴(kuò)散白光來均勻地照亮幻燈片,而是開發(fā)了一種碗狀光源,整個(gè)表面都嵌入了LED。這使得樣品可以用不同的顏色從不同角度照明到近90度,這實(shí)際上根據(jù)使用的LED圖案投射了樣品陰影和高亮顯示不同的特征。然后,研究人員向顯微鏡放入數(shù)百個(gè)瘧疾感染的紅細(xì)胞樣本,這些樣本作為薄涂片制備。

其中細(xì)胞體保持完整,理想情況下在顯微鏡載玻片上展開為單層,使用一種稱為卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的機(jī)器學(xué)習(xí)算法,顯微鏡學(xué)習(xí)樣本的哪些特征對于診斷瘧疾最重要,以及如何最好地突出這些特征。該算法最終落在來自相對較高角度不同顏色的環(huán)形LED圖案上,雖然產(chǎn)生的圖像比普通顯微鏡圖像更嘈雜,但它們在亮點(diǎn)中突出瘧疾寄生蟲,并且在大約90%的時(shí)間內(nèi)被正確分類。受過訓(xùn)練的醫(yī)生和其他機(jī)器學(xué)習(xí)算法通常以大約75%的準(zhǔn)確率執(zhí)行。

它挑選的圖案是環(huán)形的,具有不同顏色,這些顏色不均勻,不一定很明顯。盡管這些圖像比臨床醫(yī)生創(chuàng)建的圖像更暗、更吵,但算法說它會(huì)忍受噪音,它真的只是想讓寄生蟲高亮顯示,以幫助它做出診斷。然后將LED圖案和分類算法發(fā)送到另一位合作者的實(shí)驗(yàn)室,以查看結(jié)果是否可翻譯到不同的顯微鏡設(shè)置,另一個(gè)實(shí)驗(yàn)室也顯示出類似的成功。醫(yī)生必須檢查一千個(gè)細(xì)胞才能找到一種瘧疾寄生蟲,而且因?yàn)樗麄儽仨毞糯蟮饺绱私木嚯x,一次只能看十幾個(gè),所以大約需要10分鐘。

如果只需要看顯微鏡在幾秒鐘內(nèi)就已經(jīng)挑選出來的少數(shù)細(xì)胞,這將大大加快這個(gè)過程。顯微鏡適用于厚厚的血液涂片準(zhǔn)備,其中紅細(xì)胞形成高度不均勻的背景,可能會(huì)被分解。對于這個(gè)準(zhǔn)備,機(jī)器學(xué)習(xí)算法99%的時(shí)間是成功的。準(zhǔn)確度提高是可望的,因?yàn)闇y試的厚涂片比薄涂片染色更重,顯示出更高的對比度。但也需要更長的準(zhǔn)備時(shí)間,而且該項(xiàng)目是在資源匱乏的環(huán)境中減少診斷時(shí)間,在那里,訓(xùn)練有素的醫(yī)生很稀少,瓶頸是常態(tài)。有了這個(gè)初步的成功,研究人員正在繼續(xù)開發(fā)顯微鏡和機(jī)器學(xué)習(xí)算法。
博科園|研究/來自:杜克大學(xué)
參考期刊《生物醫(yī)學(xué)光學(xué)快報(bào)》
DOI: 10.1364/BOE.10.006351
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